[发明专利]HRM分析技术检测硫嘌呤个体化用药基因多态性的方法无效
申请号: | 201410274488.7 | 申请日: | 2014-06-19 |
公开(公告)号: | CN104032020A | 公开(公告)日: | 2014-09-10 |
发明(设计)人: | 傅咏南;张奕;毛丹丹;王校;卞雪莲;乐涵骏 | 申请(专利权)人: | 上海中优医药高科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200433 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | hrm 分析 技术 检测 嘌呤 个体化 用药 基因 多态性 方法 | ||
1.一种HRM分析技术检测硫嘌呤类药物个体化用药相关基因多态性的方法,其特征在于包括以下成分:(1)TPMT rs1142345基因座PCR扩增与测序引物,(2)TPMT rs1142345座PCR探针2对,(3)PCR扩增试剂,(4)阳性参照,(5)阴性参照。
2.根据权利1所述的检测方法,其特征在于:采用硅胶吸附法抽提被测者口腔上皮细胞/外周血细胞样本的基因组DNA,电泳凝胶成像法对DNA的浓度和纯度作检测,待测样本浓度标化到10ng/ul。
3.根据权利1所述的检测方法,其特征在于:采用在线软件Primer 3设计HRM引物,确定最佳引物为18-25bp大小,PCR产物长度80-150bp;相关引物信息如下:
TPMT rs1142345引物序列:
rs1142345-F GGTTGATGCTTTTGAAGAACG
rs1142345-R CCTCAAAAACATGTCAGTGTGA。
4.根据权利1所述的检测方法,其特征在于:在每一个PCR反应孔中依次加入Type-it HRM PCR Mix 7.5ul,正、反向引物溶液各0.5ul(10umol/L),检测样品2ul,用灭菌重蒸馏水补足15ul;在Rotor-Gene Q上进行反应,PCR反应条件为92-97℃变性5-15分钟,92-97℃变性10-30秒,57-65℃退火10-30秒,70-75℃延伸10-30秒,30-50个循环;HRM反应条件:92-97℃变性1分钟,40℃复性1分钟,初始熔解温度60-65℃开始程序升温熔解至95℃,过程中实时监测荧光信号,30-50次每秒。
5.根据权利1所述的检测方法,其特征在于:应用Rotor-Gene Q软件分析HRM结果,通过标准曲线基于曲线偏移(纯合子)和曲线形状变化(杂合子)展现不同的基因型;定义已知样本基因型后,软件会自动调出所有检测样本的基因型。
6.根据权利要求1所述检测方法的阴性参照,其特征在于:阴性参照的DNA浓度为10 ng/ul。
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