[发明专利]短链寡核苷酸甲醇固定花青素染色法在审

专利信息
申请号: 201410307331.X 申请日: 2014-06-30
公开(公告)号: CN104101528A 公开(公告)日: 2014-10-15
发明(设计)人: 李卫;张小龙 申请(专利权)人: 广西医科大学
主分类号: G01N1/30 分类号: G01N1/30;G01N27/447
代理公司: 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 代理人: 吴彦峰
地址: 530021 广*** 国省代码: 广西;45
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摘要:
搜索关键词: 寡核苷酸 甲醇 固定 花青素 染色
【权利要求书】:

1.短链寡核苷酸甲醇固定花青素染色法,其特征在于包括如下步骤:首先对寡核苷酸进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,随后用甲醇固定液将寡核苷酸固定在聚丙烯酰胺凝胶上,再用去离子水进行漂洗,然后用SDNAClear Nucleic Acids Stain Dye和SYBR Green II RNA gel stain两种花青素类核酸染料中的一种进行染色,最后用紫外透视仪或凝胶成像仪观察结果。

2.根据权利要求1所述的短链寡核苷酸甲醇固定花青素染色法,其特征在于:所述对寡核苷酸进行聚丙烯酰胺凝胶电泳的具体步骤为:

(1)准备样品:将寡核苷酸配制成100μM的溶液,然后在微量紫外分光光度计上测定其实际浓度;配制甲酰胺加样缓冲液,其配方为:960μl甲酰胺,40μl 250mmol/L EDTA(pH8.0),0.05%(w/v)溴酚蓝;

(2)制作浓度为15-45%(w/v)的变性聚丙烯酰胺凝胶:凝胶中丙烯酰胺与甲叉双丙烯酰胺之重量比为19/1,尿素的浓度为4-7M,凝胶的大小为10×10cm,厚度为0.3mm;凝胶和电泳槽缓冲液分别为1XTBE和0.5XTBE;

(3)变性处理:将1μg的寡核苷酸与2-3μl甲酰胺加样缓冲液混匀,于95℃变性30-60秒,迅速插入碎冰中,以破坏寡核苷酸的二级结构;

(4)电泳:将上述已变性的寡核苷酸加样于15-45%(w/v)的变性聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳,电压为200-600V,电泳时间为1-4.5小时,电泳温度为20-30℃。

3.根据权利要求2所述的短链寡核苷酸甲醇固定花青素染色法,其特征在于:所述将寡核苷酸固定是指将凝胶浸入甲醇固定液中,4-30℃浸泡1.5-2小时,甲醇固定液为含有10%(v/v)乙酸的50%(v/v)甲醇溶液,其用量为50ml/胶。

4.根据权利要求3所述的短链寡核苷酸甲醇固定花青素染色法,其特征在于:所述用SDNAClear Nucleic Acids Stain Dye染色是指将2μl SDNAClear Nucleic Acids Stain Dye加入10ml去离子水中,混匀后将凝胶充分浸入其中,不留气泡,常温下浸泡30-60分钟。

5.根据权利要求3所述的短链寡核苷酸甲醇固定花青素染色法,其特征在于:所述用SYBR Green II RNA gel stain染色是指将1μl 10000X的SYBR Green II RNA gel stain加入10ml去离子水中,混匀后将凝胶充分浸入其中,不留气泡,常温下浸泡30分钟。

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