[发明专利]短链寡核苷酸甲醇固定花青素染色法在审
申请号: | 201410307331.X | 申请日: | 2014-06-30 |
公开(公告)号: | CN104101528A | 公开(公告)日: | 2014-10-15 |
发明(设计)人: | 李卫;张小龙 | 申请(专利权)人: | 广西医科大学 |
主分类号: | G01N1/30 | 分类号: | G01N1/30;G01N27/447 |
代理公司: | 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 | 代理人: | 吴彦峰 |
地址: | 530021 广*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 寡核苷酸 甲醇 固定 花青素 染色 | ||
1.短链寡核苷酸甲醇固定花青素染色法,其特征在于包括如下步骤:首先对寡核苷酸进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,随后用甲醇固定液将寡核苷酸固定在聚丙烯酰胺凝胶上,再用去离子水进行漂洗,然后用SDNAClear Nucleic Acids Stain Dye和SYBR Green II RNA gel stain两种花青素类核酸染料中的一种进行染色,最后用紫外透视仪或凝胶成像仪观察结果。
2.根据权利要求1所述的短链寡核苷酸甲醇固定花青素染色法,其特征在于:所述对寡核苷酸进行聚丙烯酰胺凝胶电泳的具体步骤为:
(1)准备样品:将寡核苷酸配制成100μM的溶液,然后在微量紫外分光光度计上测定其实际浓度;配制甲酰胺加样缓冲液,其配方为:960μl甲酰胺,40μl 250mmol/L EDTA(pH8.0),0.05%(w/v)溴酚蓝;
(2)制作浓度为15-45%(w/v)的变性聚丙烯酰胺凝胶:凝胶中丙烯酰胺与甲叉双丙烯酰胺之重量比为19/1,尿素的浓度为4-7M,凝胶的大小为10×10cm,厚度为0.3mm;凝胶和电泳槽缓冲液分别为1XTBE和0.5XTBE;
(3)变性处理:将1μg的寡核苷酸与2-3μl甲酰胺加样缓冲液混匀,于95℃变性30-60秒,迅速插入碎冰中,以破坏寡核苷酸的二级结构;
(4)电泳:将上述已变性的寡核苷酸加样于15-45%(w/v)的变性聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳,电压为200-600V,电泳时间为1-4.5小时,电泳温度为20-30℃。
3.根据权利要求2所述的短链寡核苷酸甲醇固定花青素染色法,其特征在于:所述将寡核苷酸固定是指将凝胶浸入甲醇固定液中,4-30℃浸泡1.5-2小时,甲醇固定液为含有10%(v/v)乙酸的50%(v/v)甲醇溶液,其用量为50ml/胶。
4.根据权利要求3所述的短链寡核苷酸甲醇固定花青素染色法,其特征在于:所述用SDNAClear Nucleic Acids Stain Dye染色是指将2μl SDNAClear Nucleic Acids Stain Dye加入10ml去离子水中,混匀后将凝胶充分浸入其中,不留气泡,常温下浸泡30-60分钟。
5.根据权利要求3所述的短链寡核苷酸甲醇固定花青素染色法,其特征在于:所述用SYBR Green II RNA gel stain染色是指将1μl 10000X的SYBR Green II RNA gel stain加入10ml去离子水中,混匀后将凝胶充分浸入其中,不留气泡,常温下浸泡30分钟。
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