[发明专利]鳜鱼弹状病毒的检测试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201410315460.3 | 申请日: | 2014-07-02 |
公开(公告)号: | CN104032038A | 公开(公告)日: | 2014-09-10 |
发明(设计)人: | 雷燕;张会军;刘婉;王惠儒;张文文 | 申请(专利权)人: | 广州金水动物保健品有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
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地址: | 510510 广东省广州市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鳜鱼 弹状病毒 检测 试剂盒 方法 | ||
技术领域
本发明属于水产动物病原的检测与诊断技术领域,涉及一种鳜鱼弹状病毒的检测方法,特别是一种采用逆转录-聚合酶链式反应(简称RT-PCR)技术检测鳜鱼弹状病毒的方法。
背景技术
近年来,广东省的佛山、中山,山东的济宁以及湖北等地的乌鳢、鳜鱼、加州鲈鱼养殖场爆发大规模的流行性疾病,造成巨大的经济损失。实验室从细菌学和病毒学两方面对患病鱼进行检测分析,确认引起这些养殖鱼类暴发性死亡的疾病为弹状病毒病,其病原为鳜鱼弹状病毒(Siniperca chuatsi rhabdovirus,SCRV)。
弹状病毒(Rhabdovirus)是一种单股不分节段的负链RNA病毒,病毒粒子大小为(100-430)nm×(45-100)nm,形态似棒状或子弹状。弹状病毒种类较多,包括175种以上的成员,可感染脊椎动物、无脊椎动物及植物。鱼类弹状病毒因感染宿主广、毒株种类多、毒力强,严重危害各种淡水和海水鱼。迄今报道感染鱼类的弹状病毒已有二十多种,其中危害较大的有鲤春病毒血症病毒(SVCV)。病毒性出血性败血症病毒(VHSV)、传染性造血器官坏死病毒(IHNV)、牙鲆弹状病毒(HRV)和鳜鱼弹状病毒(SCRV)等。通过调查了解发现,自然感染鳜鱼弹状病毒的乌鳢、鳜鱼、加州鲈鱼死亡率高达90%。为了及早发现养殖鱼类是否被SCRV感染,有必要建立一种快速、准确、灵敏的检测方法。
传统病毒病的诊断需要进行病毒分离,细胞培养,电镜观察以及免疫检测等方法,缺乏对病毒进行快速、准确、敏感的检测方法。PCR方法具有操作简单、特异、快速、敏感等优点,正逐步应用于病原微生物的检测与研究中。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是,克服现有技术的不足,提供一种鳜鱼弹状病毒的逆转录-聚合酶链式反应检测方法,能快速、高效地用于鳜鱼弹状病毒的检测。
鳜鱼弹状病毒的逆转录-聚合酶链式反应检测试剂盒,所述试剂盒包括:
(1)5×逆转录缓冲液100μL;
(2)逆转录酶25μL;
(3)随机引物25μL;
(4)2×聚合酶链式反应混合缓冲液1.0mL,包含以下成分:
(5)检测引物的设计合成:根据GenBank中发布的鳜鱼弹状病毒的基因序列,在其保守序列设计一对特异性检测引物,上游引物P1:5’-ATAAGGGTAGTTGAGAAGAAG-3’,下游引物P2:5’-CTTCTTGTTGCTCTTCTTAAA-3’,浓度为10μM;
(6)Taq酶 5U/μL;
(7)灭菌的ddH2O 1.0mL;
(8)阳性对照液:提取鳜鱼弹状病毒总RNA,逆转录获得cDNA,然后以cDNA为模板,以Pl、P2为引物,进行PCR扩增,将回收纯化的扩增产物连接到pMD18-T载体,以阳性克隆的重组质粒作为阳性对照;
(9)阴性对照液:以ddH2O作为阴性对照。
采用试剂盒检测鳜鱼弹状病毒的方法为:
(1)待测样品RNA的提取:解剖待检测的鱼样品,取肝、脾、肾等组织进行匀浆,采用传统的Trizol法或者商业化的RNA提取试剂盒提取RNA,用ddH2O溶解,即为试验用RNA模板;
(2)逆转录合成cDNA:取待测样品的RNA模板7μL,加入PCR反应管中,再加入5×逆转录缓冲液2μL、逆转录酶0.5μL、随机引物0.5μL,反应总体积10μL,充分混匀后,置于PCR仪上,37℃15min逆转录反应,85℃5sec灭活逆转录,得到cDNA产物;
(3)PCR扩增:采用25μL的PCR反应体系,在0.2mL PCR反应管内分别加入2×反应混合缓冲液12.5μL,上游引物P1、下游引物P2各0.5μL,5U/μL Taq DNA聚合酶0.5μL,cDNA模板3.0μL,用灭菌超纯水加至总体积,同时分别用阳性对照液和阴性对照液作为模板,设置阳性和阴性对照组,混合均匀后离心数秒进行PCR反应,反应程序为:94℃预变性5分钟;然后94℃变性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸30秒,共循环35次;72℃延伸10分钟,最后4℃保存;
(4)PCR扩增产物的检测:PCR反应结束后,取10μL产物在1.5%琼脂糖凝胶(含溴化乙锭0.5μg/mL)上,使用TAE缓冲液进行电泳,在紫外透射仪下观察PCR产物,检查PCR产物的预期大小;
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