[发明专利]1型糖尿病易感位点rs231775的检测方法及试剂盒在审
申请号: | 201410331380.7 | 申请日: | 2014-07-10 |
公开(公告)号: | CN104059989A | 公开(公告)日: | 2014-09-24 |
发明(设计)人: | 黄迅威;张天竹;沈玲宇;邵敏华 | 申请(专利权)人: | 光瀚健康咨询管理(上海)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200000 上海市崇明县*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 糖尿病 易感位点 rs231775 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种1型糖尿病易感位点的检测方法,其特征在于:包括步骤:
(1)提取样品的基因组DNA,扩增样品的细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4(CTLA-4)基因外显子中包含rs231775位点的区域,得到扩增产物;和
(2)使用高分辨熔解曲线(high-resolution melt,HRM)分析技术检测扩增产物中单核苷酸多态性(SNP)位点的基因型。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于:CTLA-4基因的rs231775位点的基因型带有GG时,该CTLA-4基因所属样品的测试者对于1型糖尿病的易感性高于基因型未带有GG的测试者。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于:使用特异性引物扩增样品的CTLA-4基因外显子中包含rs231775位点的区域,该特异性引物是指针对CTLA-4基因上rs231775号SNP位点而设计,能特异性扩增出包含上述SNP位点的DNA片段的引物对。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于:所述特异性引物具有SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列。
5.如权利要求3所述的方法,其特征在于:使用HRM分析技术直接检测扩增后包含上述SNP位点的DNA片段的引物对的基因型。
6.如权利要求3所述的方法,其特征在于:将扩增后包含上述SNP位点的DNA片段的引物对转移至分析装置,然后使用HRM分析技术对该引物对的基因型进行分析。
7.一种用于检测1型糖尿病易位点的试剂盒,其特征在于:对CTLA-4基因外显子中包含rs231775号位点的区域进行扩增及HRM技术分析。
8.如权利要求7所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括特异性扩增CTLA-4基因外显子中包含rs231775位点的区域的特异性引物。
9.如权利要求8所述的试剂盒,其特征在于:所述特异性引物具有SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列。
10.如权利要求9所述的试剂盒,其特征在于:试剂盒的组分及含量包括5ul2X LightCycler480High Resolution Melting Master Mix、1.2ul25mM MgCl2溶液、1ul2μM Primer Mix、1ul5ng/μl左右DNA、1.8ul H2O、具有SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列的特异性引物。
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