[发明专利]香樟低温诱导CBF-like转录因子及其编码蛋白、克隆方法和应用在审
申请号: | 201410346982.X | 申请日: | 2014-07-21 |
公开(公告)号: | CN104130320A | 公开(公告)日: | 2014-11-05 |
发明(设计)人: | 杜丽;李勇鹏;姚瑶;张力维 | 申请(专利权)人: | 南阳师范学院 |
主分类号: | C07K14/415 | 分类号: | C07K14/415;C12N15/29;C12N15/10;C12N15/82;A01H5/00 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 汤东凤 |
地址: | 473000 河南*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 香樟 低温 诱导 cbf like 转录 因子 及其 编码 蛋白 克隆 方法 应用 | ||
1.一种香樟低温诱导CBF-like转录因子,其特征在于,包括香樟低温诱导CBF-like转录因子a(CcCBFa基因)和香樟低温诱导CBF-like转录因子b(CcCBFb基因),所述香樟低温诱导CBF-like转录因子a的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述香樟低温诱导CBF-like转录因子b的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.一种香樟低温诱导CBF-like转录因子的编码蛋白,其特征在于,包括香樟低温诱导CBF-like转录因子a编码蛋白和香樟低温诱导CBF-like转录因子b编码蛋白,所述香樟低温诱导CBF-like转录因子a编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述香樟低温诱导CBF-like转录因子b编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。
3.一种香樟低温诱导CBF-like转录因子的克隆方法,其特征在于,具体按照以下步骤实施:
步骤1、香樟总RNA的提取;采用EASY spin Plus植物RNA快速提取试剂盒提取香樟总RNA,所提RNA加入30-50ul DEPC处理水,充分溶解后于-80℃保存;
步骤2、反转录PCR;
步骤3、香樟CBF基因的3’/5’RACE克隆,并用1%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物;
其中,香樟CBF基因的3’/5’RACE克隆的反应条件为:
UPM=UPL(10uM)2ul+UPS(10uM)10ul+ddH2O38ul
a).反应体系为50ul:
b).反应条件:
94℃预变性4min;5个循环;30个循环;72℃总延伸10min;
分别取上述PCR产物1ul溶于49ulddH2O中,充分溶解混匀,做巢式PCR的模板(Template);
c).3’/5’RACE的巢式PCR扩增,反应体系为50ul:
d).巢式PCR反应条件:
94℃预变性4min;35个循环;72℃总延伸10min;
步骤4、PCR产物的胶回收,具体为:琼脂糖凝胶电泳结束后,紫外灯下切下目的条带,用琼脂糖凝胶纯化回收试剂盒进行回收;
步骤5、PCR产物的克隆,A-T克隆;
步骤5.1、回收的目的产物与TaKaRa公司生产的pMD19-TVector16℃连接过夜,反应体系如下:
步骤5.2、大肠杆菌感受态细胞的转化
将上述连接产物加于50ul Trans5α大肠杆菌感受态细胞中,轻轻混匀,冰浴30min,42℃热激90s,冰浴5min,缓慢加入400ul新鲜液体LB,37℃,180rpm50min,吸取100ul菌液涂于添加有Amp100mg/L的LB平板上,置于37℃恒温培养箱中,倒置过夜培养12-16h;
步骤6、阳性重组子的筛选及鉴定;随机挑取上述转化平板中的阳性菌以pMD19-T载体通用引物M13上、下游引物进行菌落PCR,将PCR扩增产物置于1.0%琼脂糖凝胶电泳检测,将检测正确的阳性菌接种于1ml添加有Amp100mg/L的液体LB中摇菌培养,送往生工生物工程(上海)股份有限公司测序,将测序结果进行拼接,从而获得2个香樟CBF-like基因的全长cDNA(CcCBFa和CcCBFb)序列,其核苷酸序列分别为:SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2;
步骤7、对步骤6中的香樟低温诱导CBF-like转录因子a和香樟低温诱导CBF-like转录因子b使用DNAman分子软件分析,得香樟低温诱导CBF-like转录因子a编码蛋白序列和香樟低温诱导CBF-like转录因子b编码蛋白序列,其氨基酸序列分别为:SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4。
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