[发明专利]基于DNA条形码的鉴别赤链蛇的引物及PCR-RFLP方法和试剂盒无效
申请号: | 201410347839.2 | 申请日: | 2014-07-21 |
公开(公告)号: | CN104164493A | 公开(公告)日: | 2014-11-26 |
发明(设计)人: | 晁志;李晓蕾;曾伟萍 | 申请(专利权)人: | 南方医科大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 | 代理人: | 董红曼 |
地址: | 510515 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 dna 条形码 鉴别 赤链蛇 引物 pcr rflp 方法 试剂盒 | ||
1.用于鉴别赤链蛇的PCR扩增引物,其特征在于,所述引物序列为:
DK1-CO1:5’-CAACTAACCACAAAGACATCGG-3’;
DK1-CO2:5’-CTTCTGGGTGGCCGAAAAATCA-3’。
2.一种鉴定赤链蛇的PCR-RFLP方法,其特征在于,用能够识别赤链蛇特征DNA碱基序列的限制性内切酶APaL I对纯化后的PCR产物进行消化,形成琼脂糖凝胶电泳的特征图谱;赤链蛇特征DNA碱基序列为:5’-GTGCAC-3’,其位于COI序列第362位至367位;所述鉴定方法包括以下步骤:
1)样品DNA的提取;
2)扩增DNA片段:利用权利要求1所述的引物进行聚合酶链反应,得到聚合酶链反应扩增产物,所述PCR反应参数包括:93℃预变性5min,55℃2min;93℃变性30s,55℃复性45s,70℃延伸45s,35个循环;70℃延伸5min;
3)琼脂糖凝胶电泳检测,纯化PCR产物;
4)所述PCR纯化产物中加入限制性内切酶APaL I进行酶切,所述限制性内切酶APaL I的酶切位点为:G^TGCAC;
5)琼脂糖凝胶电泳分析;
6)鉴定结果的判断:若在所述电泳产物中检测到分子量为362bp和296bp的两条片段,则待测样品为赤链蛇;若未出现上述两条片段,则待测样本非赤链蛇。
3.一种用于鉴别赤链蛇的PCR-RFLP检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:10μM引物DK1-CO1;10μM引物DK1-CO2;2×Taq DNA聚合酶混合缓冲液,其包括:0.1U/μL Taq DNA聚合酶,dATP、dTTP、dCTP及dGTP各500μM,20μM Tris-HCl、pH8.3,100μM KCl,3μM MgCl2;10U/μL ApaL I酶;酶切缓冲液;终止缓冲液;灭菌双蒸水。
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