[发明专利]甲型流感病毒亚型基因型定型的方法有效
申请号: | 201410354092.3 | 申请日: | 2014-07-24 |
公开(公告)号: | CN104178583B | 公开(公告)日: | 2017-01-18 |
发明(设计)人: | 邓涛 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院病原生物学研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司11002 | 代理人: | 王文君 |
地址: | 100176 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 流感病毒 基因型 定型 方法 | ||
1.一种甲型流感病毒亚型基因型定型的方法,其特征在于,利用甲型流感病毒HA和NA基因片段特异性的非编码序列在5′和3′端同时具有亚型特异性,对甲型流感病毒亚型基因型进行定型。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述亚型特异性在于:不同亚型的HA和NA基因在5′和3′端的非编码序列长度存在差异。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述亚型特异性在于:不同亚型的HA和NA基因在5′和3′端的非编码序列的核苷酸序列存在差异。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法具体包括如下步骤:
1)分析NCBI流感病毒数据库中所有甲型流感病毒的5′和3′端非编码区,构建HA和NA基因亚型特异性非编码序列的特征图谱;
2)测定样品的HA和NA基因非编码序列,与步骤1)得到的特征图谱进行比对,根据特征图谱中不同亚型非编码序列的长度特征和核苷酸序列特征判断样品的亚型基因型。
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