[发明专利]一种区分蕨麻和鹅绒委陵菜的方法有效

专利信息
申请号: 201410380396.7 申请日: 2014-08-04
公开(公告)号: CN104099426A 公开(公告)日: 2014-10-15
发明(设计)人: 李军乔;富贵;白世俊;韦梅琴;包锦渊;闫淑艳 申请(专利权)人: 青海民族大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 深圳冠华专利事务所(普通合伙) 44267 代理人: 诸兰芬
地址: 810000 青海省西宁市八*** 国省代码: 青海;63
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摘要:
搜索关键词: 一种 区分 鹅绒 委陵菜 方法
【权利要求书】:

1.一种区分蕨麻和鹅绒委陵菜的方法,其特征在于,包括如下步骤:

a.提取样品DNA溶液:采用快捷型植物基因组DNA提取试剂盒进行DNA提取,得到样品DNA溶液;

b.获取样品DNA条形码序列:以步骤a提取的DNA溶液为模板,按照预定的PCR体系在预定的循环程序下,ITS序列采用正向引物

(5'-CGTAACAAGGTTTCCGTAGGT-3')和反向引物

(5'-TGGTTCACGGGATTCTGC-3')进行PCR扩增;Trn-L序列采用正向引物

(5'-CGAAATCGGTAGACGCTACG-3'),和反向引物

(5'-GGGGATAGAGGGACTTGAAC-3')进行PCR扩增;Matk序列采用采用正向引物(5'-TAATTTACGATCAATTCATTC-3')和反向引物

(5'-GTTCTAGCACAAGAAAGTCG-3')进行PCR扩增,即得到样品的DNA条形码序列;将PCR扩增产物采用1.5%琼脂糖凝胶电泳分离,目标条带回收,进行测序,将测序所得到的ABI序列文件用DNAMAN软件进行拼接和人工校正,得到ITS、Trn-L和Matk的核苷酸序列;

c.将样品的ITS、Trn-L和Matk的核苷酸序列与参照序列进行对比,判别样品所属。

2.根据权利要求1所述的一种区分蕨麻和鹅绒委陵菜的方法,其特征在于,所述步骤b的PCR体系为:

3.根据权利要求1所述的一种区分蕨麻和鹅绒委陵菜的方法,其特征在于,所述步骤b的循环程序为:①95℃预变性5min;②95℃变性30s,55/50℃复性30s(ITS/Trn基因扩增采用55℃,MatK基因采用50℃),72℃延伸45s,30个循环;③72℃延伸10min。产物4℃冰箱短期保存或-20℃冰箱长期保存。4.根据权利要求1所述的一种区分蕨麻和鹅绒委陵菜的方法,其特征在于,在步骤b前还包括DNA质量和浓度检测步骤b0

取2μL DNA溶液,加入2μL 6×Loading buffer和6μL ddH2O混匀,上样;电泳缓冲液1×TBE、1%琼脂糖凝胶上进行电泳检测,电泳结束后,在凝胶成像分析系统上,观察、拍照;

将待检样本总DNA溶液,按一定的比例稀释,用UV-2800紫外分光光度计,测定样本总DNA在紫外波长为260和280nm处的吸收值;依据OD260和OD280值,判断待检样本总DNA的纯度;待检样本总DNA的纯度(μg·mL-1)=OD260/0.02×L×稀释倍数=OD260×50μg·mL-1×稀释倍数,其中L为比色皿光经1cm,OD260为260nm波长处的光吸收值,0.02为每mL溶液内含有1μg DNA钠盐时的光吸收值。

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