[发明专利]转基因玉米98140结构特异定量PCR精准检测的引物和探针及方法有效

专利信息
申请号: 201410394511.6 申请日: 2014-08-12
公开(公告)号: CN104131106A 公开(公告)日: 2014-11-05
发明(设计)人: 张富丽;宋君;尹全;常丽娟;刘文娟;王东;雷绍荣 申请(专利权)人: 四川省农业科学院分析测试中心
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 成都顶峰专利事务所(普通合伙) 51224 代理人: 杨俊华
地址: 610000 四*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 转基因 玉米 98140 结构 特异 定量 pcr 精准 检测 引物 探针 方法
【权利要求书】:

1.转基因玉米98140结构特异性定量PCR精准检测的引物和探针,其特征在于,

用于检测pinⅡ终止子与zm-hra gene相连位置的引物和探针如下:

上游引物序列,zm-F:5'-TGGCCAATCCAGAAGATGGA-3';

下游引物序列,zm-R:5'-TGGTGATGGCAGGACTGTGT-3';

荧光探针序列,zm-P:5'-FAM-AAGTCTAGGTTAACTGACTAGC-TAMRA-3';

用于检测Gate4621gene与pinⅡ终止子相接处的引物和探针如下:

上游引物序列,gat-F:5'-TTGGGATTCAGTGAGCAAGGA-3';

下游引物序列,gat-R:5'-CCAATCCAGAAGATGGACAAGTCT-3';

荧光探针序列,gat-P:5'-FAM-AGGTGTTCGATACTCCTCCAGTTGGACCTC-TAMRA-3'。

2. 转基因玉米98140结构特异性定量PCR精准检测方法,其特征在于,包括以下步骤:检测pinⅡ终止子与zm-hra gene相连位置:

(a1)合成以下引物及与引物配合使用的荧光探针,

上游引物序列,zm-F:5'-TGGCCAATCCAGAAGATGGA-3'

下游引物序列,zm-R:5'-TGGTGATGGCAGGACTGTGT-3'

荧光探针序列,zm-P:5'-FAM-AAGTCTAGGTTAACTGACTAGC-TAMRA-3';

(a2)制备98140品系的DNA稀释液;

(a3)配制PCR反应体系;

(a4)定量PCR检测。

3. 根据权利要求2所述的转基因玉米98140结构特异性定量PCR精准检测方法,其特征在于,检测Gate4621gene与pinⅡ终止子相接处:

(b1)合成以下引物及与引物配合使用的荧光探针,

上游引物序列,gat-F:5'-TTGGGATTCAGTGAGCAAGGA-3'

下游引物序列,gat-R:5'-CCAATCCAGAAGATGGACAAGTCT-3'

荧光探针序列,gat-P:5'-FAM-AGGTGTTCGATACTCCTCCAGTTGGACCTC-TAMRA-3';

(b2)制备98140品系的DNA稀释液;

(b3)配制PCR反应体系;

(b4)定量PCR检测。

4. 根据权利要求3所述的转基因玉米98140结构特异性定量PCR精准检测方法,其特征在于,步骤(a1)和(b1)中合成的引物及荧光探针的浓度均为10μmol/l,步骤(a2)和(b2)中制备的DNA稀释液的浓度为50ng/μl。

5. 根据权利要求4所述的转基因玉米98140结构特异定量PCR精准检测方法,其特征在于,步骤(a3)和(b3)中所述的配制PCR反应体系,即将DNA稀释液加入到20μl反应体系中,所述20μl的反应体系包括以下组分:

Taqman Master mix(2×)                 10μl

上游引物                                 1μl

下游引物                                 1μl

荧光探针                                 0.5μl

DNA稀释液                               3.0μl

50 ROX                                   0.4μl

水                                       4.1μl。

6. 根据权利要求3或5所述的转基因玉米98140结构特异性定量PCR精准检测方法,其特征在于,所述PCR反应条件为:95℃预变性10min,1个循环;95℃变性15s,57℃退火60s,45个循环。

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