[发明专利]转基因玉米98140结构特异定量PCR精准检测的引物和探针及方法有效
申请号: | 201410394511.6 | 申请日: | 2014-08-12 |
公开(公告)号: | CN104131106A | 公开(公告)日: | 2014-11-05 |
发明(设计)人: | 张富丽;宋君;尹全;常丽娟;刘文娟;王东;雷绍荣 | 申请(专利权)人: | 四川省农业科学院分析测试中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 成都顶峰专利事务所(普通合伙) 51224 | 代理人: | 杨俊华 |
地址: | 610000 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 转基因 玉米 98140 结构 特异 定量 pcr 精准 检测 引物 探针 方法 | ||
1.转基因玉米98140结构特异性定量PCR精准检测的引物和探针,其特征在于,
用于检测pinⅡ终止子与zm-hra gene相连位置的引物和探针如下:
上游引物序列,zm-F:5'-TGGCCAATCCAGAAGATGGA-3';
下游引物序列,zm-R:5'-TGGTGATGGCAGGACTGTGT-3';
荧光探针序列,zm-P:5'-FAM-AAGTCTAGGTTAACTGACTAGC-TAMRA-3';
用于检测Gate4621gene与pinⅡ终止子相接处的引物和探针如下:
上游引物序列,gat-F:5'-TTGGGATTCAGTGAGCAAGGA-3';
下游引物序列,gat-R:5'-CCAATCCAGAAGATGGACAAGTCT-3';
荧光探针序列,gat-P:5'-FAM-AGGTGTTCGATACTCCTCCAGTTGGACCTC-TAMRA-3'。
2. 转基因玉米98140结构特异性定量PCR精准检测方法,其特征在于,包括以下步骤:检测pinⅡ终止子与zm-hra gene相连位置:
(a1)合成以下引物及与引物配合使用的荧光探针,
上游引物序列,zm-F:5'-TGGCCAATCCAGAAGATGGA-3'
下游引物序列,zm-R:5'-TGGTGATGGCAGGACTGTGT-3'
荧光探针序列,zm-P:5'-FAM-AAGTCTAGGTTAACTGACTAGC-TAMRA-3';
(a2)制备98140品系的DNA稀释液;
(a3)配制PCR反应体系;
(a4)定量PCR检测。
3. 根据权利要求2所述的转基因玉米98140结构特异性定量PCR精准检测方法,其特征在于,检测Gate4621gene与pinⅡ终止子相接处:
(b1)合成以下引物及与引物配合使用的荧光探针,
上游引物序列,gat-F:5'-TTGGGATTCAGTGAGCAAGGA-3'
下游引物序列,gat-R:5'-CCAATCCAGAAGATGGACAAGTCT-3'
荧光探针序列,gat-P:5'-FAM-AGGTGTTCGATACTCCTCCAGTTGGACCTC-TAMRA-3';
(b2)制备98140品系的DNA稀释液;
(b3)配制PCR反应体系;
(b4)定量PCR检测。
4. 根据权利要求3所述的转基因玉米98140结构特异性定量PCR精准检测方法,其特征在于,步骤(a1)和(b1)中合成的引物及荧光探针的浓度均为10μmol/l,步骤(a2)和(b2)中制备的DNA稀释液的浓度为50ng/μl。
5. 根据权利要求4所述的转基因玉米98140结构特异定量PCR精准检测方法,其特征在于,步骤(a3)和(b3)中所述的配制PCR反应体系,即将DNA稀释液加入到20μl反应体系中,所述20μl的反应体系包括以下组分:
Taqman Master mix(2×) 10μl
上游引物 1μl
下游引物 1μl
荧光探针 0.5μl
DNA稀释液 3.0μl
50 ROX 0.4μl
水 4.1μl。
6. 根据权利要求3或5所述的转基因玉米98140结构特异性定量PCR精准检测方法,其特征在于,所述PCR反应条件为:95℃预变性10min,1个循环;95℃变性15s,57℃退火60s,45个循环。
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