[发明专利]实时PCR检测单核苷酸多态性的方法及其应用在审
申请号: | 201410397469.3 | 申请日: | 2014-08-13 |
公开(公告)号: | CN104164506A | 公开(公告)日: | 2014-11-26 |
发明(设计)人: | 罗晓腾;郭永超;廖玉声 | 申请(专利权)人: | 深圳联合医学科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 深圳中一专利商标事务所 44237 | 代理人: | 张全文 |
地址: | 518000 广东省深圳市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 实时 pcr 检测 核苷酸 多态性 方法 及其 应用 | ||
1.一种实时PCR检测单核苷酸多态性的方法,其特征在于,PCR过程中包括的聚合酶和荧光探针如下:
所述聚合酶为具有瓣状核酸内切酶活性的聚合酶;
所述荧光探针的5’端修饰有第一荧光基团、3’端修饰第二荧光基团;且所述荧光探针具有与待测核酸中单核苷酸多态性位点的碱基互补的对应碱基,所述对应碱基沿5’往3’方向的下一个碱基上标记有淬灭基团;
所述荧光探针的5’端至所述对应碱基的序列与待测核酸非互补。
2.如权利要求1所述的实时PCR检测单核苷酸多态性的方法,其特征在于,所述第一荧光基团与第二荧光基团的荧光类型不同。
3.如权利要求1或2所述的实时PCR检测单核苷酸多态性的方法,其特征在于,所述第一荧光基团为FAM。
4.如权利要求1或2所述的实时PCR检测单核苷酸多态性的方法,其特征在于,所述第二荧光基团为VIC或HEX。
5.如权利要求1或2所述的实时PCR检测单核苷酸多态性的方法,其特征在于,所述淬灭基团为BHQ。
6.如权利要求1至5任一项所述的实时PCR检测单核苷酸多态性的方法在CYP2C19*2型位于第5外显子G681A(rs4244285)的多态性分析中的应用。
7.如权利要求6所述的实时PCR检测单核苷酸多态性的方法在CYP2C19*2型位于第5外显子G681A(rs4244285)的多态性分析中的应用,其特征在于,所述荧光探针为FAM-GAGAGAGG(*BHQ)GAACCCATAACAAATTAC-VIC。
8.如权利要求6或7所述的实时PCR检测单核苷酸多态性的方法在CYP2C19*2型位于第5外显子G681A(rs4244285)的多态性分析中的应用,其特征在于,
所述上游引物为5’-CTTAGATATGCAATAATTTTCCCAC-3’;
所述下游引物为5’-CCAAAATATCACTTTCCATAAAAGC-3’。
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