[发明专利]一种快速鉴定油葵新葵19号品种纯度的试剂盒有效
申请号: | 201410434784.9 | 申请日: | 2014-08-29 |
公开(公告)号: | CN104164513A | 公开(公告)日: | 2014-11-26 |
发明(设计)人: | 段维;杨涛;王沛政;朱文彬;刘文杰;李晓雷;卫泽 | 申请(专利权)人: | 新疆康地种业科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 830011 新疆维吾尔自治*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 鉴定 油葵新葵 19 品种 纯度 试剂盒 | ||
1.一种能够同时鉴定区分新葵19号父本、母本和杂交种的试剂盒, 其特征在于,所述试剂盒包括油葵SSR标记, PCR扩增反应各组分的优化组合和扩增试剂盒,以及扩增条带的显色程序;以商品油葵品种新葵19号及其双亲的DNA为模板,进行大量SSR引物分子标记的筛选和重复,获得了鉴定出能够同时区分父本、母本和杂交种的引物标记399和425,具体阐述如下:
(1)油葵DNA快速提取试剂盒A配置:50mmol/L Tris-HCl pH8,0.7 mmol/L NaCl,10 mmol/L EDTA, pH8,1% CTAB,20mmol/L 2-巯基乙醇;
(2)PCR扩增反应试剂盒B配置:5×反应缓冲液4ul,25mmol/L MgCl2溶液2ul,0.1mmol/L dNTPs溶液3ul,1umol/L Primer溶液3ul,SSR引物标记399和425,5u Taq DNA聚合酶0.2ul;
1-5ng模板DNA;反应总体积为20ul,扩增程序为95℃变性2min,94℃变性45s、57℃退火45s、72℃延伸60s,共30个循环;72℃延伸8min;
引物标记399:
左序列CGTACGGTGTAGTTCTCATGGT;
右序列GGATCACGTGGCGTTCTATT);
引物标记425:
左序列CAAAATACCCAGGTCAAAGCA;
右序列CCTAGCTTATGGGACGTATGGA;
加样缓冲液配试剂盒C配置:0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青,40克蔗糖定容至100ml。
2.一种快速鉴定油葵新葵19号品种纯度的方法,其特征在于,具体鉴定方法步骤如下:
(1)油葵DNA快速提取试剂含50mmol/L Tris-HCl pH8,0.7 mmol/L NaCl,10 mmol/L EDTA, pH8,1% CTAB,20mmol/L 2-巯基乙醇;
(2)PCR扩增反应试剂含5×反应缓冲液4ul,25mmol/L MgCl2溶液2ul,0.1mmol/L dNTPs溶液3ul,1umol/L Primer溶液3ul(SSR引物标记399和425),5u Taq DNA聚合酶0.2ul, 1-5ng模板DNA;反应总体积为20ul,扩增程序为95℃变性2min,94℃变性45s、57℃退火45s、72℃延伸60s,共30个循环;72℃延伸8min;
(3)胶板的制备:扩增产物经非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,凝胶浓度10%,待凝胶冷却凝固后,垂直轻拔梳子;电泳缓冲液为1×TBE,使电泳缓冲液液面刚高出凝胶面,恒压电泳;
(4)电泳、观察和拍照:取4ml上述步骤(2)PCR扩增反应液加样缓冲液1ml,含如下成分:0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青,40克蔗糖定容至100ml;加样后的凝胶板立即通电进行电泳,当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1cm处时,停止电泳;电泳完毕,取出凝胶;凝胶用蒸馏水稍冲洗后,按照以下程序进行银染:固定采用10%乙醇、0.5%冰乙酸20min;银染采用0.2%硝酸银水溶液12min;蒸馏水漂洗两次;0.002%(w/v)硫代硫酸钠的水溶液漂洗;1.5%氢氧化钠、0.4%甲醛显色适度;在白色灯下DNA存在处显示出肉眼可辨的条带,于凝胶成像系统中拍照并保存之;
(5)上述步骤以商品油葵品种新葵19号及其双亲的DNA为模板,进行了约100对SSR物分子标记的筛选和重复,获得了鉴定出能够同时区分父本、母本和杂交种的SSR引物标记399和425。
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