[发明专利]一种大批量开发苎麻基因组SNP标记的方法及其开发的引物有效
| 申请号： | 201410450212.X | 申请日： | 2014-09-05 |
| 公开（公告）号： | CN104212898A | 公开（公告）日： | 2014-12-17 |
| 发明（设计）人： | 陈建华;栾明宝;王晓飞;许英;孙志民;刘晨晨 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院麻类研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司： | 长沙市融智专利事务所 43114 | 代理人： | 袁靖 |
| 地址： | 410205 湖*** | 国省代码： | 湖南;43 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 大批量 开发 苎麻 基因组 snp 标记 方法 及其 引物 | ||
1.一种大批量开发苎麻基因组SNP标记的方法，其特征在于，具体包括如下步骤：
(1)提取2个苎麻品种的DNA；
(2)将苎麻基因组DNA酶切为小片段；
(3)对酶切后获取的小片段进行测序，获得2个品种的SLAF标签；
(4)在步骤(3)获得的2个苎麻品种的SLAF标签中，搜寻具有SNP多态性的SLAF标签；
(5)对搜寻到的SLAF标签序列进行引物设计，经扩增测序检测，得到的引物即为基因组SNP标记。
2.根据权利要求1所述的大批量开发苎麻基因组SNP标记的方法，其特征在于，步骤(2)中采用RsaI酶对苎麻基因组进行酶切。
3.根据权利要求2所述的大批量开发苎麻基因组SNP标记的方法，其特征在于，酶切后获取长度为214-314bp的片段。
4.根据权利要求1所述的大批量开发苎麻基因组SNP标记的方法，其特征在于，步骤(4)中根据等位基因数和基因序列之间的差异进行多态性分析，搜寻具有SNP多态性的SLAF标签。
5.根据权利要求1所述的大批量开发苎麻基因组SNP标记的方法，其特征在于，步骤(5)的引物设计参数：扩增产物长度在100-180bp，引物长度在18-25bp。
6.根据权利要求1或2或3或4或5所述的大批量开发苎麻基因组SNP标记的方法，其特征在于，设计并经扩增测序检测的10对基因组SNP引物序列如下：
7.用于苎麻基因组SNP标记的引物，其特征在于，10对基因组SNP标记引物序列如下：
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国农业科学院麻类研究所，未经中国农业科学院麻类研究所许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201410450212.X/1.html，转载请声明来源钻瓜专利网。
