[发明专利]香蕉细菌性枯萎病菌滚环扩增检测方法有效
申请号: | 201410450393.6 | 申请日: | 2014-09-05 |
公开(公告)号: | CN104232767A | 公开(公告)日: | 2014-12-24 |
发明(设计)人: | 王念武;翁瑞泉;陈劲松;吴金枝;于文涛 | 申请(专利权)人: | 中华人民共和国福清出入境检验检疫局 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/01 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 卢镇华 |
地址: | 350300 福建*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 香蕉 细菌性 枯萎 病菌 扩增 检测 方法 | ||
1.一种香蕉细菌性枯萎病菌滚环扩增检测方法,其特征在于:步骤如下:首先设计锁式探针和其扩增引物,然后经过环化连接、消化反应,再用滚环扩增引物进行超分支滚环扩增;阳性菌琼脂凝胶电泳后,会出现典型的阶梯状的条带,从而达到检测的目的;
所述锁式探针和引物的核苷酸序列如下:
锁式探针:
Padlock-Prs2:5'-AACACACAGTTGCTCGCACTGGCCGAGTGGAACCGAGGAAATAGAGAACCCCATCCAGCACTTCCCTATGTCTCTCCCGTATGGTTTCTTGGCCAGCACCGATGG-3';
滚环扩增引物如下:
PadR:5'-CCATCCAGCACTTCCCTATGTCT- 3',;
PadF:5'-GGTTCTCTATTTCCTCGGTTCCAC- 3'。
2.根据权利要求1所述的香蕉细菌性枯萎病菌滚环扩增检测方法,其特征在于:所述环化连接的反应体系为10μL:10×Taq DNA连接酶缓冲液1μL,40U/μL的Taq DNA连接酶0.15μL,500pmol/L锁式探针0.2μL,DNA模板2μL,Sterilized ddH2O补足至10μL,采用热循环连接法连接:94℃ 4 min; 94℃30s,65℃5min,15个循环;95℃ 15min灭活Taq DNA连接酶,反应结束后立即将反应管冰浴5min。
3.根据权利要求1所述的香蕉细菌性枯萎病菌滚环扩增检测方法,其特征在于:所述消化反应的条件如下:向冰浴后的反应管中加入10μL的混合液:10×核酸外切酶I缓冲液2μL;5U/μL的核酸外切酶I 1.5μL;10×核酸外切酶Ⅲ缓冲液2μL; 5U/μL的核酸外切酶Ⅲ 1 μL;Sterilized ddH2O补足至10μL,37℃反应2 h,再于95℃反应3h。
4.根据权利要求1所述的香蕉细菌性枯萎病菌滚环扩增检测方法,其特征在于:超分支滚环扩增反应体系为25μL:10×Bst DNA聚合酶缓冲液2.5μL,8U/μL的 Bst DNA聚合酶0.5μL,10 μmol/L 的padR 0.5μL,10 μmol/L的padF 0.5 μL,10mmol/L的 dNTPs 1μL,环化连接消化后产物2μL,Sterilized ddH2O 补足至25μL;反应条件:63 ℃反应1.5 h。
5.根据权利要求1所述的香蕉细菌性枯萎病菌滚环扩增检测方法,其特征在于:凝胶成像分析:取7μL滚环扩增产物于2.0%的琼脂糖凝胶上电泳,溴乙锭染色,紫外凝胶成像系统照相分析。
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