[发明专利]柑桔黄脉病毒的实时荧光定量RT-PCR 检测试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201410467902.6 | 申请日: | 2014-09-15 |
公开(公告)号: | CN104232795A | 公开(公告)日: | 2014-12-24 |
发明(设计)人: | 陈洪明;周彦;王雪峰;李中安;唐科志;周常勇 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院柑桔研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/94 |
代理公司: | 上海光华专利事务所 31219 | 代理人: | 郭婧婧 |
地址: | 400712 重*** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 柑桔 病毒 实时 荧光 定量 rt pcr 检测 试剂盒 方法 | ||
技术领域
本发明涉及生物检测技术领域,具体涉及一种针对柑桔黄脉病毒的实时荧光定量RT-PCR检测用引物、试剂盒及检测方法。
背景技术
柑桔黄脉病(Citrus yellow vein clearing disease,CYVCD),也称柠檬黄脉病(Yellow vein clearing of Lemon),是由柑桔黄脉病毒(Citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)引起的。该病是Bové(1989)在巴基斯坦调查发现后命名的,Loconsole等(2012)通过深度测序技术,获得了柑桔黄脉病毒的全基因组,该病毒由7529个(GenBank Accession No.JX040635)核苷酸的正义RNA链组成,它是威胁柠檬生产的重要病害之一。主要症状表现为叶片侧脉及侧脉附近脉明、黄化,对光看更为明显,叶背可见侧脉处水浸状,部分叶片皱缩、反卷或船形叶,嫩叶症状表现明显,到老叶症状也不消失。主要导致光合作用降低、树势减弱、减产20%左右。柠檬黄脉病目前主要发生在印度、巴基斯坦、土耳其等国家。
到目前为止,世界上对该病害的研究较少,大都停留在生物学特性研究方面,近年在我国云南瑞丽、重庆、江西、四川安岳等地柠檬上也发生类似症状,是我国柑桔上的新发病害。本人近几年研究结果表明该病害具有嫁接传染性,对所有柠檬、酸橙品种都具有嫁接传染性并具典型症状,对甜橙、宽皮柑桔也具有侵染性,但症状不明显;能侵染辣椒和豇豆;柑桔黄脉病最适宜发病温度为18~24℃,柑桔黄脉病病毒微粒为13~15×400~1000nm联合丝状,通过热处理结合茎尖嫁接脱毒方法能有效脱除该病毒。这些研究结果与国外研究报道的相关结果相同。
柑桔黄脉病毒对我国柑桔,尤其是柠檬的生产造成了极其严重的损失。目前还缺乏对该病有效的防治方法,使用无病毒苗木是防治柑桔黄脉病唯一有效的方法。为保证种苗安全,必须对采穗母树和砧木进行定期监测,并及时清除田间病树,因此要求具备快速、灵敏的检测技术体系。
当前在检测CYVCV时主要采用指示植物鉴定的方法,该方法的检测周期较长,无法 满足生长上大量、快速检测的需要。近年来,发明人创建的RT-PCR检测体系虽可对CYVCV进行快速检测,但无法对植株中CYVCV的含量进行定量分析,并且在植株发病早期,当病毒含量较低时可能无法对该病进行有效检测。为此,需要建立更为灵敏的实时RT-PCR检测体系。目前还没有运用实时RT-PCR检测CYVCV的报道。
发明内容
本发明的目的在于解决现有技术中存在的不足,提供一种利用实时荧光定量RT-PCR法对柑桔黄脉病毒(CYVCV)进行检测的引物、试剂盒及检测方法等,可用于柑桔黄脉病毒(CYVCV)的田间早期快速诊断及定量检测。
本发明首先公开了一种针对柑桔黄脉病毒(CYVCV)的实时荧光定量RT-PCR法检测用引物,所述引物组成如下:
上述针对柑桔黄脉病毒(CYVCV)的实时荧光定量RT-PCR检测用引物具体包括CYVCV上下游引物,用于扩增柑桔黄脉病毒(CYVCV)。
本发明第二方面公开了一种柑桔黄脉病毒(CYVCV)实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒,所述试剂盒的基本原理是利用一对靶多核苷酸的特异性引物,在本试剂盒PCR扩增反应液中,通过荧光定量PCR扩增仪实现靶核苷酸的循环扩增,从而达到快速、定量检测多核苷酸的目的。
进一步的,所述试剂盒包括柑桔黄脉病毒PCR扩增反应液,所述PCR扩增反应液中含有前述的引物,所述PCR扩增反应液能和该对引物的靶序列结合,产生高度灵敏、特异性高的检测信号。
较优的,所述柑桔黄脉病毒PCR扩增反应液中还含有GoTaq qPCR Master Mix和H2O。
所述PCR扩增反应液中,引物、GoTaq qPCR Master Mix及H2O均为常见组分,其含量亦为常规。
较优的,所述柑桔黄脉病毒PCR扩增反应液的组成中,CYVCV上游引物(YSS-F)、CYVCV下游引物(YSS-R)的终浓度分别为50~500nM/L和50~500nM/L。
更优的,所述柑桔黄脉病毒PCR扩增反应液的组成中,CYVCV上游引物(YSS-F)、CYVCV下游引物(YSS-R)的终浓度分别为200nM/L和200nM/L。
较优的,所述柑桔黄脉病毒PCR扩增反应液包括:
柑桔黄脉病毒上游引物:10uM、0.5μL;
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