[发明专利]一种快速灵敏检测小分子RNA的方法有效
申请号: | 201410471164.2 | 申请日: | 2014-09-16 |
公开(公告)号: | CN104232772B | 公开(公告)日: | 2017-03-29 |
发明(设计)人: | 陈放;李佛生;毛强;詹诚;唐琳 | 申请(专利权)人: | 四川大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 成都玖和知识产权代理事务所(普通合伙)51238 | 代理人: | 黎祖琴 |
地址: | 610065 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 灵敏 检测 分子 rna 方法 | ||
1.一种快速灵敏检测小分子RNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取、纯化待检测小分子RNA;
(2)探针设计:根据待检测小分子RNA的碱基序列设计探针,所述探针用生物素或地高辛进行标记;
(3)液相杂交:将所述待检测小分子RNA与所述探针在缓冲液中进行杂交,并消化掉未杂交的单链序列,然后进行凝胶电泳;
(4)转膜:将电泳后的凝胶上的杂交产物转移到固相支持物上;
(5)抗体孵育:将步骤(4)所得到的含有杂交产物的固相支持物与特异性抗体进行孵育杂交;
(6)信号检测:检测步骤(5)所得的固相支持物上的信号。
2.如权利要求1所述的一种快速灵敏检测小分子RNA的方法,其特征在于,还包括线性回归方程制作步骤:采用一系列浓度梯度的已知miRNA分别进行所述步骤(3)-(6)的操作,然后以已知miRNA的浓度为X轴,显色浓度为Y轴建立曲线坐标。
3.如权利要求1所述的一种快速灵敏检测小分子RNA的方法,其特征在于,所述固相支持物为尼龙膜、纤维素膜和PVDF膜中的任何一种,优选尼龙膜。
4.如权利要求1所述的一种快速灵敏检测小分子RNA的方法,其特征在于,步骤(2)中,探针设计时,根据待检测小分子RNA的碱基序列,设计成DNA形式,根据此设计反向互补的寡核苷酸,并在5’端随机增加2个核苷酸后,再用生物素或地高辛标记。
5.如权利要求1所述的一种快速灵敏检测小分子RNA的方法,其特征在于,步骤(3)中所述凝胶为含1×TBE的 10%-15%的聚丙烯酰胺凝胶;步骤(3)中,杂交反应体系于95℃变性0.5 min以上,然后在42-65℃杂交0.5 min以上。
6.如权利要求1所述的一种快速灵敏检测小分子RNA的方法,其特征在于,步骤(3)中,用核酸外切酶消化了未杂交上的多余单链;杂交缓冲液中,磷酸根浓度为0-0.5 M,Na+浓度为0-1.5 M,EDTA浓度为0-0.5 M,pH为6.0-9.5。
7.如权利要求1所述的一种快速灵敏检测小分子RNA的方法,其特征在于,步骤(4)中,转膜时,根据凝胶的大小裁剪6张同样大小的滤纸,及1张固相支持物,按照从下到上依次为3层滤纸、凝胶、固相支持物、3层滤纸的顺序对齐摆放,然后将上述的滤纸、凝胶、固相支持物的“三明治”结构夹在两层湿润的固相支持物中间。
8.如权利要求1所述的一种快速灵敏检测小分子RNA的方法,其特征在于,步骤(5)中,先将含有杂交产物的固相支持物加入封闭液后在20-37℃下孵育1 min以上,弃封闭液,然后加入稀释的抗体,在20-37℃下孵育5 min以上。
9.如权利要求1所述的一种快速灵敏检测小分子RNA的方法,其特征在于,步骤(3)中,杂交反应体系于95℃变性5 min,然后在42℃杂交1h;步骤(5)中,先将含有杂交产物的固相支持物加入封闭液后在37℃下孵育5 min,弃封闭液,然后加入稀释的抗体,在37℃下孵育30 min。
10.如权利要求1所述的一种快速灵敏检测小分子RNA的方法,其特征在于,步骤(6)中,采用CDP-Star检测方法或者X压片方法进行信号检测。
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