[发明专利]基因变异与药物关系数据库和数据库系统

权利要求书

1.基因变异与药物关系信息的数据库的构建方法，其特征在于，包括：

接收基因变异和药物关系的初始数据；

建立相应于所述初始数据的数据文件，所述数据文件包括基因变异数据表、药物数据表、 以及基因变异-药物关系数据表，其中，

所述基因变异数据表、药物数据表以及基因变异-药物关系数据表的每一个分别含有多个 字段，

所述基因变异数据表和所述药物数据表分别具有与所述基因变异-药物关系数据表相同字 段，以及

所述基因变异数据表、药物数据表以及基因变异-药物关系数据表的每一个分别含有索引， 所述索引是基于相应的数据表中所包含的每个字段确定的。

2.权利要求1的方法，其特征在于，在接收所述初始数据时，对所述初始数据进行筛选 和/或格式转换，所述筛选包括第一筛选和第二筛选，

所述第一筛选为筛选出所述初始数据中的符合第一参数的数据，所述第一参数是通过统计 所述初始数据中包含的第一关键词组合中各关键词出现的次数N来设置的，所述第一关键词 组合包含以下四个预置词汇集中的每个预置词汇集中的至少一个词汇：预置的肿瘤名称词汇 集、预置的基因变异词汇集、预置的药物和治疗方法词汇集、以及预置的药效或治疗效果词汇 集，

对未被所述第一筛选筛选出的初始数据进行第二筛选，从剩余的初始数据中筛选出符合第 二参数的数据，所述第二参数是通过统计所述初始数据中包含的第二关键词组合中各关键词出 现的次数M来设置的，所述第二关键词组合包含以下五个预置词汇集中的每个预置词汇集中 的至少一个词汇：预置的肿瘤名称词汇集、预置的基因变异词汇集、预置的药物和治疗方法词 汇集、预置的药效或治疗效果词汇集以及预置的期刊词汇集，所述第二关键词组合包含所述第 一关键词组合中的每个关键词，其中，

M和N为两个自然数集合，对于同一关键词i，M_i＜N_i；

所述格式转换为，以NCBI基因数据库中包含的基因标识为标准转换所述初始数据中的 基因名称，以人类参考基因组hg19版本为标准转换所述初始数据中的基因变异的类型及位置。

3.权利要求1的方法，其特征在于，所述基因变异数据表与基因变异-药物关系数据表的 相同字段是所述基因变异数据表的主键，所述药物数据表与基因变异-药物关系数据表的相同 字段是所述药物数据表的主键，数据表的主键为能够唯一标识其所在数据表中的一个记录的一 个或多个字段的组合。

4.权利要求1的方法，其特征在于，所述数据文件还包括基因信息数据表、信息原始来 源数据表和样本信息数据表，

所述基因信息数据表与所述基因变异数据表有相同字段，所述信息原始来源数据表与所述 基因变异-药物关系数据表有相同字段，所述样本信息数据表与所述基因变异数据表有相同字 段。

5.权利要求4的方法，其特征在于，所述基因信息数据表与基因变异数据表的相同字段 是所述基因信息数据表的主键，

所述信息原始来源数据表与基因变异-药物关系数据表的相同字段是所述信息原始来源数 据表的主键，

所述样本信息数据表与基因变异数据表的相同字段是所述样本信息数据表的主键。