[发明专利]一种大菱鲆个体育种值评估方法有效
申请号: | 201410514807.7 | 申请日: | 2014-09-30 |
公开(公告)号: | CN104313135A | 公开(公告)日: | 2015-01-28 |
发明(设计)人: | 王伟继;官健涛;胡玉龙;栾生;孔杰 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院黄海水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;A01K61/00 |
代理公司: | 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 | 代理人: | 曾庆国 |
地址: | 266071 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 大菱鲆 个体 育种 评估 方法 | ||
1.一种大菱鲆个体育种值评估方法,其特征在于,所述的方法包括有如下的步骤:
1)首先将待检测的大菱鲆雌雄个体来构建家系,
2)对构建的家系中的子代个体在养殖后,选取全部或部分个体进行生长性状的测量;获得个体的生长性状的测量值;
3)提取构建家系的雌雄亲本的DNA进行SSR位点基因分型;记录每一个体在每个SSR位点上的等位基因峰值数据;
4)利用Coancestry1.0.1.2软件对SSR分型数据进行计算求得亲本个体间的共祖率coancestry及近交系数F;
家系子代个体间的共祖率由其父母本间的共祖率根据公式(1)求得,其中个体与其本身的共祖率由公式(2)求出,并按公式(3)计算出子代个体间的遗传相关系数,即分子遗传相关系数;
rPQ=2θPQ (3)
其中A和B、C和D分别代表P和Q的父母本,θ代表共祖率,F代表近交系数,r代表遗传相关系数;
5)然后利用R3.0.2软件将父母本间共祖率转化为其子代个体间的分子遗传相关系数矩阵;最后利用ASReml软件计算个体育种值:
y=Xb+Zu+e
其中y代表大菱鲆家系子代个体的测量值,bi代表固定效应,u代表随机效应,e表示残差效应;
再根据狭义遗传力公式求得遗传力估计值:
和分别表示加性遗传方差及表现方差。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的步骤1)中的家系为母系半同胞家系组和/或全同胞家系。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的步骤3)中的SSR位点基因分型所用到的微卫星引物序列信息如下:
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的步骤3)中所述的SSR位点基因分型是利用全自动基因分析仪进行SSR基因分型。
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