[发明专利]基于高通量测序的标记和捕获多个样本的一个或多个特定基因的方法和试剂盒有效

专利信息
申请号: 201410521927.X 申请日: 2014-09-30
公开(公告)号: CN105524983B 公开(公告)日: 2019-06-21
发明(设计)人: 刘琦;郑新;赵金银;郭丽萍;许立志;其他发明人请求不公开姓名 申请(专利权)人: 大连晶泰生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869
代理公司: 北京金信知识产权代理有限公司 11225 代理人: 朱梅;徐琳
地址: 116635 辽宁省大连市大连经*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 基于 通量 标记 捕获 样本 一个 特定 基因 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种基于高通量测序的标记和捕获多个样本的嗜铬细胞瘤相关的SDHB、SDHC、SDHD、RET、VHL 5个基因的外显子的试剂盒,其中,所述外显子为SDHB-EXON1、SDHB-EXON2、SDHB-EXON3、SDHB-EXON4、SDHB-EXON5、SDHB-EXON6、SDHB-EXON7、SDHB-EXON8、SDHC-EXON1、SDHC-EXON2、SDHC-EXON3、SDHC-EXON4、SDHC-EXON5、SDHC-EXON6、SDHD-EXON1、SDHD-EXON2、SDHD-EXON3、SDHD-EXON4、RET-EXON10、RET-EXON11、RET-EXON13、RET-EXON14、RET-EXON15、RET-EXON16、VHL-EXON1、VHL-EXON2和VHL-EXON3;所述试剂盒包括以下引物:

第一轮扩增引物包括:

SDHB-1F TGTAAAACGACGGCCAGTCTATTGCGCACGCTCGCTGT

SDHB-1R CAGGAAACAGCTATGACCCCCATCAGCTCCAGGCAGTC

SDHB-2F TGTAAAACGACGGCCAGTTGCTGTGTCACTAGCCCCTA

SDHB-2R CAGGAAACAGCTATGACCAAACAGAGCCATCGGATGAT

SDHB-3F TGTAAAACGACGGCCAGTGAACGTTACATAAATACCACTGGA

SDHB-3R CAGGAAACAGCTATGACCCTATCAGCTTTGGCCAGC

SDHB-4F TGTAAAACGACGGCCAGTAGGGAGAAAAGCCAACAG

SDHB-4R CAGGAAACAGCTATGACCAGGAGCCTTAAATACTCAAACA

SDHB-5F TGTAAAACGACGGCCAGTGGAAAAGAGTCTGGCTTCTGC

SDHB-5R CAGGAAACAGCTATGACCTGCCAGTTCCTCTCCAGAAT

SDHB-6F TGTAAAACGACGGCCAGTTCACCCCTTGGATTTTGCTA

SDHB-6R CAGGAAACAGCTATGACCGACTGGATGGCAATGAAGGA

SDHB-7F TGTAAAACGACGGCCAGTTGGAGATGAGGCATCTAAGC

SDHB-7R CAGGAAACAGCTATGACCCCCCTAGGCTCACACTGAAA

SDHB-8F TGTAAAACGACGGCCAGTTTTGAGGGACTTGATTTGCAT

SDHB-8R CAGGAAACAGCTATGACCCGGCAAGTAAAGGAACAGGT

SDHC-1F TGTAAAACGACGGCCAGTAGCAAACCAGCTAGGCAGAG

SDHC-1R CAGGAAACAGCTATGACCGACGGGAAAAGGGGTCTCTA

SDHC-2F TGTAAAACGACGGCCAGTGAAAATGGTATCAAGGACACTGA

SDHC-2R CAGGAAACAGCTATGACCAATGGCGTGAACCCAAGA

SDHC-3F TGTAAAACGACGGCCAGTTTACAGGCCTGAGCAACCAT

SDHC-3R CAGGAAACAGCTATGACCTACCCTGAAGGGTTCACCTC

SDHC-4F TGTAAAACGACGGCCAGTACAGGAATGCAAAAGCTGGT

SDHC-4R CAGGAAACAGCTATGACCTCAAGTGCTGAGTTTCAAAGGA

SDHC-5F TGTAAAACGACGGCCAGTCAGGGGTCCCAGTTTTATGT

SDHC-5R CAGGAAACAGCTATGACCGAGCGAGACTCCACTCTTGG

SDHC-6F TGTAAAACGACGGCCAGTAAGGTGGGGCATAAGGGTAG

SDHC-6R CAGGAAACAGCTATGACCTGCTCCAAGGAGATCTGAAAA

SDHD-1F TGTAAAACGACGGCCAGTGCCTCTCGACTTCCGACA

SDHD-1R CAGGAAACAGCTATGACCCCTTCGGGTAAACATCTGGA

SDHD-2F TGTAAAACGACGGCCAGTACATGCAGATGTTCCCTGGT

SDHD-2R CAGGAAACAGCTATGACCTGTCTGCCCAAAGGTGTAAA

SDHD-3F TGTAAAACGACGGCCAGTCCCTTGTGCTAAAAGACTTCAAA

SDHD-3R CAGGAAACAGCTATGACCTCAACAAATTTAGGGCATTTCA

SDHD-4F TGTAAAACGACGGCCAGTTGATGTTATGATTTTTTCTTTTT

SDHD-4R CAGGAAACAGCTATGACCCAATTCTTCAAAGTATGAAGTCA

RET-10F TGTAAAACGACGGCCAGTTATGCTTGCGACACCAGTTG

RET-10R CAGGAAACAGCTATGACCAGAGGGAGGGAGGGAAGTTT

RET-11F TGTAAAACGACGGCCAGTATGAGGCAGAGCATACGCAG

RET-11R CAGGAAACAGCTATGACCAGAGGAGTAGCTGACCGGGA

RET-13F TGTAAAACGACGGCCAGTAGCCTCAAGCAGCATCGTCT

RET-13R CAGGAAACAGCTATGACCGGCAGGAGCAGTAGGGAAAG

RET-14F TGTAAAACGACGGCCAGTGCTGAGGCTTCAAGGTCTGC

RET-14R CAGGAAACAGCTATGACCAGAGCCATATGCACGCACCT

RET-15F TGTAAAACGACGGCCAGTGCCTGACGACTCGTGCTAT

RET-15R CAGGAAACAGCTATGACCCCACTAATCTTCGGTATCTTTCC

RET-16F TGTAAAACGACGGCCAGTGCCCCTTCAAAGATGTGTGT

RET-16R CAGGAAACAGCTATGACCGCTAGCACTGCAGACAGGT

VHL-1F TGTAAAACGACGGCCAGTTGGTCTGGATCGCGGAGGGAAT

VHL-1R CAGGAAACAGCTATGACCGCTGGGTCGGGCCTAAGCGCCGG

VHL-2F TGTAAAACGACGGCCAGTGTGGCTCTTTAACAACCTTTGC

VHL-2R CAGGAAACAGCTATGACCCCTGTACTTACCACAACAACCTT

VHL-3F TGTAAAACGACGGCCAGTTTCCTTGTACTGAGACCCTAGT

VHL-3R CAGGAAACAGCTATGACCAGCTGAGATGAAACAGTGTAAGT

第二轮扩增引物包括选自下列正向标签引物和反向标签引物组成的一对或多对:

Index_01_F ATCACGTGTAAAACGACGGCCAGT

Index_01_R ATCACGCAGGAAACAGCTATGACC

Index_02_F CGATGTTGTAAAACGACGGCCAGT

Index_02_R CGATGTCAGGAAACAGCTATGACC

Index_03_F TTAGGCCTGTAAAACGACGGCCAGT

Index_03_R TTAGGCCCAGGAAACAGCTATGACC

Index_04_F TGACCATGTAAAACGACGGCCAGT

Index_04_R TGACCACAGGAAACAGCTATGACC

Index_05_F ACAGTGTGTAAAACGACGGCCAGT

Index_05_R ACAGTGCAGGAAACAGCTATGACC

其中,所选择的第二轮扩增引物的数量遵循以下规则:正向标签引物的数量×反向标签引物的数量≥样本数量。

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