[发明专利]一种快速提取杉木总RNA的方法在审
申请号: | 201410523493.7 | 申请日: | 2014-10-08 |
公开(公告)号: | CN104313014A | 公开(公告)日: | 2015-01-28 |
发明(设计)人: | 马志慧;林思祖;陈宇;许珊珊;曹光球;李树斌;丁国昌 | 申请(专利权)人: | 福建农林大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350002 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 提取 杉木 rna 方法 | ||
技术领域
本发明涉及一种从植物组织中快速提取总RNA的方法,特别涉及一种从富含多酚等次生代谢产物的植物组织中提取总RNA的方法。
背景技术
杉木(Cunninghamia lanceolata (Lamb.)Hook.)是我国南方重要的用材林树种。近年来,随着分子生物学技术的发展,国内外也逐渐开始利用分子生物学手段来开展杉木的相关研究,而从杉木组织中提取高质量的总RNA是进行这些研究的基础和关键。
杉木富含多酚等次生代谢产物,多酚易被氧化成褐色的醌类物质,会使RNA降解,RNase和多酚氧化酶都属于蛋白质,要获得完整的、高质量的总RNA就必须能够去除蛋白,次生代谢产物则易于RNA结合,阻碍RNA的分离。因此,要获得高质量的杉木总RNA,就必须要去除多酚和次生代谢产物,抑制多酚的氧化。
目前,常见植物材料总RNA的提取方法较多,主要有CTAB法、改良CTAB法、Trizol法、异硫氰酸胍法、热硼酸法等,但尚未有一种能够快速从杉木组织中提取总RNA的方法。我们迫切需要一种成本低廉,操作简单、方便,高效的提取方法。
发明内容
本发明的目的在于提供一种简单、经济、高效的快速提取杉木总RNA的方法,为研究人员在实际工作中提供更多的选择。所提取的RNA质量高,可以满足RT-PCR、Northern杂交等基因分离和表达分析等研究的需要,同时可以大大降低实验的成本。
本发明所提供的一种快速提取杉木总RNA的方法,包括以下步骤:
(1)在1.5 ml离心管中混匀如下液体:1 ml SDS提取液和40-60μl 巯基乙醇,记为提取液A;
(2)取90-120mg新鲜杉木材料放到2 ml离心管中,并加入钢珠,迅速放到液氮中速冻,用高通量组织研磨仪研磨成粉末;
(3)向研磨后的离心管中迅速加入0.8-1.5 ml提取液A,涡旋混匀,室温静置8-15 min,4℃,13000g离心10-20 min;
(4)吸取500-700μl上清至一新的1.5 ml离心管中,加入200-400μl 5 mol/L NaCl和400-600μl氯仿,混匀,4℃,13000g离心4-7 min;
(5)吸取500-700μl上清,加入等体积的水饱和酚:氯仿v/v=1:1的混合液,混匀,4℃,13000g离心4-7 min;
(6)吸取300-500μl上清于一新的1.5 ml离心管中,加入等体积预冷的异丙醇,于室温下在侧摆摇床上摇匀10 min;
(7)将上述摇匀后的液体吸入到离心柱中,4℃,13000g离心1-3 min;
(8)加入75%预冷的乙醇洗涤沉淀,4℃,13000g离心1-3 min;
(9)重复步骤(8);
(10)弃液,4℃,13000g空离心1-3 min;
(11)更换底部的收集管为新的1.5 ml无RNA酶离心管,向上述离心柱中央加入30-50μl DEPC水,静置2-5 min,4℃,13000g离心1-3 min;
(12)将离心后离心管底部的液体重新吸入离心柱中,静置2~5 min,4℃,13000g离心1-3 min;
(13)弃离心柱,将新的收集管-20℃保存备用。
SDS提取液配置:0.25M NaCl,0.05M Tris-HCl、pH=7.5,20mM EDTA、pH=8.0,1%SDS。
更优选地,一种快速提取杉木总RNA的方法,包括以下步骤:
(1)在1.5 ml离心管中混匀如下液体:1 mlSDS提取液和50μl 巯基乙醇,记为提取液A;
(2)取100mg新鲜杉木材料放到2 ml离心管中,并加入2个5 mm钢珠,迅速放到液氮中速冻,用高通量组织研磨仪研磨成粉末;
(3)向研磨后的离心管中迅速加入1 ml提取液A,涡旋混匀,室温静置10 min,4℃,13000g离心15 min;
(4)吸取600μl上清至一新的1.5 ml离心管中,加入300μl 5 mol/L NaCl和500μl氯仿,混匀,4℃,13000g离心5 min;
(5)吸取600μl上清,加入等体积的水饱和酚:氯仿v/v=1:1的混合液,混匀,4℃,13000g离心5 min;
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