[发明专利]梨小食心虫荧光PCR检测方法与应用有效
申请号: | 201410536526.1 | 申请日: | 2014-10-11 |
公开(公告)号: | CN104232785A | 公开(公告)日: | 2014-12-24 |
发明(设计)人: | 王凤军;冯俊丽;华鹏;张祥林;张伟;郭铁群;刘永杰;王鹏举 | 申请(专利权)人: | 中华人民共和国库尔勒出入境检验检疫局 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 金祺 |
地址: | 841000 新疆维吾尔自治*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 梨小食心虫 荧光 pcr 检测 方法 应用 | ||
1.梨小食心虫实时荧光PCR检测方法,其特征是:
检测中所用特异性引物和探针的核苷酸分别为:
特异性引物为:
F-Primer:5’-CAGCTCTTTTATTACTACTTTCACTACCA-3’
R-Primer:5’-AATAGGATCTCCTCCTCCT-3’;
探针为:
Probe:5’-(FAM)CGAAATCTTAATACTTCATTTTTTGACCCTG(TAMRA)-3’。
2.根据权利要求1所述的梨小食心虫实时荧光PCR检测方法,其特征是包括以下步骤:
①、待鉴定样品基因组DNA的提取;
②、实时荧光定量PCR扩增体系设置:
以基因组DNA为扩增模板,用上述特异性引物和探针,进行实时荧光PCR检测;
③、扩增结果分析及结果判断。
3.根据权利要求2所述的梨小食心虫实时荧光PCR检测方法,其特征是:
探针的5’端标记有报告荧光染料,根据所采用的实时荧光PCR仪的配置而定,所述报告荧光染料为FAM、HEX、JOE、VIC、NED、FITC、CY3或CY5,探针的3’端标记有淬灭荧光染料,所述淬灭荧光染料为TAMRA、ROX、dabcy1、BHQ或ECLIPSE。
4.根据权利要求2或3所述的梨小食心虫实时荧光PCR检测方法,其特征是:
所述步骤②实时荧光定量PCR扩增体系设置为:
25μL总体积中含有10×PCR Buffer 2.5μL,dNTP(2.5mM,each)2μL,上下游引物(10μM)各0.5μL,探针(10μM)0.5μL,500U Taq DNA聚合酶0.25μL和DNA模板2μL,补水至25μL。
5.根据权利要求4所述的梨小食心虫实时荧光PCR检测方法,其特征是:
实时荧光PCR扩增条件为:95℃预处理15s,再以95℃变性5s,60℃退火/延伸34s,进行40个循环,在每个循环的60℃退火/延伸阶段收集荧光信号。
6.根据权利要求5所述的梨小食心虫实时荧光PCR检测方法,其特征是:
所述步骤④的扩增结果分析及结果判断为:根据样品扩增出具有指数增长型的荧光扩增曲线,当其Ct值小于35,且阴性对照和空白对照无荧光信号,说明该样品受到梨小食心虫污染,否则不是梨小食心虫污染;当检测样品Ct值小于35,但阴性对照/空白对照有荧光信号,说明该检测结果不可信,整个检测过程需要重新做。
7.根据权利要求6所述的梨小食心虫实时荧光PCR检测方法,其特征是:
所述步骤①的梨小食心虫待检样品的DNA的提取可采用CTAB法、SDS法、高盐低pH法或试剂盒法进行提取。
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