[发明专利]一种检测鼠肺炎克雷伯氏菌的LAMP引物、试剂盒及方法有效
申请号: | 201410583258.9 | 申请日: | 2014-10-27 |
公开(公告)号: | CN104328174A | 公开(公告)日: | 2015-02-04 |
发明(设计)人: | 师长宏;路凡;陈新雨;张海;赵勇;白冰;张彩勤 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军第四军医大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/22 |
代理公司: | 西安通大专利代理有限责任公司 61200 | 代理人: | 蔡和平 |
地址: | 710032 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 肺炎 克雷伯氏菌 lamp 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测鼠肺炎克雷伯氏菌的LAMP引物,其特征在于:包括以下2对引物:外引物F3和B3以及内引物FIP和BIP;FIP的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1所示,BIP的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.2所示,F3的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.3所示,B3的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.4所示。
2.一种检测鼠肺炎克雷伯氏菌的LAMP试剂盒,其特征在于:该试剂盒包括40μmol·L-1的FIP 1.0μL,40μmol·L-1的BIP 1.0μL,10μmol·L-1的F3 0.5μL以及10μmol·L-1的B3 0.5μL;F3和B3为外引物,FIP和BIP为内引物,FIP的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1所示,BIP的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.2所示,F3的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.3所示,B3的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.4所示。
3.如权利要求2所述一种检测鼠肺炎克雷伯氏菌的LAMP试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括2×反应缓冲液12.5μL,8U/μL Bst聚合酶1μL,25mM dNTP 1.5μL以及荧光染料1μL。
4.如权利要求3所述一种检测鼠肺炎克雷伯氏菌的LAMP试剂盒,其特征在于:所述荧光染料为质量分数0.5%的钙黄绿素水溶液。
5.一种检测鼠肺炎克雷伯氏菌的LAMP方法,其特征在于:包括以下步骤:
1)提取待检测对象的DNA;
2)将以下组份进行混合,构建包括2对引物F3和B3以及FIP和BIP的25μL LAMP反应体系:
2×反应缓冲液12.5μL,40μmol·L-1的FIP 1.0μL,40μmol·L-1的BIP 1.0μL,10μmol·L-1的F3 0.5μL,10μmol·L-1的B3 0.5μL,8U/μL Bst聚合酶1μL,25mMdNTP 1.5μL,待检测对象的DNA 2μL,荧光染料1μL,超纯水补足至25μL;FIP的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1所示,BIP的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.2所示,F3的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.3所示,B3的核苷酸序列如SEQ.ID.NO.4所示;
3)将LAMP反应体系在63℃加热40min,然后在85℃加热5min,反应完成;
4)待反应完成后通过以下方式进行结果的判定:
反应完成后观察LAMP反应体系是否有颜色的变化,若LAMP反应体系颜色发生变化则为阳性反应,表明在待检测对象中检测到肺炎克雷伯氏菌;若LAMP反应体系颜色未发生变化则为阴性反应,表明在待检测对象中未检测到肺炎克雷伯氏菌。
6.如权利要求5所述一种检测鼠肺炎克雷伯氏菌的LAMP方法,其特征在于:所述待检测对象的DNA的提取方法为:
将待检测对象的血液、组织液或化脓液接种于肉汤培养基中,然后在37℃条件下培养24h得菌液,取菌液离心,将离心得到的上清用DNA试剂盒提取DNA。
7.如权利要求5所述一种检测鼠肺炎克雷伯氏菌的LAMP方法,其特征在于:在检测时还分别设立阳性对照和阴性对照,以肺炎克雷伯氏菌基因组DNA为阳性对照,以超纯水为阴性对照;在进行结果的判定时,还与阳性对照和阴性对照比较,若待检测对象所对应的LAMP反应体系以及阳性对照所对应的LAMP反应体系均呈绿色,则判定待检测对象的检测结果为阳性反应,若待检测对象所对应的LAMP反应体系以及阴性对照所对应的LAMP反应体系均呈橘黄色,则判定待检测对象的检测结果为阴性反应。
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