[发明专利]一种致病疫霉的LAMP检测引物组合物及其LAMP检测试剂盒和LAMP检测方法有效
申请号: | 201410639817.3 | 申请日: | 2014-11-13 |
公开(公告)号: | CN104313175A | 公开(公告)日: | 2015-01-28 |
发明(设计)人: | 戴婷婷;郑小波;吴小芹 | 申请(专利权)人: | 南京林业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 邱兴天 |
地址: | 210037 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 致病 lamp 检测 引物 组合 及其 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于检测致病疫霉菌的LAMP引物组合物,其特征在于:由正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向外引物F3、反向外引物B3和反向环引物LB组成;各引物序列具体如下:
FIP:5′-AATCGCGAAAGCCATGTGAGCCAAACGACCTTTTGTAAGG-3′;
BIP:5′-TTGCTTAGAAAATCCGTACGATCGGACAAATGTTTTTTTAGCGGC-3′;
F3:5′-TGTGAGTGTCTAACATATTTTACG-3′;
B3:5′-GTTAGTTAAATAGGAAATCACGC-3′;
LB:5′-GGCAAGACCATCAAGCTCCAA-3′。
2.权利要求1所述的LAMP引物组合物在检测致病疫霉菌的中的应用。
3.一种检测致病疫霉菌的LAMP试剂盒,其特征在于:包含1mL检测溶液,所述的检测溶液包括:32 mM正向内引物FIP、32 mM 反向内引物BIP、8 mM正向外引物F3、8 mM反向外引物B3、8 mM环引物LB、56 mM dNTPs、0.8 M Tris-HC、0.4 mM KCl、0.4 mM (NH4)2SO4、0.24 mM MgSO4、4%Triton X-100、Bst DNA polymerase 320单位,180mM羟基萘酚蓝;其中,各引物序列具体如下:
FIP:5′-AATCGCGAAAGCCATGTGAGCCAAACGACCTTTTGTAAGG-3′;
BIP:5′-TTGCTTAGAAAATCCGTACGATCGGACAAATGTTTTTTTAGCGGC-3′;
F3:5′-TGTGAGTGTCTAACATATTTTACG-3′;
B3:5′-GTTAGTTAAATAGGAAATCACGC-3′;
LB:5′-GGCAAGACCATCAAGCTCCAA-3′。
4.权利要求3所述的检测致病疫霉菌的LAMP试剂盒在检测致病疫霉菌的中的应用。
5.一种检测致病疫霉菌的方法,其特征在于:包括提取待检微生物的DNA,以提取的DNA为模板,利用LAMP引物组合物或LAMP试剂盒进行LAMP;扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,在紫外光下检测结果,如果存在特征性阶梯状条带,则证明所检测样品中存在致病疫霉;无特征性阶梯状条带,则所检测样品中无致病疫霉;或观察LAMP反应溶液颜色变化,天蓝色表示检测为阳性,存在致病疫霉;紫色表示检测结果为阴性,不存在致病疫霉菌。
6.根据权利要求5所述的检测致病疫霉菌的方法,其特征在于:提取待检微生物的DNA,取1 μL DNA溶液,加入23μLLAMP试剂盒中的检测溶液和1μL灭菌去离子水进行LAMP,LAMP反应程序为:60℃~65℃,55~85min,扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,在紫外光下检测结果。
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