[发明专利]一种致病疫霉的LAMP检测引物组合物及其LAMP检测试剂盒和LAMP检测方法有效

专利信息
申请号: 201410639817.3 申请日: 2014-11-13
公开(公告)号: CN104313175A 公开(公告)日: 2015-01-28
发明(设计)人: 戴婷婷;郑小波;吴小芹 申请(专利权)人: 南京林业大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645
代理公司: 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人: 邱兴天
地址: 210037 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 致病 lamp 检测 引物 组合 及其 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种用于检测致病疫霉菌的LAMP引物组合物,其特征在于:由正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向外引物F3、反向外引物B3和反向环引物LB组成;各引物序列具体如下:

FIP:5′-AATCGCGAAAGCCATGTGAGCCAAACGACCTTTTGTAAGG-3′;

BIP:5′-TTGCTTAGAAAATCCGTACGATCGGACAAATGTTTTTTTAGCGGC-3′;

F3:5′-TGTGAGTGTCTAACATATTTTACG-3′;

B3:5′-GTTAGTTAAATAGGAAATCACGC-3′;

LB:5′-GGCAAGACCATCAAGCTCCAA-3′。

2.权利要求1所述的LAMP引物组合物在检测致病疫霉菌的中的应用。

3.一种检测致病疫霉菌的LAMP试剂盒,其特征在于:包含1mL检测溶液,所述的检测溶液包括:32 mM正向内引物FIP、32 mM 反向内引物BIP、8 mM正向外引物F3、8 mM反向外引物B3、8 mM环引物LB、56 mM dNTPs、0.8 M Tris-HC、0.4 mM KCl、0.4 mM (NH42SO4、0.24 mM MgSO4、4%Triton X-100、Bst DNA polymerase 320单位,180mM羟基萘酚蓝;其中,各引物序列具体如下:

FIP:5′-AATCGCGAAAGCCATGTGAGCCAAACGACCTTTTGTAAGG-3′;

BIP:5′-TTGCTTAGAAAATCCGTACGATCGGACAAATGTTTTTTTAGCGGC-3′;

F3:5′-TGTGAGTGTCTAACATATTTTACG-3′;

B3:5′-GTTAGTTAAATAGGAAATCACGC-3′;

LB:5′-GGCAAGACCATCAAGCTCCAA-3′。

4.权利要求3所述的检测致病疫霉菌的LAMP试剂盒在检测致病疫霉菌的中的应用。

5.一种检测致病疫霉菌的方法,其特征在于:包括提取待检微生物的DNA,以提取的DNA为模板,利用LAMP引物组合物或LAMP试剂盒进行LAMP;扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,在紫外光下检测结果,如果存在特征性阶梯状条带,则证明所检测样品中存在致病疫霉;无特征性阶梯状条带,则所检测样品中无致病疫霉;或观察LAMP反应溶液颜色变化,天蓝色表示检测为阳性,存在致病疫霉;紫色表示检测结果为阴性,不存在致病疫霉菌。

6.根据权利要求5所述的检测致病疫霉菌的方法,其特征在于:提取待检微生物的DNA,取1 μL DNA溶液,加入23μLLAMP试剂盒中的检测溶液和1μL灭菌去离子水进行LAMP,LAMP反应程序为:60℃~65℃,55~85min,扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,在紫外光下检测结果。

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