[发明专利]谷子白发病菌LAMP快速检测方法的建立有效
申请号: | 201410671048.5 | 申请日: | 2014-11-21 |
公开(公告)号: | CN104328205B | 公开(公告)日: | 2016-11-23 |
发明(设计)人: | 李志勇;白辉;董立;马继芳;董志平;王楠;全建章;刘磊 | 申请(专利权)人: | 河北省农林科学院谷子研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/625 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 050035 河北省石家*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 谷子 白发 病菌 lamp 快速 检测 方法 建立 | ||
1.一种谷子白发病菌的LAMP快速检测方法,其特征在于该检测方法包括以下步骤:
(1)根据谷子白发病菌的18S rDNA序列设计LAMP特异性引物;
(2)LAMP扩增及扩增产物的检测;
(3)LAMP引物的特异性检测;
(4)LAMP扩增和PCR扩增灵敏性比较;
(5)谷子种子携带白发病菌的检测。
2.根据权利要求1所述的谷子白发病菌的LAMP快速检测方法,其特征在于:所述的LAMP特异性引物序列如下:
F3:GCGTGCGTGTACTATGGC
B3:GTTGTAGGCACCTCAGTCC
FIP:GGCGTCCCACCACAATACAGGCTTTTTGGCTGCGCTTGG
BIP:ACCGCGGGAAATGACTACCGAAACCACAACTACTCGTCCAC 。
3.根据权利要求1所述的谷子白发病菌的LAMP快速检测方法,其特征在于:所述的LAMP反应体系为:25.0μL,其中,外引物F3和B3(10μM)各0.5μL,内引物FIP和BIP(10μM)各4.0μL,dNTP(10mmol/L)4.0μL,甜菜碱(5mmol/L)1.0μL,Bst DNA聚合酶(8U/μL)1.0μL,10×DNA聚合酶buffer 2.5μL,DNA模板1.0μL,dH2O(灭菌蒸馏水)6.5μL;扩增条件为65℃条件下温育60min,80℃下反应10min。
4.根据权利要求1所述的谷子白发病菌的LAMP快速检测方法,其特征在于:所述的LAMP扩增产物的检测方法为琼脂糖凝胶电泳法和SYBR GreenⅠ荧光染料显色法;所述琼脂糖凝胶电泳法:取5μL LAMP扩增产物,用1.2%的琼脂糖凝胶电泳检测,EB染色,在凝胶成像系统中观察,出现特征性梯状条带为阳性,未出现条带为阴性;SYBR GreenⅠ荧光染料显色法:向LAMP扩增产物中加入1μL 100×SYBR GreenⅠ,混匀后肉眼观察颜色变化,产生绿色为阳性反应,橙色则为阴性反应。
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