[发明专利]一种从禾本科作物感病组织上直接提取病原菌DNA的方法在审
申请号: | 201410674584.0 | 申请日: | 2015-08-04 |
公开(公告)号: | CN104498474A | 公开(公告)日: | 2015-07-29 |
发明(设计)人: | 董丽英;杨勤忠;刘树芳;徐鹏;李静 | 申请(专利权)人: | 云南省农业科学院农业环境资源研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 | 代理人: | 向庆宁 |
地址: | 650203 云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 禾本科 作物 组织上 直接 提取 病原菌 dna 方法 | ||
1.一种从禾本科作物感病组织上直接提取病原菌DNA的方法,该方法包括:
(1)、提前分别配制以下四种试剂,灭菌后备用:(1)100mM TrisHCl(pH8.7)、(2)10mM EDTA(pH 8.0)、(3)1M KCl和(4)10%Tween 20;
(2)、采集待检测的禾本科作物感染病害的叶片或其它组织作为样品,从发病的禾本科作物的叶片病斑上切取约2mm×2mm大小的叶片放置于PCR-96孔板中;
(3)、根据样品的数量,将步骤(1)中的100mM TrisHCl(pH8.7)、10mM EDTA(pH8.0)和1M KCl各取适量等体积混合后,然后再根据3种混合液的总体积按1000:1的量加入10%的Tween 20;最后混合均匀后,在预先放入样品的PCR-96孔板中每孔各加入100μL提取液;
(4)、将步骤(3)处理好的样品放入PCR仪,95℃加热处理10min,取出样品放置于-20℃备用,或将样品放入湿热灭菌锅,在105℃下处理10min,取出样品放置于-20℃备用。
2.根据权利要求1的方法,其中,PCR-96孔板可以被塑料试管或玻璃试管所代替。
3.一种从禾本科作物感病组织上直接提取病原菌DNA的方法,该方法由以下步骤组成:
1)、提前分别配制以下四种试剂,灭菌后备用:(1)、100mM TrisHCl(pH8.7)、(2)、10mM EDTA(pH 8.0)、(3)、1M KCl和(4)、10%Tween 20;
2)、采集待检测的禾本科作物感染病害的叶片或其它组织作为样品,从发病的禾本科作物的叶片病斑上切取约2mm×2mm大小的叶片放置于PCR-96孔板中;
3)、根据样品的数量,将步骤(1)中的100mM TrisHCl(pH8.7)、10mM EDTA(pH 8.0)和1M KCl各取适量等体积混合后,然后再根据3种混合液的总体积按1000:1的量加入10%的Tween 20;最后混合均匀后,在预先放入样品的PCR-96孔板中每孔各加入100μL提取液;
4)、将上述处理好的样品放入PCR仪,95℃加热处理10min,取出样品放置于-20℃备用,或将样品放入湿热灭菌锅,在105℃下处理10min,取出样品放置于-20℃备用。
4.根据权利要求1或3所述的方法,当所述的禾本科作物为真菌或细菌引起的病害的时候,检测的方法如下,真菌病害:将提取感染病害的样品的DNA用检测真菌rDNA的ITS区段的1对通用引物进行PCR检测,扩增片段大小约500bps,正向引物和反向引物名称和序列分别为,ITS1:TCC GTA GGT GAA CCT GCG G,ITS4:TCC TCC GCT TAT TGATAT GC;当禾本科为水稻叶片的稻瘟病菌DNA检测时,用检测稻瘟病菌无毒基因AvrPizt的特异引物进行,扩增片段大小为1186bps,正向引物和反向引物名称及序列分别为,AvrPizt-1Fw:AAG CGT CAC AAA ATA TCA TCA AGT,AvrPizt-1Rv:CGG CTA CCA TCGAGA AAA GT;当禾本科为水稻叶片的细菌病害:将提取感染病害的样品的DNA用检测细菌16S rDNA的1对通用引物进行PCR扩增,扩增片段大小约1.5kb,正向引物和反向引物分别及序列为,27F:AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG、1942R:ACG GCT ACCTTG TTA CGA CTT;PCR反应体系20μL,包含:2×Taq MasterMix 10μL,正向引物及反向引物各1μL(引物浓度10μM),制备好的DNA模板1μL,无菌双蒸水6μL;PCR扩增条件为:95℃预变性3min,然后进入35个循环的扩增反应,即95℃变性30min,55℃退火30min,72℃延伸1.5min,循环结束后再延伸7min,然后将PCR产物放置于4℃。
5.根据权利要求1-4之一所述的方法,其中禾本科植物病害为水稻的稻瘟病,玉米的叶片上的玉米灰斑病或者水稻叶片上的水稻细菌性条斑病。
6.根据权利要求1-4之一所述的方法,其中禾本科作物组织样品为水稻叶片和穂颈上的稻瘟病病斑;玉米的叶片上玉米灰斑病病斑或者水稻叶片上水稻细菌性条斑病斑。
7.根据权利要求6所述的方法,当禾本科作物组织样品为水稻穂颈上的稻瘟病病斑时,从水稻穂颈上取1-2mm长的发病穂颈放置于所述的PCR-96孔板中。
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