[发明专利]一种快速高通量的疟原虫检测方法在审

专利信息
申请号: 201410697132.4 申请日: 2014-11-26
公开(公告)号: CN104561268A 公开(公告)日: 2015-04-29
发明(设计)人: 田桢干;张子龙;李深伟;李美 申请(专利权)人: 中华人民共和国上海出入境检验检疫局
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04
代理公司: 上海泰能知识产权代理事务所 31233 代理人: 黄志达
地址: 200135 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 快速 通量 疟原虫 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种快速高通量的疟原虫检测方法,其特征在于:包括如下步骤:

(1)血液样本进行DNA液提取;

(2)PCR扩增:

a.PCR反应体系包括:PCR反应缓冲液,待测样本基因特异性正、反向引物,PCR Grade H2O,PCR Control,DNA提取液;

b.将PCR反应液加入已含有待测基因特异性探针的芯片反应室内,将芯片放入机器进行扩增反应;特异性探针是根据特异性引物扩增区内设计,能够区别其他物种;特异性探针点入芯片上;

(3)杂交:PCR扩增完后,将杂交反应液加入芯片,使杂交液和扩增液都进入到杂交舱内杂交反应;

(4)清洗:杂交后的芯片用洗液冲洗,直接用荧光扫描仪检测;

(5)结果判读;

所述的待测样本基因为恶性疟、间日疟、三日疟各自特有基因。

2.根据权利要求1所述的快速高通量的疟原虫检测方法,其特征在于:所述的特有基因分别是恶性疟的mdr、crt、18SrRNA基因,间日疟的SSUrRNA、csp、18SrRNA基因,三日疟的18SrRNA基因。

3.根据权利要求1所述的快速高通量的疟原虫检测方法,其特征在于:所述的特异性正反引物和探针是:

恶性疟原虫

mdr基因

Pf1-F:GTGTTGAAAGATGGGTAAAGAGCAGA  (SEQ ID NO 1)

Pf1-R:CGTACCAATTCCTGAACTCACTTGTTC  (SEQ ID NO 2)

Probe:GAACAAAAAGAGTACCGCTGAA  (SEQ ID NO 3)

crt基因

Pf2-F:GGTGGAGGTTCTTGTCTTGGTAAATG  (SEQ ID NO 4)

Pf2-R:CGGATGTTACAAAACTATAGTTACC  (SEQ ID NO 5)

Probe:GTATTATTTATTTAAGTGTATGTGT  (SEQ ID NO 6)

18SrRNA基因

Lm2-F:ATTGCTTTTGAGAGGTTTTGTTAC  (SEQ ID NO 7)

Lm2-R:GCTGTAGTATTCAAACACAATGAAC  (SEQ ID NO 8)

Probe:CATAACAGACGGGTAGTCAT  (SEQ ID NO 9)

间日疟原虫

SSUrRNA基因

Pv1-F:AGTTCGTGAATATGATTTGTC  (SEQ ID NO 10)

Pv1-R:CTGCGCTTCTGTACTTGGC  (SEQ ID NO 11)

Probe:GGGGATTGCAATTATACTTCGTGTCG  (SEQ ID NO 12)

csp基因

Vp2-F:GGTGAGAACCCAGATGACGAGG  (SEQ ID NO 13)

Vp2-R:TGGACTCCATGCAGTGTAACCTGT  (SEQ ID NO 14)

Probe:GGTGATGGAGCAGCTGTACAG  (SEQ ID NO 15)

18SrRNA基因

Lm2-F:GCAACGCTTCTAGCTTAATCCAC  (SEQ ID NO 16)

Lm2-R:CAAGCCGAAGCAAAGAAAGTCC  (SEQ ID NO 17)

Probe:ACTTTGTGCGCATTTTGCTA  (SEQ ID NO 18)

三日疟原虫

18SrRNA基因

Pm1-F:GTTAAGGGAGTGAAGACGATCAGATACCGT  (SEQ ID NO 19)

Pm1-R:GCCCCAGAACCCAAAGACTTTGATTTCTCA  (SEQ ID NO 20)

Probe:ATGAGTGTTTCTTTTAGATAGC  (SEQ ID NO 21)

Pm2-F:ATAACATAGTTGTACGTTAAGAATAACCGC  (SEQ ID NO 22)

Pm2-R:AAAATTCCCATGCATAAAAAATTATACAAA  (SEQ ID NO 23)

Probe:GTATAATTTTTTATGCATGGGAAT  (SEQ ID NO 24)

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