[发明专利]一种快速高通量的疟原虫检测方法在审
申请号: | 201410697132.4 | 申请日: | 2014-11-26 |
公开(公告)号: | CN104561268A | 公开(公告)日: | 2015-04-29 |
发明(设计)人: | 田桢干;张子龙;李深伟;李美 | 申请(专利权)人: | 中华人民共和国上海出入境检验检疫局 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人: | 黄志达 |
地址: | 200135 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 通量 疟原虫 检测 方法 | ||
1.一种快速高通量的疟原虫检测方法,其特征在于:包括如下步骤:
(1)血液样本进行DNA液提取;
(2)PCR扩增:
a.PCR反应体系包括:PCR反应缓冲液,待测样本基因特异性正、反向引物,PCR Grade H2O,PCR Control,DNA提取液;
b.将PCR反应液加入已含有待测基因特异性探针的芯片反应室内,将芯片放入机器进行扩增反应;特异性探针是根据特异性引物扩增区内设计,能够区别其他物种;特异性探针点入芯片上;
(3)杂交:PCR扩增完后,将杂交反应液加入芯片,使杂交液和扩增液都进入到杂交舱内杂交反应;
(4)清洗:杂交后的芯片用洗液冲洗,直接用荧光扫描仪检测;
(5)结果判读;
所述的待测样本基因为恶性疟、间日疟、三日疟各自特有基因。
2.根据权利要求1所述的快速高通量的疟原虫检测方法,其特征在于:所述的特有基因分别是恶性疟的mdr、crt、18SrRNA基因,间日疟的SSUrRNA、csp、18SrRNA基因,三日疟的18SrRNA基因。
3.根据权利要求1所述的快速高通量的疟原虫检测方法,其特征在于:所述的特异性正反引物和探针是:
恶性疟原虫
mdr基因
Pf1-F:GTGTTGAAAGATGGGTAAAGAGCAGA (SEQ ID NO 1)
Pf1-R:CGTACCAATTCCTGAACTCACTTGTTC (SEQ ID NO 2)
Probe:GAACAAAAAGAGTACCGCTGAA (SEQ ID NO 3)
crt基因
Pf2-F:GGTGGAGGTTCTTGTCTTGGTAAATG (SEQ ID NO 4)
Pf2-R:CGGATGTTACAAAACTATAGTTACC (SEQ ID NO 5)
Probe:GTATTATTTATTTAAGTGTATGTGT (SEQ ID NO 6)
18SrRNA基因
Lm2-F:ATTGCTTTTGAGAGGTTTTGTTAC (SEQ ID NO 7)
Lm2-R:GCTGTAGTATTCAAACACAATGAAC (SEQ ID NO 8)
Probe:CATAACAGACGGGTAGTCAT (SEQ ID NO 9)
间日疟原虫
SSUrRNA基因
Pv1-F:AGTTCGTGAATATGATTTGTC (SEQ ID NO 10)
Pv1-R:CTGCGCTTCTGTACTTGGC (SEQ ID NO 11)
Probe:GGGGATTGCAATTATACTTCGTGTCG (SEQ ID NO 12)
csp基因
Vp2-F:GGTGAGAACCCAGATGACGAGG (SEQ ID NO 13)
Vp2-R:TGGACTCCATGCAGTGTAACCTGT (SEQ ID NO 14)
Probe:GGTGATGGAGCAGCTGTACAG (SEQ ID NO 15)
18SrRNA基因
Lm2-F:GCAACGCTTCTAGCTTAATCCAC (SEQ ID NO 16)
Lm2-R:CAAGCCGAAGCAAAGAAAGTCC (SEQ ID NO 17)
Probe:ACTTTGTGCGCATTTTGCTA (SEQ ID NO 18)
三日疟原虫
18SrRNA基因
Pm1-F:GTTAAGGGAGTGAAGACGATCAGATACCGT (SEQ ID NO 19)
Pm1-R:GCCCCAGAACCCAAAGACTTTGATTTCTCA (SEQ ID NO 20)
Probe:ATGAGTGTTTCTTTTAGATAGC (SEQ ID NO 21)
和
Pm2-F:ATAACATAGTTGTACGTTAAGAATAACCGC (SEQ ID NO 22)
Pm2-R:AAAATTCCCATGCATAAAAAATTATACAAA (SEQ ID NO 23)
Probe:GTATAATTTTTTATGCATGGGAAT (SEQ ID NO 24)
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中华人民共和国上海出入境检验检疫局,未经中华人民共和国上海出入境检验检疫局许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201410697132.4/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。