[发明专利]一种快速检测植物乳杆菌ST-III的引物及其检测方法和试剂盒有效
申请号: | 201410747460.0 | 申请日: | 2014-12-08 |
公开(公告)号: | CN104480204A | 公开(公告)日: | 2015-04-01 |
发明(设计)人: | 艾连中;王光强;夏永军;陈卫;王彦波;郭本恒;宋馨 | 申请(专利权)人: | 上海理工大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/25 |
代理公司: | 上海德昭知识产权代理有限公司 31204 | 代理人: | 郁旦蓉 |
地址: | 200093 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 检测 植物 杆菌 st iii 引物 及其 方法 试剂盒 | ||
1.一种植物乳杆菌ST-III菌株的特异性标记分子,其特征在于:
所述特异性标记分子是编码植物乳杆菌ST-III的KdpA蛋白质的基因,位于植物乳杆菌ST-III来源的pST-III质粒上。
2.如权利要求1所述的植物乳杆菌ST-III菌株的特异性标记分子,其特征在于:
所述的特异性标记分子的核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第720位至第1200位所示。
3.一种检测植物乳杆菌ST-III菌株的引物对,其特征在于:
该引物对中,一条引物和植物乳杆菌ST-III菌株的特异性标记分子的序列中的一段相同,长度为15-40bp;另一条引物和植物乳杆菌ST-III菌株的特异性分子标记的序列中的一段互补,长度为15-40bp,该引物对扩增出的片段长度为200-1773bp。
4.如权利要求3所述的检测植物乳杆菌ST-III菌株的引物对,其特征在于:
所述引物对中,一条引物的序列如SEQ ID NO.2所示,另一条引物的序列如SEQ ID NO.3所示。
5.一种检测植物乳杆菌ST-III菌株的试剂盒,其特征在于:
该试剂盒包括如权利要求3或4所述的引物对。
6.如权利要求5所述的检测植物乳杆菌ST-III菌株的试剂盒,其特征在于,还包括:
dNTP;10×PCR缓冲液和Taq DNA聚合酶。
7.一种植物乳杆菌ST-III菌株的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤一,提取待测样品菌株中的质粒DNA;
步骤二,以步骤一所得的所述质粒DNA为模板,以权利要求3或4所述的引物对进行PCR反应;
步骤三,对步骤二所得的PCR反应产物进行电泳检测,检测是否存在权利要求3或4所述的引物扩增出的片段。
8.如权利要求7所述的植物乳杆菌ST-III菌株的检测方法,其特征在于:
其中,步骤二中所述的PCR反应的反应体系包括
所述引物对,该引物对中的两种引物的浓度均为0.5mmol/L;0.2mmol/L的dNTP;1×PCR buffer;1.5mmol/L的Mg2+;0.02U/μL的Taq DNA聚合酶;以及1.0-2.0ng/μL的DNA模板。
9.如权利要求7所述的植物乳杆菌ST-III菌株的检测方法,其特征在于:
其中,步骤二中所述的PCR反应的反应程序依次为,95℃,3min;95℃下45s,55℃下45s,72℃下1min,进行30个循环;72℃,5min;4℃保存。
10.如权利要求1所述的特异性标记分子作为植物乳杆菌ST-III菌株的特征序列在检测植物乳杆菌ST-III菌株中的应用。
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