[发明专利]检测性发育相关基因变异的方法和试剂盒

说明书

本发明公开了一种试剂盒，其包括探针，所述探针固定在固相基质上或者游离于液相中，所述探针能够特异性识别X染色体上的特定的29个基因的外显子区和X染色体上的至少一个其它区域，所有的探针能够特异性识别的X染色体上的区域中的任两个相邻区域在X参考染色体上的距离不大于10M，所述探针能够特异性识别Y染色体上SRY基因的外显子区和Y染色体上的至少一个其它区域，所有的探针能够特异性识别的Y染色体上的区域中的任两个相邻区域在Y参考染色体上的距离不大于10M。同时，本发明还公开了试剂盒在检测性发育相关基因中的用途、一种检测SRY基因变异的方法、一种检测SRY基因变异的装置和一种检测性发育相关基因变异的方法。

技术领域

本发明涉及生物医学领域，具体的，本发明涉及检测性发育相关基因变异的方法和试剂盒，更具体的，本发明涉及一种试剂盒、试剂盒在检测性发育相关基因中的用途、一种检测SRY基因变异的方法、一种检测SRY基因变异的装置和一种检测性发育相关基因变异的方法。

背景技术

性发育疾病(Disorders of sex development，DSD)是性决定和性分化异常的一组异质性遗传病,是由于染色体畸变或单基因突变导致的性发育遗传和内分泌途径的改变[MacLaughlin,D.T.and P.K.Donahoe,Sex determination and differentiation.N EnglJ Med,2004.350(4):p.367-78.]。性发育疾病的发病率约为1-3‰，其中新生儿约为1/4500。分为性染色体异常、46,XY DSD和46,XX DSD三大类。

基因的各种类型的变异的发生或遗传，如点突变、插入缺失、拷贝数变异、染色体非整倍性等或者多类变异的组合，可能会使人体异常。性发育的遗传因素异质性高，涉及的基因众多、变异类型多样[Ono,M.and V.R.Harley,Disorders of sex development:newgenes,new concepts.Nat Rev Endocrinol,2013.9(2):p.79-91.]。性发育疾病在遗传因素层面，首先是通过传统的细胞遗传学方法，进行染色体核型检测分析，排除性染色体异常类型，并且确定是属于46,XY DSD还是46,XX DSD。在基因层面，目前主要集中在少数几个最常见的基因及其热点变异。对于比较常见的如SRY基因，46,XX睾丸性DSD中SRY基因阳性变异约占80％，具有非常重要的地位，46,XX睾丸性DSD中SRY基因阳性变异是由于Y染色体上的蛋白激酶PRKY与X染色体上的蛋白激酶PRKX高度同源，发生了部分区域或全部区域重组而发生的。临床上常用核型加上FISH或者PCR的方法进行检测。除了点突变、插入缺失等变异类型，不同大小的拷贝数变异(Copy Number Variant，CNV)，从单个外显子水平到几Mbp的染色体微缺失也在该疾病中占有重要地位，如46XY性反转4型/染色体9p24.3缺失综合征，46XX性反转2型/染色体17q24重复综合征，46XX性反转3型/染色体Xq26重复综合征。对于这类变异，目前主要采用FISH、MLPA、Array CGH等方法进行检测。尽管如此，新生儿DSD的检出率仍然只有20％左右，仍然面临着很大的挑战。

发明内容

本发明旨在提供至少一种商业选择或者至少一定程度解决上述问题之一。