[发明专利]一步式真核细胞多基因修饰载体构建方法有效
申请号: | 201410785444.0 | 申请日: | 2014-12-16 |
公开(公告)号: | CN104531749B | 公开(公告)日: | 2018-10-26 |
发明(设计)人: | 彭鲁英;刘畅;李丽;康志骞;王铎 | 申请(专利权)人: | 同济大学 |
主分类号: | C12N15/79 | 分类号: | C12N15/79;C12N15/66 |
代理公司: | 上海科盛知识产权代理有限公司 31225 | 代理人: | 叶敏华 |
地址: | 200092 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一步 真核细胞 多基因 修饰 载体 构建 方法 | ||
1.一步式真核细胞多基因修饰载体构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)构建过表达质粒:
1.1)确定欲过表达的基因个数为N;
1.2)将欲过表达的N个基因的CDS区按顺序分别插入到N个质粒pOE-1、pOE-2直到pOE-N中,并转化大肠杆菌感受态细胞,过夜培养;
1.3)使用定点突变的方法将基因CDS中的BsaI位点进行突变,同时保证其所编码的氨基酸不变;
1.4)使用菌落PCR筛选出阳性克隆子并扩增;
1.5)分别提取N个质粒;
2)构建敲低质粒:
2.1)确定欲敲低的基因个数为N;
2.2)将欲敲低的N个基因的shRNA oligo按顺序分别引入到N个质粒pSH-1、pSH-2直到pSH-N中,并转化大肠杆菌感受态细胞,过夜培养;
2.3)挑选3个克隆子,并测序验证;
3)构建过表达和敲低混合质粒:
3.1)将欲过表达的基因的CDS或欲敲低的基因的shRNA oligo分别引入pOE质粒和pSH质粒中;
3.2)通过测序和菌落PCR验证序列的正确性,并将BsaI位点进行突变;
4)按体积比,在离心管中顺序加入如下样品:
5)将步骤4)混合体系混匀后置于PCR仪中,进行加热反应;
6)反应结束后,取出反应物,并加入ATP和PlasmidSafe DNase,其中,反应产物、ATP与PlasmidSafe DNase体积比为16:2:2;
7)步骤6)所得体系在37℃条件下孵育,然后将反应产物转化入感受态细胞中,并涂布于含有IPTG和X-gal的kana平板上,37℃孵育过夜;
8)第二天,挑取3个蓝色菌落进行扩增;
9)第三天,提取质粒并鉴定;
所述的N为大于1的正整数,
pOE质粒均包含有一个CMV启动子、一个多克隆位点、一个bGH polyA序列、一个ori复制区和一个四环素抗性基因,并且两个BsaI位点分别位于CMV启动子上游和bGH polyA序列下游;pOE-1~pOE-10质粒区别仅仅是BsaI切割位点序列不同,其余结构部分完全相同,其中质粒pOE-1~pOE-10用于基因的过表达;
pSH质粒均包含有一个U6启动子、一个多克隆位点、一个ori复制区和一个四环素抗性基因,两个BsaI位点分别位于U6启动子上游和下游;pSH-1~pSH-10质粒区别仅仅是BsaI切割位点序列不同,其余结构部分完全相同,pSH-1~pSH-10用于基因的敲低;
pBL质粒均包含有一段100bp的非编码stuffer序列、一个多克隆位点、一个ori复制区和一个四环素抗性基因,两个BsaI位点分别位于非编码stuffer序列的上游和下游;pBL-1~pBL-10质粒区别仅仅是BsaI切割位点序列不同,其余结构部分完全相同,pBL-1~pBL-10用于填补位置空缺;
pDV质粒均包含有一个CMV启动子、一个EGFP编码序列、一个SV40polyA序列、一个SV40启动子、一个NeoR/KanaR序列、一个ori复制区和一个lacZ基因,两个BsaI位点分别位于lacZ基因的上游和下游;pDV-1~pDV-10质粒区别仅仅是BsaI切割位点序列不同,其余结构部分完全相同,pDV-1~pDV-10为最终目的载体。
2.根据权利要求1所述的一步式真核细胞多基因修饰载体构建方法,其特征在于,所述的过表达质粒、敲低质粒或过表达和敲低混合质粒提取后,将质粒浓度调整到200ng/μl。
3.根据权利要求1所述的一步式真核细胞多基因修饰载体构建方法,其特征在于,所述的pDV-N质粒浓度为25ng/μl,所述的ATP浓度为10mM。
4.根据权利要求1所述的一步式真核细胞多基因修饰载体构建方法,其特征在于,步骤5)中,进行加热反应的程序为:
37℃加热5min,然后20℃加热5min,进行20个循环后,再继续37℃加热5min,之后升温到80℃加热20min。
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