[发明专利]一种志贺氏菌的分子检测方法及其应用有效
申请号: | 201410803694.2 | 申请日: | 2014-12-23 |
公开(公告)号: | CN104531860B | 公开(公告)日: | 2018-04-03 |
发明(设计)人: | 王建昌;段永生;李静;孙晓霞;胡连霞;王金凤 | 申请(专利权)人: | 河北出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/04;C12R1/01 |
代理公司: | 石家庄新世纪专利商标事务所有限公司13100 | 代理人: | 耿佳,董金国 |
地址: | 050051 河*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 志贺氏菌 分子 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种非疾病诊断目的的志贺氏菌的分子检测方法,其特征在于,采用单引物等温扩增方法,以志贺氏菌ipaH基因特异序列为靶序列,SYBR GreenⅡ为荧光染料,实时荧光检测仪检测扩增的实时荧光信号,其具体过程包括如下步骤:
(1)取含志贺氏菌的待检样品,提取基因组DNA;
(2)建立志贺氏菌的实时荧光单引物等温扩增25 μL反应体系:
RNA/DNA组合引物 5.6μmol/L、Blocker 0.36μmol/L、10×Bst Buffer 2.5μL、Bst DNA polymerase 20U、10×RNaseH Buffer 2.5μL、RNaseH 5U、dNTPs 0.2 mmol/L、MgCl23.5mmol/L、RNase Inhibitor 16U、DNA模板1μL、SYBR GreenⅡ0.3μL,其余用灭菌DEPC水补足体系;
所述SYBR GreenⅡ为300倍稀释;
将DNA模板、组合引物、Blocker及反应缓冲液的混合液经99℃,90s处理后降温至60℃,迅速加入RNase H和Bst DNA聚合酶,在实时荧光定量PCR仪上58℃ 反应40min,反应过程中实时监测荧光信号;
(3)检测分析:分析检测数据,
所述引物为GCUUAGUGA-TTTGATGGTGTC,5’端9nt合成为RNA序列,3’端12nt合成为DNA序列;所述Blocker为TTAGATAATGTGGTA,3’端用生物素修饰,中间随机加上五个锁核酸XNA修饰,所述XNA为A、C、G、T、U或mC六种碱基中的一种。
2.根据权利要求1所述的一种非疾病诊断目的的志贺氏菌的分子检测方法,其特征在于,步骤(1)所述的提取基因组DNA方法采用普通热裂解法、蛋白酶K法、饱和酚法或水洗法结合商业化试剂盒法。
3.根据权利要求1所述的一种非疾病诊断目的的志贺氏菌的分子检测方法,其特征在于,所述提取基因组DNA方法采用商业化试剂盒法。
4.根据权利要求1所述的一种非疾病诊断目的的志贺氏菌的分子检测方法,其特征在于,步骤(2)在实时荧光定量PCR仪上反应,循环数为80个循环,每次循环30s。
5.一种权利要求1-4任一项所述的分子检测方法在食品中志贺氏菌检测的应用。
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