[发明专利]一种用于提取桑树叶片RNA的提取剂及其应用在审
申请号: | 201410856896.3 | 申请日: | 2014-12-31 |
公开(公告)号: | CN104560956A | 公开(公告)日: | 2015-04-29 |
发明(设计)人: | 郑洪坤 | 申请(专利权)人: | 北京百迈客生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君 |
地址: | 101300 北京市顺*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 提取 桑树 叶片 rna 及其 应用 | ||
技术领域
本发明涉及植物基因工程技术领域,具体涉及一种用于提取桑树叶片RNA的提取剂及其应用。
背景技术
分离获得高纯度RNA是进行RNA相关技术研究的基础和关键。桑树叶片富含多酚类和多糖类,在分离过程中会对RNA提取进行干扰。多酚类物质易氧化,氧化后形成的络合物(如醌类)能与RNA稳定结合,导致抽提过程中RNA的损失,从而影响RNA的分离纯化。多糖类物质一方面形成胶状物影响RNA的溶解,另一方面对部分酶的抑制作用则影响了提取后RNA的应用。RNA酶的高稳定性也是造成RNA极易降解和分离纯化失败的重要原因。RNA酶在RNA提取过程中有两个重要来源:内源性和外源性。外源性RNA主要来自于提取过程中使用的玻璃、塑料制品和试剂以及操作人员等,而内源性RNA酶则为组织固有,在细胞破碎时释放出来。因此,去除多酚类和多糖类污染并抑制RNA酶活性是提取高质量RNA成败的关键。目前的提取试剂盒和方法主要针对普通植物组织,对含多醣和多酚的组织样品的提取效果不佳。
公开号为CN 102807978 B的中国专利申请公开了一种提取藻类RNA的提取剂及使用方法,是将液氮处理的样品研磨后用提取液抽提。利用氯仿:异戊醇混合液进行抽提后,用高浓度氯化锂离心沉淀。用预冷的70%无水乙醇漂洗;待风干后,无RNA酶水溶解,用RNAse-free DNAse set试剂盒去除DNA;利用醋酸钠和无水乙醇沉淀RNA。在-80℃冰箱保存待用。但其不足之处在于需要额外的除DNA步骤,步骤繁琐,成本较高。
发明内容
为了解决现有技术中存在的问题,本发明的目的在于提供一种用于提取桑树叶片RNA的提取剂及其应用。
为了实现本发明的目的,本发明首先提供一种用于提取桑树叶片RNA的提取剂,所述提取剂由Tris-HCl,NaCl,EDTA,SDS和巯基乙醇,溶于RNAse固相清除剂水溶液中而成;其中,Tris-HCl的终浓度为0.05-0.2mol/L,NaCl的终浓度为0.25-1.0mol/L,EDTA的终浓度为0.01-0.04mol/L,SDS的终浓度为1%-4%,巯基乙醇的终浓度为2%-8%;所述RNAse固相清除剂水溶液的质量分数为0.1%-0.2%。
进一步地,所述提取剂的制备方法为:向Tris-HCl、NaCl、EDTA和SDS中加入质量分数为0.1-0.2%的RNAse固相清除剂水溶液,室温下静置,使用前每1mL提取剂加入20-80uL巯基乙醇。
本发明进一步提供一种桑树叶片RNA的提取方法,所述提取方法为将桑树叶片样品利用前述提取剂进行RNA的提取。
进一步地,所述方法包括下面步骤:
步骤a)处理样品:取新鲜或超低温冷冻的桑树叶片与聚乙烯吡咯烷酮混合均匀,在液氮中研磨至粉末状;
步骤b)配制权利要求1-3任一项所述的提取剂;
步骤c)抽提:将步骤a)的粉末样品倒入盛有提取液的离心管中,涡旋混匀,离心取上清,加入等体积水饱和酚:氯仿:异戊醇的混合液,涡旋混匀,离心取上清,再加入等体积氯仿:异戊醇混合液,剧烈震荡,室温混匀,离心;
步骤d)吸取:取步骤c)上层清液加入等体积的6M氯化锂,混匀静置,得粗样品;
步骤e)沉淀:将步骤d)静置后的粗样品离心弃上清,用2M氯化锂漂洗后离心弃上清;
步骤f)重悬:加入预冷的乙醇,重悬,离心弃上清,得到沉淀即为桑树叶片RNA。
更为具体地,所述方法包括下面步骤:
步骤a)处理样品:取新鲜或超低温冷冻的桑树叶片与聚乙烯吡咯烷酮混合均匀,在液氮中研磨至粉末状;
步骤b)配制权利要求1-3任一项所述的提取剂;
步骤c)抽提:将100mg步骤a)的粉末样品倒入盛有1mL提取剂的离心管中,涡旋混匀;12000rpm,4℃,离心10min;取上清,加入等体积水饱和酚:氯仿:异戊醇的混合液,涡旋混匀。15000rpm,4℃,离心15min;取上清,加入等体积氯仿:异戊醇混合液,剧烈震荡,室温混匀20min。15000rpm,4℃,离心10min;
步骤d)吸取。取步骤c)上层加入等体积6M氯化锂,轻轻混匀,-80℃静置5h/-20℃过夜,得粗样品;
步骤e)沉淀:将步骤d)静置后的粗样品离心,15000rpm,4℃,离心30min;弃上清,用400μL 2M氯化锂漂洗,15000rpm,4℃,离心20min,弃上清;
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