[发明专利]RNA修饰的简易检测方法及用该检测方法的2型糖尿病的检查方法有效
申请号: | 201480012729.9 | 申请日: | 2014-03-06 |
公开(公告)号: | CN105008551B | 公开(公告)日: | 2020-05-05 |
发明(设计)人: | 富泽一仁;魏范研;铃木健夫;铃木勉 | 申请(专利权)人: | 国立大学法人熊本大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 苗堃;金世煜 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | rna 修饰 简易 检测 方法 糖尿病 检查 | ||
1.一种检测方法,是非疾病诊断方法,用于检测tRNA中存在的RNA修饰即硫甲基化、甲基化或者牛磺酸化,所述检测方法使用1种正向引物和2种反向引物,将以下2个工序各自分别或者同时进行,用定量PCR法或者实时定量PCR法测定由各工序生成的cDNA量的差,从而检测该RNA修饰,
a.使用第1反向引物,将该RNA用作模板,通过逆转录生成cDNA的工序,其中,该第1反向引物是以与该RNA上的包含具有该RNA修饰的部位的区域互补结合的方式设计的寡核苷酸,
b.使用第2反向引物,将该RNA用作模板,通过逆转录生成cDNA的工序,其中,该第2反向引物是以与该RNA上的具有该RNA修饰的部位的3’侧的区域互补结合的方式设计的寡核苷酸。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,将所述工序a和b分别进行。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中,所述cDNA量的差是以核酸扩增反应中的核酸的扩增速度的差来进行测定的。
4.根据权利要求3所述的方法,其中,所述RNA中存在的RNA修饰是tRNA中存在的硫甲基化。
5.根据权利要求4所述的方法,其中,所述tRNA中存在的硫甲基化是与Lys对应的tRNA、与Trp对应的tRNA、与Phe对应的tRNA或者与Ser(UCN)对应的tRNA中的任一种的第37位的腺苷的硫甲基化。
6.根据权利要求5所述的方法,其中,所述tRNA中存在的硫甲基化是与Lys对应的tRNA的第37位的腺苷的硫甲基化。
7.根据权利要求1或2所述的方法,其中,所述RNA含有来自人组织或者人血液的RNA。
8.根据权利要求5所述的方法,其中,所述RNA含有来自人外周血的RNA。
9.根据权利要求6所述的方法,其中,所述RNA含有来自人外周血的RNA。
10.根据权利要求7所述的方法,其中,所述RNA含有来自人外周血的RNA。
11.一种非疾病诊断方法的检测方法,对于tRNA中存在的RNA修饰率已知的至少2个试样和RNA修饰率未知的试样分别进行权利要求1或2所述的方法,将显示出对于各试样测定的cDNA量的差的参数进行比较,从而测定未知试样中的RNA修饰率。
12.根据权利要求11所述的方法,其中,所述参数是使用第1反向引物和第2反向引物时的用于靶核酸扩增的阈值循环数(threshold cycle)的差。
13.一种非疾病诊断方法的检测方法,对于tRNA中存在的RNA修饰率未知的试样进行权利要求1或2所述的方法,将显示出对于该试样测定的cDNA量的差的参数与预先确定的标准曲线进行比较,从而测定未知试样中的RNA修饰率。
14.根据权利要求13所述的方法,其中,所述参数是使用第1反向引物和第2反向引物时的用于靶核酸扩增的阈值循环数(threshold cycle)的差。
15.一种试剂盒,其特征在于,用于检测试样中的tRNA中存在的RNA修饰即硫甲基化、甲基化或者牛磺酸化,含有1种正向引物和2种反向引物,所述2种反向引物为第1反向引物和第2反向引物,
其中,所述第1反向引物是以与该RNA上的含有具有该RNA修饰的部位的区域互补结合的方式设计的寡核苷酸,
所述第2引物是以与该RNA上的具有该RNA修饰的部位的3’侧的区域互补结合的方式设计的寡核苷酸,
通过定量PCR法或实时定量PCR法,测定使用所述第1反向引物扩增而得的DNA量与使用所述第2反向引物扩增而得的DNA量的差,从而检测该RNA修饰。
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