[发明专利]用于肿瘤分子亚型分型的方法和试剂盒在审
申请号: | 201480027494.0 | 申请日: | 2014-08-19 |
公开(公告)号: | CN105473735A | 公开(公告)日: | 2016-04-06 |
发明(设计)人: | 拉尔夫·维尔茨;克里斯托弗·内普 | 申请(专利权)人: | 拜恩科技诊断有限责任公司;斯卓蒂费尔分子病理学有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;洪欣 |
地址: | 德国美*** | 国省代码: | 德国;DE |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 肿瘤 分子 亚型分型 方法 试剂盒 | ||
1.鉴定癌症患者中肿瘤的分子亚型的体外方法,所述方法包括以下步骤:
(f)确定所述肿瘤的样本中人表皮生长因子受体2(HER2)的RNA转录本的表达水平;
(g)确定所述肿瘤的样本中雌激素受体(ESR1)的RNA转录本的表达水平;
(h)确定所述肿瘤的样本中孕酮受体(PGR)的RNA转录本的表达水平;和
(i)确定所述肿瘤的样本中增殖抗原Ki-67(Ki67)的RNA转录本的表达水平;和/或
(j)确定所述肿瘤的样本中RacGTP酶激活蛋白1(RACGAP1)的RNA转录本的表达水平。
2.如权利要求1所述的方法,其中确定HER2、ESR1、PGR和Ki67和/或RACGAP1的RNA转录本的表达水平包括确定HER2、ESR1、PGR和Ki67和/或RACGAP1的RNA转录本的表达水平是低于还是高于HER2、ESR1、PGR和Ki67和/或RACGAP1的RNA转录本的设定表达阈值。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中步骤(a)在步骤(b)、(c)和(d)和/或(e)之前进行。
4.如权利要求1至3中任一项所述的方法,其中步骤(d)和/或步骤(e)在步骤(a)、(b)和(c)之后进行。
5.如权利要求1至4中任一项所述的方法,其中步骤(a)在步骤(b)之前进行,步骤(b)在步骤(c)之前进行,并且步骤(c)在步骤(d)和/或步骤(e)之前进行。
6.如权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述分子亚型选自HER2-阳性、三阴性、管腔A型和管腔B型。
7.如权利要求1至6中任一项所述的方法,其中比HER2的RNA转录本的设定表达阈值高的HER2的RNA转录本的表达水平,将所述肿瘤的分子亚型鉴定为HER2-阳性的。
8.如权利要求1至6中任一项所述的方法,其中
-比HER2的RNA转录本的设定表达阈值低的HER2的RNA转录本的表达水平;
-比ESR1的RNA转录本的设定表达阈值低的ESR1的RNA转录本的表达水平;
-比PGR的RNA转录本的设定表达阈值低的PGR的RNA转录本的表达水平;和
-比Ki67的RNA转录本的设定表达阈值低或高的Ki67的RNA转录本的表达水平
将所述肿瘤的分子亚型鉴定为三阴性的。
9.如权利要求1至6中任一项所述的方法,其中所述分子亚型为管腔A型或管腔B型。
10.如权利要求9所述的方法,其中
-比HER2的RNA转录本的设定表达阈值低的HER2的RNA转录本的表达水平;
-比ESR1的RNA转录本的设定表达阈值高的ESR1的RNA转录本的表达水平;
-比PGR的RNA转录本的设定表达阈值高的PGR的RNA转录本的表达水平;和
-比Ki67的RNA转录本的设定表达阈值高的Ki67的RNA转录本的表达水平
将所述肿瘤的分子亚型鉴定为管腔B型。
11.如权利要求9所述的方法,其中
-比HER2的RNA转录本的设定表达阈值低的HER2的RNA转录本的表达水平;
-比ESR1的RNA转录本的设定表达阈值高的ESR1的RNA转录本的表达水平;
-比PGR的RNA转录本的设定表达阈值高的PGR的RNA转录本的表达水平;和
-比Ki67的RNA转录本的设定表达阈值低的Ki67的RNA转录本的表达水平
将所述肿瘤的分子亚型鉴定为管腔A型。
12.如权利要求9所述的方法,其中
-比HER2的RNA转录本的设定表达阈值低的HER2的RNA转录本的表达水平;
-比ESR1的RNA转录本的设定表达阈值高的ESR1的RNA转录本的表达水平;
-比PGR的RNA转录本的设定表达阈值低的PGR的RNA转录本的表达水平;和
-比Ki67的RNA转录本的设定表达阈值低或高的Ki67的RNA转录本的表达水平
将所述肿瘤的分子亚型鉴定为管腔B型。
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