[发明专利]在无细胞生物合成系统中对代谢通量的控制在审

专利信息
申请号: 201480038564.2 申请日: 2014-06-05
公开(公告)号: CN105378076A 公开(公告)日: 2016-03-02
发明(设计)人: J.R.斯沃茨 申请(专利权)人: 绿光生物科技股份有限公司;里兰斯坦福初级大学理事会
主分类号: C12N9/00 分类号: C12N9/00
代理公司: 北京市柳沈律师事务所 11105 代理人: 张文辉
地址: 美国马*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 细胞 生物 合成 系统 代谢 通量 控制
【权利要求书】:

1.一种在包含复杂的一组酶的无细胞系统中控制代谢通量率以产生感 兴趣途径的期望产物的方法,所述方法包括:

取得代谢性能的测量;

通过进行一个或多个步骤基于所述测量调整代谢性能,所述步骤包括: (i)改变所述无细胞系统中的酶水平;(ii)改变底物的供给速率,这控制 到所述无细胞系统的氧化还原通量或碳通量;(iii)改变添加到所述无细胞 系统的O2;(iv)通过改变跨膜泄露,控制电子传递系统的效率;

其中所述感兴趣途径中存在的酶催化所述期望产物的产生。

2.权利要求1的方法,其中代谢性能的测量包括测量腺嘌呤代谢物。

3.权利要求2的方法,其中所述腺嘌呤代谢物是烟酰胺腺嘌呤二核苷 酸。

4.权利要求3的方法,其中所述烟酰胺腺嘌呤二核苷酸是NAD,NADH, NADP和NADPH的一种或多种。

5.权利要求1的方法,其中所述代谢性能的测量包括测量ATP或ADP。

6.权利要求1的方法,其中连续监控并控制溶解的氧浓度和pH。

7.权利要求1的方法,其中在所述无细胞系统中改变酶的步骤包括增 加葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的活性。

8.权利要求1的方法,其中在所述无细胞系统中改变酶的步骤包括增 加磷酸葡萄糖异构酶的活性。

9.权利要求1的方法,其中在所述无细胞系统中改变酶的步骤包括增 加转氢酶的活性。

10.权利要求7-9任一项的方法,其中增加活性的步骤包括向所述无细 胞系统添加所述酶。

11.权利要求7-9任一项的方法,其中增加活性的步骤包括向所述无细 胞系统中添加所述酶的编码系列,其中所述编码序列被翻译。

12.权利要求1的方法,其中响应所述取得测量而增加O2

13.权利要求1的方法,其中改变跨膜泄露的步骤包括向所述无细胞系 统添加二硝基酚。

14.权利要求1的方法,其中当所述测量表明代谢性能将受益于NADPH 和核酮糖-5-磷酸的浓度增加时,增加葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的酶活性。

15.权利要求1的方法,其中当所述测量表明代谢性能将受益于核酮糖 -5-磷酸的浓度增加而不增加NADPH时,增加葡萄糖-6磷酸脱氢酶和转氢酶 的酶活性;增加O2;并增加质子泄露。

16.权利要求1的方法,其中当所述测量指示代谢性能将受益于丙酮酸 衍生物的浓度增加时,增加葡萄糖磷酸异构酶的酶活性;增加O2;并增加 质子泄露。

17.权利要求1的方法,其中当所述测量指示代谢性能将受益于ATP和 丙酮酸衍生物的浓度增加时,增加葡萄糖磷酸异构酶的酶活性;并增加O2

18.根据权利要求1-17任一项的方法,其中所述无细胞系统包含微生物 细胞裂解物。

19.权利要求18的方法,其中所述微生物细胞裂解物不经分级而利用。

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