[发明专利]在无细胞生物合成系统中对代谢通量的控制在审
申请号: | 201480038564.2 | 申请日: | 2014-06-05 |
公开(公告)号: | CN105378076A | 公开(公告)日: | 2016-03-02 |
发明(设计)人: | J.R.斯沃茨 | 申请(专利权)人: | 绿光生物科技股份有限公司;里兰斯坦福初级大学理事会 |
主分类号: | C12N9/00 | 分类号: | C12N9/00 |
代理公司: | 北京市柳沈律师事务所 11105 | 代理人: | 张文辉 |
地址: | 美国马*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 细胞 生物 合成 系统 代谢 通量 控制 | ||
1.一种在包含复杂的一组酶的无细胞系统中控制代谢通量率以产生感 兴趣途径的期望产物的方法,所述方法包括:
取得代谢性能的测量;
通过进行一个或多个步骤基于所述测量调整代谢性能,所述步骤包括: (i)改变所述无细胞系统中的酶水平;(ii)改变底物的供给速率,这控制 到所述无细胞系统的氧化还原通量或碳通量;(iii)改变添加到所述无细胞 系统的O2;(iv)通过改变跨膜泄露,控制电子传递系统的效率;
其中所述感兴趣途径中存在的酶催化所述期望产物的产生。
2.权利要求1的方法,其中代谢性能的测量包括测量腺嘌呤代谢物。
3.权利要求2的方法,其中所述腺嘌呤代谢物是烟酰胺腺嘌呤二核苷 酸。
4.权利要求3的方法,其中所述烟酰胺腺嘌呤二核苷酸是NAD,NADH, NADP和NADPH的一种或多种。
5.权利要求1的方法,其中所述代谢性能的测量包括测量ATP或ADP。
6.权利要求1的方法,其中连续监控并控制溶解的氧浓度和pH。
7.权利要求1的方法,其中在所述无细胞系统中改变酶的步骤包括增 加葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的活性。
8.权利要求1的方法,其中在所述无细胞系统中改变酶的步骤包括增 加磷酸葡萄糖异构酶的活性。
9.权利要求1的方法,其中在所述无细胞系统中改变酶的步骤包括增 加转氢酶的活性。
10.权利要求7-9任一项的方法,其中增加活性的步骤包括向所述无细 胞系统添加所述酶。
11.权利要求7-9任一项的方法,其中增加活性的步骤包括向所述无细 胞系统中添加所述酶的编码系列,其中所述编码序列被翻译。
12.权利要求1的方法,其中响应所述取得测量而增加O2。
13.权利要求1的方法,其中改变跨膜泄露的步骤包括向所述无细胞系 统添加二硝基酚。
14.权利要求1的方法,其中当所述测量表明代谢性能将受益于NADPH 和核酮糖-5-磷酸的浓度增加时,增加葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的酶活性。
15.权利要求1的方法,其中当所述测量表明代谢性能将受益于核酮糖 -5-磷酸的浓度增加而不增加NADPH时,增加葡萄糖-6磷酸脱氢酶和转氢酶 的酶活性;增加O2;并增加质子泄露。
16.权利要求1的方法,其中当所述测量指示代谢性能将受益于丙酮酸 衍生物的浓度增加时,增加葡萄糖磷酸异构酶的酶活性;增加O2;并增加 质子泄露。
17.权利要求1的方法,其中当所述测量指示代谢性能将受益于ATP和 丙酮酸衍生物的浓度增加时,增加葡萄糖磷酸异构酶的酶活性;并增加O2。
18.根据权利要求1-17任一项的方法,其中所述无细胞系统包含微生物 细胞裂解物。
19.权利要求18的方法,其中所述微生物细胞裂解物不经分级而利用。
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