[发明专利]应答羧胺三唑乳清酸盐的方法和多个信号转导通路的分子药效学生物标志物有效
申请号: | 201480050189.3 | 申请日: | 2014-07-30 |
公开(公告)号: | CN105531380B | 公开(公告)日: | 2021-07-13 |
发明(设计)人: | 拉希达·A·卡马利 | 申请(专利权)人: | 巧妙疗法股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 北京市金杜律师事务所 11256 | 代理人: | 苏娟 |
地址: | 美国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 应答 羧胺三唑乳清酸盐 方法 信号 转导 通路 分子 药效 生物 标志 | ||
1.用于非疾病诊断或治疗目的的基于多个信号通路的药效学生物标志物定量对羧胺三唑乳清酸盐的应答的方法,所述方法包括:
(a)从对象获得细胞样品,并且将所述细胞样品暴露于不同剂量的羧胺三唑乳清酸盐持续不同的时间段;
(b)从处理的细胞样品分离mRNA,从所述mRNA制备代表性cDNA,并且测量由羧胺三唑乳清酸盐暴露产生的细胞样品中表达的转录变化;
(c)利用Ingenuity通路分析系统,计算多个信号通路的各个药效学生物标志物的信号得分,并且定量对不同剂量的羧胺三唑乳清酸盐暴露的应答,从以下列表中选择在暴露于羧胺三唑乳清酸盐8小时和24小时后过表达的重叠基因的列表
以及
(d)通过步骤(c)所列的至少3种或更多种基因鉴定多个信号通路的各个药效学生物标志物,并且使用通过Ingenuity通路分析对每个鉴定的基因编辑的参照数据集确认多个信号通路的各个药效学生物标志物。
2.如权利要求1所述的方法,其中所述信号通路的药效学生物标志物包括至少3种或更多种基因,对于所述基因,来自以下列表的药效学生物标志物在应答于羧胺三唑乳清酸盐时由信号得分所反映地被抑制,并且其中所述信号通路包括RAS、GFS、MEKi、HDAC、NOTCH、WNTβ-连环蛋白、HSP90或EGFR
ABCC5 CYHR1 HIST3H2A POU2F3 CORO1C IFRD1 PFKP ATP6V1B1 DEPTOR HOXB13 RAMP1 DLEU2 IMPAD1 PNPT1 ATXN3 DNAL4 ING4 SEMA3G DPH3 KLK6 PSMC4 BCAS1 EIF4A2 OVGP1 SEPP1 EIF5 KPNA4 RPS6KA3 BCL2L11 EPHX2 PCMTD1 SIDT2 ENO2 LRP8 S100A2 CALCOCO1 ERBB3 PCMTD2 AREG HN1 MALL SERPINB5 CAPN13 HIST1H2AC PDIA4 BTG3 HSP90AA1 MTHFD1L SERPINB1B8 CRBN HIST1H2BD PLEKHG4 CEBPG HSPA4L PADI1 SLC7A1 SRXN1 TIPIN
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