[发明专利]用于肺癌诊断的组合物、方法和试剂盒

权利要求书

1.包含ALDOA_HUMAN、FRIL_HUMAN、LG3BP_HUMAN、TSP1_HUMAN和COIA1_HUMAN的小组在制备用于确定人类受试者的肺结节不是肺癌的方法的试剂盒中的用途，该方法包括：

(a) 将从人类受试者获得的生物样品接触蛋白水解酶以制备来自存在于该生物样品中的蛋白组的肽片段，其中该组包括ALDOA_HUMAN、FRIL_HUMAN、LG3BP_HUMAN、TSP1_HUMAN和COIA1_HUMAN，其中该生物样品选自血、血浆和血清；

(b) 将制备的来自步骤(a)的该组的肽片段与对应于制备的来自该组的肽片段的标记的合成肽片段组合；

(c)进行所选择的反应监控质谱法来测量来自步骤(b)的肽片段的丰度；

(d) 基于步骤(c)的肽片段测量和包括从FRIL_HUMAN和COIA1_HUMAN制备的肽片段的一个蛋白-蛋白相互作用计算得分；和

(e) 如果步骤(d)的得分低于预定得分，则排除该人类受试者的肺癌，其中所述预定得分获自参考人群。

2.权利要求1的用途，其中肺结节为30 mm或更小。

3.权利要求2的用途，其中肺结节介于8-30 mm之间。

4.权利要求1的用途，其中所述肺癌是非小细胞肺癌。

5.权利要求1的用途，其中该组还包括PEDF_HUMAN、MASP1_HUMAN、GELS_HUMAN、LUM_HUMAN、C163A_HUMAN和PTPRJ_HUMAN的至少一种。

6.权利要求1的用途，其中蛋白被胰蛋白酶消化而碎片化。

7.权利要求1的用途，其中该合成肽片段具有附接的同位素标记。

8.权利要求1的用途，其中每个肽片段的跃迁被确定。

9.权利要求8的用途，其中所述跃迁为：ALQASALK的跃迁是401.25和617.4，AVGLAGTFR的跃迁是446.26和721.4，GFLLLASLR的跃迁是495.31和559.4，LGGPEAGLGEYLFER的跃迁是804.4和1083.6，和VEIFYR的跃迁是413.73和598.3。

10.权利要求1的用途，其中所述得分按照测定，其中是所述样品中跃迁i的Box-Cox变换和标准化强度，βi是相应的逻辑回归系数，α是小组-特异性常数，和γ是交互作用项的系数。

11.权利要求1的用途，其中参照人群包括至少100个患有肺病况的人类受试者，且其中参照人群的每个人类受试者已基于从来自参照人群的每个人类受试者的生物样品获得的ALDOA_HUMAN、FRIL_HUMAN、LG3BP_HUMAN、TSP1_HUMAN和COIA1_HUMAN制备的肽片段的丰度，被赋予一个分值。

12.权利要求1的用途，其中如果所述得分与参照人群相比是15%或更小，则从该人类受试者中排除肺癌。

13.权利要求12的用途，其中如果所述得分与参照人群相比是10%或更小，则从该人类受试者中排除肺癌。

14.权利要求13的用途，其中如果所述得分与参照人群相比是5%或更小，则从该人类受试者中排除肺癌。

15.权利要求1的用途，其中如果所述肺结节不是肺癌，则所述人类受试者接受图像监测至少1年的时期。

16.权利要求15的用途，其中该图像监测包括胸部计算机断层成像。

17.权利要求1的用途，其中这些步骤的至少一个在计算机系统上进行。