[发明专利]抗体选择装置和方法有效
申请号: | 201480064869.0 | 申请日: | 2014-11-26 |
公开(公告)号: | CN105793850B | 公开(公告)日: | 2020-04-24 |
发明(设计)人: | V·K·夏尔马;T·E·斯沃茨;T·W·帕塔普夫 | 申请(专利权)人: | 豪夫迈·罗氏有限公司 |
主分类号: | G16H70/40 | 分类号: | G16H70/40;C07K16/00 |
代理公司: | 北京市中咨律师事务所 11247 | 代理人: | 胡志君;黄革生 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 抗体 选择 装置 方法 | ||
1.确定抗体纳入药物组合物中的适宜性的方法,其中所述方法是跨网络实施的;和/或使用计算设备,所述方法包括:
(a)设定抗体的粘度限值;
(b)从抗体结构信息的一级结构信息计算净电荷和电荷不对称性,其中所述一级结构包含轻链可变结构域VL氨基酸序列和重链可变结构域VH氨基酸序列;
(c)获得对应于净电荷的第一换算系数和对应于电荷不对称性的第二换算系数;
(d)从包含所述换算系数、净电荷和电荷不对称性的目标函数计算指标,所述指标代表粘度;和
(e)当所述指标不超过粘度限值,则确定抗体的适宜性。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述净电荷是VL氨基酸序列净电荷和VH氨基酸序列净电荷的总和。
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述电荷不对称性包含VL氨基酸序列净电荷和VH氨基酸序列净电荷的算术乘积。
4.根据权利要求1所述的方法,其中获得所述换算系数包括:从至少一种检验抗体的至少一个粘度测量的数据确定换算系数,其中抗体和检验抗体为相同抗体类别。
5.根据权利要求4所述的方法,其中获得所述换算系数还包括:从所述至少一种检验抗体的多个粘度测量的数据确定换算系数,其中每一粘度测量是在不同溶液条件下实施的。
6.根据权利要求1所述的方法,其中在目标函数中,指标的log10包含(净电荷X第一换算系数)加(电荷不对称性X第二换算系数)的总和。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法,所述方法还包括以下步骤:
(a’)从结构信息、从抗体的一个或多个互补决定区CDR的信息,计算疏水性;和
(b’)选择对应于疏水性的第三换算系数,其中目标函数还包含第三换算系数。
8.根据权利要求7所述的方法,其中疏水性包含一个或多个CDR的疏水性值的求和函数的总计。
9.根据权利要求8所述的方法,其中每个求和函数是CDR疏水性残基各值的总和与CDR亲水性残基各值的总和的比率。
10.根据权利要求8所述的方法,其中值是艾森伯格疏水性标度值。
11.根据权利要求8所述的方法,其中一个或多个CDR包含一、二、三、四、五或六个CDR。
12.根据权利要求7所述的方法,其中在目标函数中,指标的log10包含(净电荷X第一换算系数)加(电荷不对称性X第二换算系数)加(疏水性X第三换算系数)的总和。
13.生产抗体的方法,所述方法包括:
(a)设定抗体的粘度限值;
(b)从抗体结构信息的一级结构信息计算净电荷和电荷不对称性,其中所述一级结构包含轻链可变结构域VL氨基酸序列和重链可变结构域VH氨基酸序列;
(c)获得对应于净电荷的第一换算系数和对应于电荷不对称性的第二换算系数;
(d)从包含所述换算系数、净电荷和电荷不对称性的目标函数计算指标,所述指标代表粘度;和
(e)当所述指标超过粘度限值,则诱变抗体轻链和重链的可变区氨基酸序列至少之一中的一个或多个氨基酸残基,以产生目标抗体;和
(f)生产所述目标抗体。
14.根据权利要求13所述的方法,其中诱变轻链和重链的可变区氨基酸序列至少之一中的一个或多个氨基酸残基来减少疏水性、增加净电荷和减少电荷不对称性中的至少之一,从而与目标抗体的粘度相对应的指标不超过粘度限值。
15.根据权利要求13或14所述的方法,还包括:基于制造容器中流体传导元件的流体流阻设定抗体的粘度限值,所述流体流阻取决于流经所述元件的流体的粘度。
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