[发明专利]鉴定小麦新矮秆主效QTL的分子标记的引物对、方法及应用在审
申请号: | 201510015294.X | 申请日: | 2015-01-12 |
公开(公告)号: | CN104531882A | 公开(公告)日: | 2015-04-22 |
发明(设计)人: | 韩俊;刘志勇;潘金豹;谢皓;康恩宽 | 申请(专利权)人: | 北京农学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京凯特来知识产权代理有限公司 11260 | 代理人: | 郑立明;付久春 |
地址: | 102206*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴定 小麦 新矮秆主效 qtl 分子 标记 引物 方法 应用 | ||
1.一种鉴定小麦新矮秆主效QTL的分子标记的引物对,其特征在于,包括以下引物对中的一对或几对:
WGGC6079:正向引物:5’-ATGGAGGTTTGGGATCAGCA-3’(SEQ ID NO.1),反向引物:5’-ACTATGGTACACTCGTGCGT-3’(SEQ ID NO.2);
WGGC6880:正向引物:5’-CTTGCTGAGCTTGGTGGT-3’(SEQ ID NO.3),反向引物:5’-TTGTTGCTGCACCATTACCC-3’(SEQ ID NO.4);
WGGC8307:正向引物:5’-CTTTGCCGTCAACGGCCA-3’(SEQ ID NO.5),反向引物:5’-TACGTGGAGAGCAGCACTAC-3’(SEQ ID NO.6);
WGGC6073:正向引物:5’-CACAAGTACAAGGACCGCAG-3’(SEQ ID NO.7),反向引物:5’-CAACAATCTCCATTTGCTTCTGA-3’(SEQ ID NO.8)。
2.一种鉴定小麦新矮秆主效QTL分子标记的方法,其特征在于,包括以下步骤:
以所鉴定小麦材料的DNA为模板,利用权利要求1所述的引物对所述模板进行PCR扩增;PCR扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测,若检测结果为能扩增出与小麦品种北农6号DNA片段相同大小的DNA片段,则确定所鉴定小麦材料中含有新矮秆主效QTL的QPh-2A.2。
3.根据权利要求2所述的鉴定小麦新矮秆主效QTL的分子标记的方法,其特征在于,所述新矮秆主效QTL的QPh-2A.2来源于小麦品种北农6号,位于小麦2A染色体长臂上。
4.根据权利要求2或3所述的鉴定小麦新矮秆主效QTL的分子标记的方法,其特征在于,
所述分子标记WGGC6079的引物对,对所鉴定小麦材料DNA进行PCR扩增后,电泳能检测到与小麦品种北农6号相同大小的DNA片段,该DNA片段与QPh-2A.2之间遗传距离为0cM;
所述述分子标记WGGC6880的引物对,对所鉴定小麦材料DNA进行PCR扩增后,电泳能检测到与小麦品种北农6号相同大小的DNA片段,该DNA片段与QPh-2A.2之间遗传距离为0cM;
所述分子标记WGGC8307的引物对,对所鉴定小麦材料DNA进行PCR扩增后,电泳能检测到与小麦品种北农6号相同大小的DNA片段,该DNA片段与QPh-2A.2之间遗传距离为1.7cM;
所述分子标记WGGC6073的引物对,对所鉴定小麦材料DNA进行PCR扩增后,电泳能检测到与小麦品种北农6号相同大小的DNA片段,该DNA片段与QPh-2A.2之间遗传距离为3.0cM。
5.根据权利要求2或3所述的鉴定小麦新矮秆主效QTL的分子标记的方法,其特征在于,所述PCR扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测为:
(1)PCR扩增体系为:反应体系为10μL,包含10×buffer 1μL,15mmol L-1MgCl21μL,2mmol L-1dNTP 1μL,20ngμL-1引物1μL,1U Taq酶,ddH2O 4μL,20ngμL-1基因组DNA 2μL;
(2)PCR扩增程序为:94℃预变性5min;然后94℃变性45s,55℃退火45s,72℃延伸1.5min,40个循环;最后72℃后延伸10min;
(3)扩增产物的检测为:扩增产物加入3μL上样缓冲液形成检测样品,所述上样缓冲液含质量浓度为98%的甲酰胺,10mmol L-1EDTA,pH为8.0,质量浓度为0.25%的溴酚蓝和质量浓度为0.25%的二甲苯青;取3μL所述检测样品在8%非变性聚丙烯酰胺凝胶上以恒定电压100~150V,电泳3.5~4.5小时,经硝酸银染色后进行带型统计或扫描记录。
6.一种权利要求1所述的鉴定小麦新矮秆主效QTL的分子标记的引物对在小麦新矮秆分子标记辅助育种中的应用。
7.一种权利要求1所述的鉴定小麦新矮秆主效QTL的分子标记的引物对在制作小麦新矮秆材料中的应用。
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