[发明专利]检测血清中NOX1 mRNA转录水平的RT-PCR引物、评估高血糖人群并发肠癌易感性的试剂盒及评估方法在审
申请号: | 201510027147.4 | 申请日: | 2015-01-20 |
公开(公告)号: | CN104630348A | 公开(公告)日: | 2015-05-20 |
发明(设计)人: | 崔戈;鲍鹰;冯文明;郭慧慧;薛涛;王翔 | 申请(专利权)人: | 湖州市第一人民医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 湖州金卫知识产权代理事务所(普通合伙) 33232 | 代理人: | 赵卫康 |
地址: | 313000 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 血清 nox1 mrna 转录 水平 rt pcr 引物 评估 血糖 人群 并发 肠癌 感性 | ||
1.检测血清中NOX1 mRNA转录水平的RT-PCR引物,其特征在于:
引物F:5’-ATAGCAGAAGCCGACAGG-3’;
引物R:5’-CCAGTGAGACCAGCAATG-3’。
2.检测血清中NOX1 mRNA转录水平用于评估高血糖人群并发结直肠癌易感性的RT-PCR试剂盒,其特征在于包含权利要求1所述的RT-PCR引物。
3.根据权利要求2所述的RT-PCR试剂盒,其特征在于还包含内参引物,所述内参引物如下:
引物F:5'-CACCCACTCCTCCACCTTTG-3';
引物R:5'-CCACCACCCTGTTGCTGTAG-3'。
4.根据权利要求2所述的RT-PCR试剂盒,其特征在于还包含RNA提取试剂、逆转录试剂和PCR反应液;
所述RNA提取试剂的组分及浓度如下:Trizol试剂355~800ml、氯仿200~400μL、异丙醇600~1000μL、无水乙醇1.75~5.00mL、DEPC水290~1000μL;
所述逆转录试剂组分及浓度如下:150~250U/μL逆转录酶2μL、4~6×逆转录缓冲液4μL、12~50 mmol/L dNTPs 4μL、0.1~1.2mol/L DTT 2μL、35~45U/μL RNA酶抑制剂0.5μL;
所述PCR反应液组分及浓度如下:Syber GreenⅠ荧光核酸染料25μL、DNA聚合酶100U/ml、dNTPs 0.2 mmol/L、氯化镁6 mmol/L、三羟甲基氨基甲烷盐酸盐16.5 mmol/L、氯化钾89.3 mmol/L、DEPC水50μL~60μL。
5.根据权利要求4所述的RT-PCR试剂盒,其特征在于所述Trizol试剂具体为:重蒸苯酚200mL、8-羟基喹啉0.2g 、β- 巯基乙醇1.2g /二硫苏糖醇0.5g 、异硫氢酸胍100g 、蒸馏水118mL 、0.75M 柠檬酸钠7.04mL 、10%十二烷基肌氨酸钠10.56mL和2M 醋酸钠20mL。
6.根据权利要求2所述的RT-PCR试剂盒,其特征在于逆转录反应体系如下:
引物F 1μL、
引物R 1μL、
RNA模板 2μL、
逆转录酶 2μL、
5×逆转录缓冲液 4μL、
25mM dNTPs 4μL、
0.1 M DTT 2μL、
RNA酶抑制剂 0.5μL
DEPC水 余量
总体积 20μL。
7.根据权利要求2所述的RT-PCR试剂盒,其特征在于扩增体系如下:
引物F 1μL、
引物R 1μL、
cDNA模板 2μL、
SYBR Green I荧光核酸染料 2μL
DEPC水 余量
总体积 50μL。
8.通过检测血清中NOX1 mRNA转录水平来评估高血糖人群并发结直肠癌易感性的方法,包括以下步骤:
血清总RNA的提取
收集评估对象的清晨空腹外周静脉血5ml,置于冷冻离心机中,4℃下调整转速2500-3000 r/min,离心8-10min后用无菌吸管吸取血清2 ml~3ml;
将上述血清加入含有1mL Trizol试剂的匀浆管中,于匀浆机匀浆20sec,立即放于冰上;
置于超净台中,温育5min,12000r/min,离心10min;
吸上清于新的1.5mL离心管中,加入200μL的氯仿,摇匀,室温静置2min,4℃,12000r/min,离心10min;
吸取上清于新的1.5mL离心管中,加入600μL的异丙醇,混合均匀,室温静置15min,4℃,12000r/min,离心15min,弃上清;
加入1mL75%的无水乙醇漂洗沉淀,4℃,12000r/min,离心5min,弃上清;所述75%的无水乙醇的组成为750μL无水乙醇+250μL DEPC水;
加入1mL无水乙醇,漂洗沉淀,4℃,12000r/min,离心5min,弃上清,室温干燥10min;
加入40μL的DEPC水溶解RNA,置于-80℃冰箱保存备用;
逆转录合成cDNA
采用权利要求6所述的RT-PCR试剂盒进行逆转录,反应程序:42℃,50min;85℃,5min;反应结束后离心,置于-20℃保存;
Real-time PCR扩增
采用权利要求7所述RT-PCR试剂盒进行扩增,反应程序如下:95℃ ,10min;95℃,15 Sec; 60℃,1min;95℃,15 Sec;60℃,15 Sec;
验证目的基因表达
分析统计NOX1 mRNA的相对表达量,采用SDS 2.3软件分析结果,Ct为每个反应管内的荧光信号到达设定的阈值时所经历的循环数,采用比较Ct值法计算样本中NOX1 mRNA 相对表达量;计算2^(-△Ct)值表示样品中目的基因初始mRNA相对表达量,△Ct是同一个样本中目的基因Ct值减去内参Ct值;按2^(-△Ct)换算成基因表达量;以样本2的2^(-△Ct)值校正为1作为参照,计算出目的基因的相对表达量;使用SPSS19.0统计软件,计数数据以均数±标准差 表示;以P<0.05为差异有统计学意义,以P<0.01为差异有显著统计学意义。
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