[发明专利]一种检测白血病相关融合基因的引物和探针、及其试剂盒有效
申请号: | 201510028104.8 | 申请日: | 2015-01-21 |
公开(公告)号: | CN104561331A | 公开(公告)日: | 2015-04-29 |
发明(设计)人: | 程新建;丁璐;俞浩;陈伟;陈嘉铮 | 申请(专利权)人: | 苏州云泰生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京元中知识产权代理有限责任公司 11223 | 代理人: | 王明霞 |
地址: | 215100 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 白血病 相关 融合 基因 引物 探针 及其 试剂盒 | ||
1.一种检测白血病相关融合基因的引物和探针,其特征在于,所述引物和探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:1~72所示。
2.根据权利要求1所述的检测白血病相关融合基因的引物和探针,其特征在于,所述引物和探针的核苷酸序列为:
(1)用于检测SIL-TAIL融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:1所示的上游引物,由SEQ ID NO:2所示的下游引物R1,由SEQ ID NO:68所示的下游引物R2,由SEQ ID NO:3所示的探针,其中SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记;
(2)用于检测E2A-HLF融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:4所示的上游引物,由SEQ ID NO:5所示的下游引物,由SEQ ID NO:6所示的探针,其中SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列的5’端有Cy5标记,3’端有BH2标记;
(3)用于检测BCR-ABL融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:7所示的上游引物F1,由SEQ ID NO:8所示的上游引物F2,由SEQ ID NO:9所示的上游引物F3,由SEQ ID NO:10所示的下游引物,由SEQ ID NO:11所示的探针,其中SEQ ID NO:11所示的核苷酸序列的5’端有FAM标记,3’端有BH1标记;
(4)用于检测E2A-PBX1融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:4所示的上游引物,由SEQ ID NO:12所示的下游引物,由SEQ ID NO:6所示的探针,其中SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列的5’端有Cy5标记,3’端有BH2标记;
(5)用于检测MLL-AF4融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:17所示的上游引物F1,由SEQ ID NO:18所示的上游引物F2,由SEQ ID NO:13所示的下游引物R1,由SEQ ID NO:67所示的下游引物R2;由SEQ ID NO:22所示的探针P1,其中SEQ ID NO:22所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记,由SEQ ID NO:23所示的探针P2,其中SEQ ID NO:23所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记;
(6)用于检测TEL-AML1融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:14所示的上游引物,由SEQ ID NO:15所示的下游引物,由SEQ ID NO:16所示的探针,其中SEQ ID NO:16所示的核苷酸序列的5’端有FAM标记,3’端有BH1标记;
(7)用于检测MLL-AF9融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:17所示的上游引物F1,由SEQ ID NO:18所示的上游引物F2,由SEQ ID NO:19所示的下游引物R1,由SEQ ID NO:20所示的下游引物R2,由SEQ ID NO:21所示的下游引物R3,由SEQ ID NO:22所示的探针P1,其中SEQ ID NO:22所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记,由SEQ ID NO:23所示的探针P2,其中SEQ ID NO:23所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记;
(8)用于检测AML1-ETO融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:24所示的上游引物,由SEQ ID NO:25所示的下游引物,由SEQ ID NO:26所示的探针,其中SEQ ID NO:26所示的核苷酸序列的5’端有FAM标记,3’端有BH1标记;
(9)用于检测PML-RARa融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:27所示的上游引物F1,由SEQ ID NO:28所示的上游引物F2,由SEQ ID NO:29所示的上游引物F3,由SEQ ID NO:30所示的下游引物,由SEQ ID NO:31所示的探针,其中SEQ ID NO:31所示的核苷酸序列的5’端有Cy5标记,3’端有BH2标记;(10)用于检测CBF-MYH融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:32所示的上游引物,由SEQ ID NO:33所示的下游引物R1,由SEQ ID NO:34所示的下游引物R2,由SEQ ID NO:35所示的下游引物R3,由SEQ ID NO:36所示的探针,其中SEQ ID NO:36所示的核苷酸序列的5’端有FAM标记,3’端有BH1标记;
(11)用于检测DEK-CAN融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:37所示的上游引物,由SEQ ID NO:38所示的下游引物,由SEQ ID NO:39所示的探针,其中SEQ ID NO:39所示的核苷酸序列的5’端有Cy5标记,3’端有BH2标记;
(12)用于检测NPM-MLF融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:40所示的上游引物,由SEQ ID NO:41所示的下游引物,由SEQ ID NO:42所示的探针,其中SEQ ID NO:42所示的核苷酸序列的5’端有Cy5标记,3’端有BH2标记;
(13)用于检测FIPIL1-PDGFRA融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:43所示的上游引物F1,由SEQ ID NO:44所示的上游引物F2,由SEQ ID NO:45所示的上游引物F3,由SEQ ID NO:46所示的上游引物F4,由SEQ ID NO:47所示的上游引物F5,由SEQ ID NO:48所示的下游引物,由SEQ ID NO:49所示的探针,其中SEQ ID NO:49所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记;
(14)用于检测TEL-PDGFRB融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:50所示的上游引物,由SEQ ID NO:51所示的下游引物,由SEQ ID NO:52所示的探针,其中SEQ ID NO:52所示的核苷酸序列的5’端有FAM标记,3’端有BH1标记;
(15)用于检测AML1-MDS1融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:53所示的上游引物,由SEQ ID NO:54所示的下游引物R1,由SEQ ID NO:57所示的探针,其中SEQ ID NO:57所示的核苷酸序列的5’端有Cy5标记,3’端有BH2标记;
(16)用于检测MLL-AF6融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:17所示的上游引物F1,由SEQ ID NO:18所示的上游引物F2,由SEQ ID NO:58所示的下游引物,由SEQ ID NO:22所示的探针P1,其中SEQ ID NO:22所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记,由SEQ ID NO:23所示的探针P2,其中SEQ ID NO:23所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记;
(17)用于检测MLL-AF10融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:17所示的上游引物F1,由SEQ ID NO:18所示的上游引物F2,由SEQ ID NO:59所示的下游引物R1,由SEQ ID NO:60所示的下游引物R2,由SEQ ID NO:61所示的下游引物R3,由SEQ ID NO:22所示的探针P1,其中SEQ ID NO:22所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记,由SEQ ID NO:23所示的探针P2,其中SEQ ID NO:23所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记;
(18)用于检测MLL-ELL融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:17所示的上游引物F1,由SEQ ID NO:18所示的上游引物F2,由SEQ ID NO:62所示的下游引物,由SEQ ID NO:22所示的探针P1,其中SEQ ID NO:22所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记,由SEQ ID NO:23所示的探针P2,其中SEQ ID NO:23所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记;
(19)用于检测MLL-ENL融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:17所示的上游引物F1,由SEQ ID NO:18所示的上游引物F2,由SEQ ID NO:63所示的下游引物R1,由SEQ ID NO:64所示的下游引物R2,由SEQ ID NO:22所示的探针P1,其中SEQ ID NO:22所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记,由SEQ ID NO:23所示的探针P2,其中SEQ ID NO:23所示的核苷酸序列的5’端有HEX标记,3’端有BH1标记;
(20)用于检测PLZF-RARa融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:65所示的上游引物,由SEQ ID NO:30所示的下游引物,由SEQ ID NO:69所示的探针,其中SEQ ID NO:69所示的核苷酸序列的5’端有FAM标记,3’端有BH1标记;
(21)用于检测STAT5B-RARa融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:66所示的上游引物,由SEQ ID NO:30所示的下游引物,由SEQ ID NO:69所示的探针,其中SEQ ID NO:69所示的核苷酸序列的5’端有FAM标记,3’端有BH1标记;
(22)用于检测AML1-MTG16融合基因的引物和探针为:由SEQ ID NO:53所示的上游引物F1,由SEQ ID NO:56所示的上游引物F2,由SEQ ID NO:55所示的下游引物,由SEQ ID NO:57所示的探针,其中SEQ ID NO:57所示的核苷酸序列的5’端有Cy5标记,3’端有BH2标记。
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