[发明专利]一种检测胎儿三倍体的引物组、方法及试剂盒有效
申请号: | 201510033353.6 | 申请日: | 2015-01-22 |
公开(公告)号: | CN104593503A | 公开(公告)日: | 2015-05-06 |
发明(设计)人: | 冯涛 | 申请(专利权)人: | 北京嘉宝仁和医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纽乐康知识产权代理事务所(普通合伙) 11210 | 代理人: | 王珂 |
地址: | 100089 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 胎儿 三倍 引物 方法 试剂盒 | ||
1.一种利用母体外周血中血浆游离DNA检测胎儿三倍体的引物组,其特征在于,所述DNA选自人类21,18,13号染色体,针对所述21,18,13号染色体,分别设计有300对序列特异性引物,每对所述序列特异性引物包括正向引物,反向引物和中间引物,所述序列特异性引物的序列编号为SEQ ID NO:1-2700。
2.根据权利要求1所述的利用母体外周血中血浆游离DNA检测胎儿三倍体的引物组,其特征在于,与序列特异性引物相结合的序列为核心序列,所述核心序列在5′端,所述核心序列包括5-15个碱基的保护序列。
3.根据权利要求2所述的利用母体外周血中血浆游离DNA检测胎儿三倍体的引物组,其特征在于,所述序列特异性引物组中,在延伸引物5′端增加有作为接头的碱基序列。
4.根据权利要求3所述的利用母体外周血中血浆游离DNA检测胎儿三倍体的引物组,其特征在于,所述序列特异性引物的每个位点均是以游离DNA的上一段特异性序列为模板而得到的三段连续引物,所述三段引物连接后形成PCR模板。
5.根据权利要求3所述的利用母体外周血中血浆游离DNA检测胎儿三倍体的引物组,其特征在于,所述序列特异性引物在目标染色体上的序列唯一。
6.根据权利要求3所述的利用母体外周血中血浆游离DNA检测胎儿三倍体的引物组,其特征在于,所述序列特异性引物的退火温度相同。
7.根据权利要求3所述的利用母体外周血中血浆游离DNA检测胎儿三倍体的引物组,其特征在于,所述编号为SEQ ID NO:1-2700的序列特异性引物与编号为SEQ ID NO:2701-2702的通用引物序列互补性最低。
8.根据权利要求3所述的利用母体外周血中血浆游离DNA检测胎儿三倍体的引物组,其特征在于,所述编号为SEQ ID NO:1-2700的序列特异性引物与具有多态性和染色体拷贝数变异的序列不一致。
9.一种利用母体外周血中血浆游离DNA检测胎儿三倍体的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)分离、提取母体外周血血浆中的外周血游离DNA,即cfDNA;
(2)针对人类21,18和13号染色体,分别设计300对序列特异性引物,每对所述引物包括正向引物,反向引物和中间引物,所述序列特异性引物的序列编号为SEQ ID NO:1-2700;
(3)采用生物素对cfDNA末端进行标记,将标记后的cfDNA与磁珠结合,然后进行扩增,扩增产物构成文库,对扩增产物进行测序;和
(4)对正常孕妇的产检数据进行分析并建立正态分布,根据Y. M. Dennis Lo染色体异倍检测方法,对染色体拷贝数进行Z检验。
10.一种利用母体外周血中血浆游离DNA检测胎儿三倍体的试剂盒,包括:(1)PCR反应试剂,所述PCR反应试剂包括序列特异性引物、通用PCR引物、DNA聚合酶、DNA连接酶、末端转移酶、dNTPs和反应缓冲液;(2)PCR反应产物的纯化试剂,包括产物纯化磁珠及缓冲液;和(3)阴性质控品和阳性质控品,其特征在于,所述DNA选自人类21,18,13号染色体,针对所述21,18,13号染色体,分别设计有300对序列特异性引物,每对所述序列特异性引物均包括正向引物,反向引物和中间引物,所述序列特异性引物的序列编号为SEQ ID NO:1-2700。
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