[发明专利]折叠引物多重PCR疟疾分子诊断试剂盒及其检测方法有效
申请号: | 201510078743.5 | 申请日: | 2015-02-13 |
公开(公告)号: | CN104911254B | 公开(公告)日: | 2017-11-14 |
发明(设计)人: | 黄天谊;黄雨婷;张念恒;佘丹娅 | 申请(专利权)人: | 贵州省疾病预防控制中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/90 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司11002 | 代理人: | 谷庆红 |
地址: | 556000 贵州*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 折叠 引物 多重 pcr 疟疾 分子 诊断 试剂盒 及其 检测 方法 | ||
1.一种折叠引物多重PCR疟疾分子诊断试剂盒,所述诊断试剂盒由模板缓冲液和PCR单一组合试剂组成;其中所述的模板缓冲液为1×含镁模板缓冲液1.0ml×2支,或1×含镁模板缓冲液1.0ml×1支和0.1×模板缓冲液预装0.5ml管×20支,所述预装管每管400μl;其中所述的单一组合试剂为折叠引物PCR无镁单一组合试剂200μl×1支或预装PCR管折叠引物PCR无镁单一组合试剂每管10μl×20支;其特征在于:
所述的1×含镁模板缓冲液包含以下组分:30mmol Tris-HCl;30mmol KCl;15mmol(NH4)2SO4;6.6mmol MgCl2;
所述的无镁单一组合试剂包含以下组分:具有不同退火与折叠温度的折叠引物6条;Tris-HCl 30mmol/L;KCl 30mmol/L;NH4SO4 15mmol/L;TMAC 0.001mmol/L;4种核苷酸-4dNTP各200μmol/L;DNA聚合酶-Taq酶0.5U;石蜡油15μl;
所述的具有不同退火与折叠温度的折叠引物,包括疟原虫属特异公共引物一对,编号Uf-1865、Ur-2855;恶性疟原虫(PF)种特异正向引物1条,编号Ff-2545;间日疟原虫(PV)、三日疟原虫(PM)、卵形疟原虫(PO)种特异反向引物各1条,编号Vr-2343、Mr-2520、Or-2748;
所述引物的设计是在每条引物的5’端添加与3’端互补的核苷酸序列,所述3’端即第2~4碱基起至第8~18碱基,具体序列如下:
Uf-1865 5'GTCAAATGGCGTGGAAACACACTTCCCTTCTCGCCATTTGATAG 3'
Ur-2855 5'CTAAGAAGGTTCGATAACCTGTTATCCCCGGCGAACCTTCTTAC 3'
Ff-2545 5'GCTTCTGGATATTATGATAGATAACATACCAGAAG 3'
Vr-2343 5'CGGTGATGCTACTTACTTGGAGAATGTTTTGCATCACCT 3'
Mr-2520 5'GGTATAAAGGATTTTAGTTTATCTCCATGTCCTTTATACG 3'
Or-2748 5'CGGAAGGATGTAAAAGCACATTTAATATCTTATCCTTCCA 3'
所述的折叠引物中,每条属、种特异引物最佳初始退火温度间至少相差2~3℃;各条引物3’5’端互补退火的折叠温度比引物与模板靶序列的初始退火温度低1~2℃,各扩增片段之间的大小相差150bp以上。
2.如权利要求1所述的折叠引物多重PCR疟疾分子诊断试剂盒,其特征在于,所述的折叠引物中,属和种特异引物Uf-1865、Or-2748、Mr-2520、Vr-2343的浓度均为87nmol/μL;Ur-2855和Ff-2545的浓度均为70nmol/μL。
3.权利要求1或2所述的折叠引物多重PCR疟疾分子诊断试剂盒在制备同时检测和鉴定临床、流行病学样本中存在的4种疟原虫单独或混合感染产品中的用途,所述4种疟原虫为恶性疟原虫、间日疟原虫、三日疟原虫和卵形疟原虫,其中卵形疟原虫包括经典型和变异型。
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