[发明专利]用于检测树鼩副粘病毒的PCR试剂盒及其专用引物在审
申请号: | 201510086952.4 | 申请日: | 2015-02-25 |
公开(公告)号: | CN104611472A | 公开(公告)日: | 2015-05-13 |
发明(设计)人: | 贺争鸣;王淑菁 | 申请(专利权)人: | 中国食品药品检定研究院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京尚诚知识产权代理有限公司 11322 | 代理人: | 鲁兵 |
地址: | 100050*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 副粘病毒 pcr 试剂盒 及其 专用 引物 | ||
1.用于树鼩副粘病毒PCR检测的引物,是以树鼩副粘病毒血凝素基因组序列自5’端第8231-8720bp区域(序列表中SEQ ID NO:1)为对象设计的,用以检测样本中是否存在树鼩副粘病毒污染,所述引物的上游引物453-F2具有序列表中SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列,下游引物453-R2具有序列表中SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列。
2.用于检测树鼩副粘病毒的PCR试剂盒,包括权利要求1所述用于对树鼩副粘病毒进行PCR检测的引物。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括逆转录反应试剂和PCR反应试剂:
25μl逆转录反应试剂包括:5×buffer(Promega AMV Transcriptase,catalog#M5108)5μl,dNTP(浓度2.5mM)4μl,随机引物(浓度500ug/mL)0.5μl,AMV(浓度10U/ul)0.5μl,去Rnase的dH2O 7μl;
25μl PCR反应试剂包括:HS Taq酶(浓度5u/μl)0.15μl,10×buffer(TaKaRa TaqTM Hot Start Version DR007A)2.5μl,dNTP(浓度2.5mM)2μl,ddH2O 17.35μl,上游引物453-F2(浓度10μM)1μl,下游引物453-R2(浓度10μM)1μl。
4.根据权利要求2或3所述的试剂盒,其特征在于:为方便检测,所述试剂盒中还可包括阳性对照和阴性对照,所述阳性对照为树鼩副粘病毒阳性质粒,所述阴性对照为不含DNA的PCR扩增体系,如双蒸水。
5.权利要求1所述PCR引物和权利要求2-4任一所述试剂盒在树鼩副粘病毒PCR检测中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:所述树鼩副粘病毒的PCR检测方法,包括以下步骤:
1)提取样本RNA;
2)以样本RNA为模板逆转录合成其cDNA;
3)PCR检测:以步骤2)获得的cDNA为模板,在上述专用引物的引导下进行PCR扩增,反应结束后对PCR扩增产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳,若能扩增出长度为453bp的目的片段,则检测结果为阳性,反之为阴性。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于:所述步骤1)的样本是从树鼩身上分离得到的血液、粪便或肾组织。
8.根据权利要求6所述的应用,其特征在于:所述步骤2)中是在合适的反应体系中,通过逆转录酶的催化,以样本RNA为模板合成其DNA(cDNA)的过程,所述25μl逆转录反应体系为:样本RNA(浓度0.25ug/ul)8μl,5×buffer(Promega AMV Transcriptase,catalog#M5108)5μl,dNTP(浓度2.5mM)4μl,随机引物(浓度500ug/mL)0.5μl,AMV(浓度10U/ul)0.5μl,去Rnase的dH2O 7μl;所述逆转录反应条件为:37℃90min,72℃15min,4℃5min。
9.根据权利要求6所述的应用,其特征在于:所述步骤3)是以样本RNA的逆转录产物为模板,在合适的反应体系中,用本发明的特异性引物与cDNA相应位置互补结合,经过DNA的变性(基因组双链解成单链)、退火(引物与模板结合)、延伸(从引物3’端合成新链)3个阶段的循环重复,目的片段被放大,再通过琼脂糖凝胶电泳进行树鼩副粘病毒的定性检测;所述25μl PCR反应体系包括:cDNA(浓度50ng/μl)1μl,HS Taq酶(浓度5u/μl)0.15μl,10×buffer(TaKaRa TaqTM Hot Start Version DR007A)2.5μl,dNTP(浓度2.5mM)2μl,ddH2O 17.35μl,上游引物453-F2(浓度10μM)1μl,下游引物453-R2(浓度10μM)1μl;所述PCR反应条件为:先94℃5min;然后94℃1min,48℃1min,72℃1min,共35个循环;最后72℃10min。
10.根据权利要求6-9任一所述的应用,其特征在于:所述步骤3)PCR反应体系中还包括阳性对照和阴性对照,所述阳性对照为树鼩副粘病毒阳性质粒,所述阴性对照为不含DNA的PCR扩增体系,如双蒸水。
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