[发明专利]一种高灵敏度菊花B病毒的检测引物、方法及应用在审
申请号: | 201510100532.7 | 申请日: | 2015-03-06 |
公开(公告)号: | CN104673938A | 公开(公告)日: | 2015-06-03 |
发明(设计)人: | 管志勇;吴丹;宋爱萍;蒋甲福;陈发棣;王海滨;张飞;陈素梅;房伟民;赵爽 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/94 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 徐冬涛 |
地址: | 211225 江苏省南京市溧*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 灵敏度 菊花 病毒 检测 引物 方法 应用 | ||
1.一种高灵敏度菊花B病毒的检测引物,其特征在于:该引物为CVB1-F,CVB1-R;CVB2-F,CVB2-R;
其中,CVB1-F序列为:AGTCACAATGCCTCCCAAAC,
CVB1-R序列为:CATACCTTTCTTAGAGTGCTATGCT;
CVB2-F序列为:TCTGAAGGTGAGCCAAGCG,
CVB2-R序列为:CATATCCTCGGAAGTAGCCATG。
2.一种高灵敏度菊花B病毒检测方法,其特征在于,该方法包括如下步骤:
(1)设计针对菊花B病毒的两轮特异性引物:
CVB1-F序列为:AGTCACAATGCCTCCCAAAC,
CVB1-R序列为:CATACCTTTCTTAGAGTGCTATGCT;
CVB2-F序列为:TCTGAAGGTGAGCCAAGCG,
CVB2-R序列为:CATATCCTCGGAAGTAGCCATG;
(2)以CVB1-R为引物对待检测菊花DNA进行反转录,得到cDNA,并以步骤(1)所述两轮特异性引物进行巢式PCR扩增;
(3)将步骤(2)进行的第二轮PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,当获得381bp特异性片段时,表示待检测菊花感染菊花B病毒即CVB。
3.权利要求2所述的高灵敏度菊花B病毒检测方法,其特征在于:步骤(2)的RT-PCR反应体系,其中,第一轮PCR25μl体系为:
0.2μlTaq酶;
17.5μlddH2O。
以第一轮产物为第二轮反应物,第二轮PCR25μl体系为:
0.2μlTaq酶;
17.5μlddH2O。
4.权利要求2所述的高灵敏度菊花B病毒检测方法,其特征在于,步骤(2)所述RT-PCR反应程序设定为:
第一轮94℃预变性3min,94℃变性30s,53℃退火45s,72℃延伸40s,循环35次,72℃延伸7min;
第二轮94℃预变性3min,94℃变性30s,56℃退火45s,72℃延伸40s,循环35次,72℃延伸7min。
5.权利要求2-4任一项所述的高灵敏度菊花B病毒检测方法,其特征在于:以1μlcDNA模板加入25μl反应体系计量,需要cDNA模板稀释度≤10-9,即灵敏度≤10-9ug/ul。
6.一种检测菊花B病毒的试剂盒,其特征在于:该试剂盒包括权利要求1所述的引物,CVB1-F,CVB1-R;CVB2-F,CVB2-R。
7.权利要求1所述的引物在检测菊花B病毒上的应用。
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