[发明专利]一种选择性扩增RNA的方法在审
申请号: | 201510102011.5 | 申请日: | 2015-03-09 |
公开(公告)号: | CN104673786A | 公开(公告)日: | 2015-06-03 |
发明(设计)人: | 邓亚光;邓伟平 | 申请(专利权)人: | 武汉格蓝丽富科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京华沛德权律师事务所 11302 | 代理人: | 刘杰 |
地址: | 430075 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 选择性 扩增 rna 方法 | ||
1.一种选择性扩增RNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)由cDNA合成探针结合到RNA模板上,在有RNA转录酶的条件下,合成第一链cDNA;
(2)在有RNA酶的条件下,对结合的RNA进行切割;
(3)在有DNA合成酶的条件下,合成第二链cDNA;
(4)在RNA转录酶存在的条件下,合成cDNA合成探针中RNA部分的cDNA;
(5)在RNA酶存在的条件下,酶切结合的cDNA合成探针的RNA部分;
(6)在cDNA扩增探针存在的条件下,cDNA扩增探针结合到空出的部位,在DNA合成酶(DNAPolymerase)的作用下,扩增cDNA产物;
(7)通过改变cDNA扩增探针和cDNA合成探针的核苷酸的相同序列程度,可调式cDNA扩增的温度条件。
2.根据权利要求1所述的选择性扩增RNA的方法,其特征在于,所述cDNA合成探针是一种由DNA和RNA片段连成的杂交探针,定位性或随机性结合的探针。
3.据权利要求2所述的选择性扩增RNA的方法,其特征在于,所述cDNA合成探针的DNA部分是和要扩增的RNA有配对结合的,其RNA部分原则上是整个RNA样本中没有完全一样的,序列结构特殊;
所述cDNA合成探针的DNA部分是用来合成RNA的第一和第二cDNA链,其RNA部分是为了在合成的第二cDNA链上带有该RNA配对结构的cDNA,作为cDNA扩增的结合点和启动点。
4.据权利要求3所述的选择性扩增RNA的方法,其特征在于,为达到高效、全面扩增RNA的目的,需要连续合成第一和第二cDNA链,以提高探针模板的合成效率。
5.根据权利要求1所述的选择性扩增RNA的方法,其特征在于,所述cDNA扩增探针也是一种DNA和RNA片段连成的杂交探针,而且cDNA扩增探针和由cDNA合成探针可有一个碱基或多个碱基不配对。
6.根据权利要求1所述的选择性扩增RNA的方法,其特征在于,所述要扩增的RNA样本可以为RNA样本、多细胞或者为单个细胞。
7.根据权利要求6所述的选择性扩增RNA的方法,其特征在于,如果为RNA样本,可以调制在蒸馏水或缓冲液中;如果是多细胞或者单细胞,则可以调制在细胞裂解液或缓冲液中。
8.根据权利要求7所述的选择性扩增RNA的方法,其特征在于,如果为RNA样本,还包括定量小样本的RNA或裂解细胞处理,合成第一cDNA链、合成第二cDNA链以及扩增cDNA步骤。
9.根据权利要求1所述的选择性扩增RNA的方法,其特征在于,所述该扩增法是线性扩增,扩增后的产物是cDNA,扩增的产物可以直接用于PCR,定量PCR或各种基因芯片分析。
10.根据权利要求1所述的选择性扩增RNA的方法,其特征在于,所述该扩增法可以扩增样本中所有的、不同大小的RNA,或者设计定位的扩增探针,扩增所需要扩增的RNA。
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