[发明专利]卵形鲳鲹家系亲子鉴定的方法有效
申请号: | 201510128615.7 | 申请日: | 2015-03-24 |
公开(公告)号: | CN104694660B | 公开(公告)日: | 2017-06-09 |
发明(设计)人: | 骆剑;陈国华;张国庆;吴光灿;王珺 | 申请(专利权)人: | 海南大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 海口翔翔专利事务有限公司46001 | 代理人: | 张耀婷 |
地址: | 570228 *** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 卵形 家系 亲子鉴定 方法 | ||
1.一种卵形鲳鲹家系亲子鉴定的方法,该方法包括如下步骤:
1)选择卵形鲳鲹体型较大,生长速度较快的个体87尾作为亲本,将亲本混合进行人工繁殖;待鱼苗长到10公分时随机选取1万尾转入网箱养殖,作为用于亲子鉴定的家系群体;
2)选取步骤1)的卵形鲳鲹繁殖亲本的鳍条组织,提取基因组DNA,以DNA为模板,选用51对微卫星引物进行巢式PCR扩增;
3)步骤2)所述的巢式PCR扩增方法指PCR体系内包含3个引物:位点特异性正向引物,其5’末端加M13序列5’-TGTAAAACGACGGCCAGT-3’;位点特异性反向引物;FAM、PET、VIC、NED四种荧光标记的M13通用引物;PCR反应体系20μL:50ng DNA,2μL dNTP,2μL 10×Buffer mixture,1U rTaq,0.4μL的含加通用引物M13的正向引物10mM,0.5μL反向引物,0.1μL的荧光标记通用引物,ddH2O补足;
4)卵形鲳鲹亲本在51个微卫星位点的PCR产物经ABI3730型基因分析仪,根据荧光标记进行基因型分析,使用Genemapper3.7软件模拟分析,筛选出适合鉴定卵形鲳鲹混养家系的有效微卫星位点11个:ZD13、ZD15、TBG008、ZD02、ZD03、ZD04、ZD11、ZD12、ZD01、ZD10、TBG016;所述11个有效微卫星位点是由以下引物序列5’-3’扩增获得:
ZD13-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGGCTAGCTTTGCATTGTGTG;
ZD13-R:CAGCCCAGTCAGTCCCTACT;
ZD15-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGACGTGTTCCACAGCAAGAA;
ZD15-R:AGGAATGGTCCCAAAGAATG;
TBG008-F:TGTAAAACGACGGCCAGTTCGCGACAAACTTTAACTCATCTC;
TBG008-R:AGCATTTTCACCTCCTCCATTG;
ZD02-F:TGTAAAACGACGGCCAGTTTTAGGACACCATCCCCTCA;
ZD02-R:GCTCCTGTGGAGGACAGAGA;
ZD03-F:TGTAAAACGACGGCCAGTATATCAGCGTCCACCCAAAC;
ZD03-R:CTTTTCCATCTCTCCCCTCA;
ZD04-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGCTTGTGGAGACCATGACG;
ZD04-R:CTCCTGGAGGAACTGTGGAG;
ZD11-F:TGTAAAACGACGGCCAGTAGAGAGCAGGACGTCCAAAA;
ZD11-R:CTTTTCCATCTCTCCCCTCA;
ZD12-F:TGTAAAACGACGGCCAGTCCACCATCAATCAGCTGTCA;
ZD12-R:AGGTGCTCCACAGATGTTCC;
ZD01-F:TGTAAAACGACGGCCAGTTGCTTGAAAAATCAGGCAAG;
ZD01-R:TGCCAGGGAAAAGAGAGAGA;
ZD10-F:TGTAAAACGACGGCCAGTGGTCTGTAGAGAACCAGAACAGTC;
ZD10-R:GCTCCTGTGGAGGACAGAGA;
TBG016-F:TGTAAAACGACGGCCAGTTCTAGAAATACATCCTGGGTCACT;
TBG016-R:GAACCGGAGTCTGTAAACAAGAT;
5)将卵形鲳鲹1万条子代混养7月龄,随机选取2000尾个体,在每条鱼的背部肌肉植入电子标记并剪取每个个体鳍条组织,提取个体基因组DNA,选取步骤4)中的11个有效微卫星位点,分析子代的基因型;
6)根据亲本和子代在11个微卫星位点的基因型,采用PAPA 2.0软件对不同子代进行区分,鉴定子代个体的父母本。
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