[发明专利]军团菌毒力基因检测与分型方法在审

专利信息
申请号: 201510156361.X 申请日: 2015-04-03
公开(公告)号: CN104988211A 公开(公告)日: 2015-10-21
发明(设计)人: 朱庆义;詹晓勇;胡朝晖 申请(专利权)人: 广州金域医学检验中心有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/01
代理公司: 北京精金石专利代理事务所(普通合伙) 11470 代理人: 刘晔
地址: 510330 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 军团 毒力 基因 检测 方法
【权利要求书】:

1.军团菌毒力基因检测与分型方法,其特征在于:应用细菌基因组DNA提取液提取待测样品中的细菌基因组DNA;以细菌基因组DNA为模板,用PCR上下游引物混合液进行PCR扩增,同时将阳性对照和阴性对照进行PCR扩增,将所得的PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳;若出现条带,则说明标本中含有与PCR上下游引物对应的军团菌毒力基因;反之,则说明标本中不含与PCR上下游引物对应的军团菌毒力基因;其中,所述PCR上下游引物混合液为10对引物,具体为:

(1)iraA-F:5’-CCTGTAGCGCAACAACAACT-3’;

     iraA-R:5’-CCAGGTGCCCTCTATTCCAA-3’;

(2)iraB-F:5’-CGCATCCAGTATGGTTTCTC-3’;

     iraB-R:5’-AACGTTTCGCAAAATTCAAG-3’;

(3)lvrA-F:5’-CAAAGAACAACGCACAAGCA-3’;

     lvrA-R:5’-TCAAGCCAATTTGCTGGGT-3’;

(4)lvrB-F:5’-TAAAACGATGGAGCCAATC-3’;

     lvrB-R:5’-ACCTGCAATGATGATGCAAG-3’;

(5)lvhD-F:5’-CAAAATTCAACGCCTGACCG-3’;

     lvhD-R:5’-AGGCCAGCCAATCATCAAATC-3’;

(6)cpxR-F:5’-AAAATCCCAACTCCCAAAC-3’;

     cpxR-R:5’-CGATACTGCGGTCATAAGC-3’;

(7)cpxA-F:5’-ACAACCAGCTCGAGAGGA-3’;

     cpxA-R:5’-GCCATCACTTGGGAGTTC-3’;

(8)dotA-F:5’-TTGGTGCAGCCGATAAAAT-3’;

     dotA-R:5’-ACCCCACAAGGTGGACTCTT-3’;

(9)icmC-F:5’-ATGGAGAAGCCAGGACAA-3’;

     icmC-R:5’-ACCCGGATAATCATCACCA-3’;

(10)icmD-F:5’-GGCTAGTAAGCGCAGCTTG-3’;

      icmD-R:5’-CCCAATCCAGCCAAGTAAG-3’。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述军团菌毒力基因为:iraAiraBlvrAlvrBlvhDcpxRcpxAdotAicmCicmD

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述细菌基因组DNA提取液的配方为:Chelex 100 resin 5%;Tris-HCl 10 mM,pH8.3;乙二胺四乙酸二钠 0.1 mM;叠氮钠 0.1 %;蛋白酶K 200μg/ml。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述PCR扩增条件为:94℃ 3 min, 94℃ 30 s, 57℃ 30 s, 72℃ 20 s,35个循环,72℃ 5 min, 4℃ 贮存。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述阳性对照包含军团菌基因组DNA和特异引物,所述阴性对照包含特异引物;所述特异引物为:Leg386F: 5'-AGGGTTGATAGGTTAAGAGC-3';Leg386R: 5'-CCAACAGCTAGTTGACATCG-3'。

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