[发明专利]军团菌毒力基因检测与分型方法在审
申请号: | 201510156361.X | 申请日: | 2015-04-03 |
公开(公告)号: | CN104988211A | 公开(公告)日: | 2015-10-21 |
发明(设计)人: | 朱庆义;詹晓勇;胡朝晖 | 申请(专利权)人: | 广州金域医学检验中心有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/01 |
代理公司: | 北京精金石专利代理事务所(普通合伙) 11470 | 代理人: | 刘晔 |
地址: | 510330 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 军团 毒力 基因 检测 方法 | ||
1.军团菌毒力基因检测与分型方法,其特征在于:应用细菌基因组DNA提取液提取待测样品中的细菌基因组DNA;以细菌基因组DNA为模板,用PCR上下游引物混合液进行PCR扩增,同时将阳性对照和阴性对照进行PCR扩增,将所得的PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳;若出现条带,则说明标本中含有与PCR上下游引物对应的军团菌毒力基因;反之,则说明标本中不含与PCR上下游引物对应的军团菌毒力基因;其中,所述PCR上下游引物混合液为10对引物,具体为:
(1)iraA-F:5’-CCTGTAGCGCAACAACAACT-3’;
iraA-R:5’-CCAGGTGCCCTCTATTCCAA-3’;
(2)iraB-F:5’-CGCATCCAGTATGGTTTCTC-3’;
iraB-R:5’-AACGTTTCGCAAAATTCAAG-3’;
(3)lvrA-F:5’-CAAAGAACAACGCACAAGCA-3’;
lvrA-R:5’-TCAAGCCAATTTGCTGGGT-3’;
(4)lvrB-F:5’-TAAAACGATGGAGCCAATC-3’;
lvrB-R:5’-ACCTGCAATGATGATGCAAG-3’;
(5)lvhD-F:5’-CAAAATTCAACGCCTGACCG-3’;
lvhD-R:5’-AGGCCAGCCAATCATCAAATC-3’;
(6)cpxR-F:5’-AAAATCCCAACTCCCAAAC-3’;
cpxR-R:5’-CGATACTGCGGTCATAAGC-3’;
(7)cpxA-F:5’-ACAACCAGCTCGAGAGGA-3’;
cpxA-R:5’-GCCATCACTTGGGAGTTC-3’;
(8)dotA-F:5’-TTGGTGCAGCCGATAAAAT-3’;
dotA-R:5’-ACCCCACAAGGTGGACTCTT-3’;
(9)icmC-F:5’-ATGGAGAAGCCAGGACAA-3’;
icmC-R:5’-ACCCGGATAATCATCACCA-3’;
(10)icmD-F:5’-GGCTAGTAAGCGCAGCTTG-3’;
icmD-R:5’-CCCAATCCAGCCAAGTAAG-3’。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述军团菌毒力基因为:iraA,iraB,lvrA,lvrB,lvhD,cpxR,cpxA,dotA,icmC,icmD。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述细菌基因组DNA提取液的配方为:Chelex 100 resin 5%;Tris-HCl 10 mM,pH8.3;乙二胺四乙酸二钠 0.1 mM;叠氮钠 0.1 %;蛋白酶K 200μg/ml。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述PCR扩增条件为:94℃ 3 min, 94℃ 30 s, 57℃ 30 s, 72℃ 20 s,35个循环,72℃ 5 min, 4℃ 贮存。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述阳性对照包含军团菌基因组DNA和特异引物,所述阴性对照包含特异引物;所述特异引物为:Leg386F: 5'-AGGGTTGATAGGTTAAGAGC-3';Leg386R: 5'-CCAACAGCTAGTTGACATCG-3'。
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