[发明专利]一种肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶基因型检测方法有效
申请号: | 201510188841.4 | 申请日: | 2015-04-20 |
公开(公告)号: | CN104774949B | 公开(公告)日: | 2017-08-11 |
发明(设计)人: | 朱海燕;顾建忠;葛斌文;金大智;吴方 | 申请(专利权)人: | 海宁市疾病预防控制中心;浙江安宁生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/10;C12R1/22 |
代理公司: | 杭州天正专利事务所有限公司33201 | 代理人: | 黄美娟,李世玉 |
地址: | 314400 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 肺炎 克雷伯菌碳 青霉 基因型 检测 方法 | ||
1.一种非疾病诊断目的的肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶基因型检测方法,其特征在于所述方法为:以待测菌株基因为模板,在引物1和引物2作用下进行PCR扩增反应,然后以扩增产物为模板,在引物3-引物8的混合引物作用下进行SNaPshot PCR反应,对SNaPshot PCR产物进行测序;
若SNaPshot PCR产物在147位、308位和814位均为C碱基,272位为T碱基,502位为G碱基,716位为A碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-1或KPC-2;
若SNaPshot PCR产物在147位、308位为C碱基,272位和814位为T碱基,502位为G碱基,716位为A碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-3;
若SNaPshot PCR产物在147位、716位和814位为C碱基,在308位和502位为G碱基,在272位为T碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-4;
若SNaPshot PCR产物在147位和814位为C碱基,在308位和502位为G碱基,在272位为T碱基,在716位为A碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-5;
若SNaPshot PCR产物在147位、308位、716位和814位为C碱基,在272位为T碱基,在502位为G碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-6;
若SNaPshot PCR产物在147位、272位和814位为T碱基,在308位为C碱基,在502位为G碱基,在716位为A碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-7;
若SNaPshot PCR产物在147位、308位和716位为C碱基,在272位和814位为T碱基,在502位为G碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-8;
若SNaPshot PCR产物在147位和308位为C碱基,在272位和814位为T碱基,在502位和716位为G碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-9;
若SNaPshot PCR产物在147位为C碱基,在308位和502位为G碱基,在272位和814位为T碱基,716位为A碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-10;
若SNaPshot PCR产物在147位和814位为C碱基,在502位为G碱基,在308位和272位为T碱基,716位为A碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-11;
若SNaPshot PCR产物在147位、308位和814位为C碱基,在272位和502位为T碱基,716位为A碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-12;
若SNaPshot PCR产物在147位、308位和272位为C碱基,在502位为G碱基,在814位为T碱基,716位为A碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-13;
若SNaPshot PCR产物在147位、308位、272位和814位为C碱基,在502位为G碱基,716位为A碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-14;
若SNaPshot PCR产物在147位和716位为C碱基,在308位和502位为G碱基,在272位和814位为T碱基,则待测菌株的碳青霉烯酶基因型为KPC-15;
引物1为:5’-CTGTATCGCCGTCTAGTTCTGCTGT-3’;
引物2为:5’-CAGAGCCTTACTGCCCGTTGA-3’;
引物3为:5’-(T)3GCGCCTGAGCCGGTATC-3’;
引物4为:5’-(T)9GCAAAAATGCGCTGGTTC-3’;
引物5为:5’-(T)14CCGTAACGGATGGGTGTG-3’;
引物6为:5’-(T)20GGGATGGCGGAGTTCA-3’;
引物7为:5’-(T)28GTCATTTGCCGTGCCATAC-3’;
引物8为:5’-(T)38GCGCCTAACAAGGATGACAAG-3’。
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