[发明专利]一种与猪产仔数相关的CNV标记及其应用有效
| 申请号： | 201510191179.8 | 申请日： | 2015-04-21 |
| 公开（公告）号： | CN104846080B | 公开（公告）日： | 2018-05-25 |
| 发明（设计）人： | 刘剑锋;杨凯捷;郑先瑞;赵鹏举;王海飞 | 申请（专利权）人： | 中国农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人： | 王文君;黄爽 |
| 地址： | 100193 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 拷贝数 猪产仔数 产仔数 引物 标记辅助选择 应用 产仔数性状 关联分析 候选分子 候选区域 总产仔数 试剂盒 猪品种 活仔 数极 性状 繁殖 检测 表现 | ||
1.一种与猪产仔数相关的CNV标记，其特征在于，所述CNV标记是指猪AHR基因候选区域内的拷贝数变异，所述CNV标记的拷贝数为1或2；
用于扩增所述CNV标记的引物对为：正向引物F：5’-ACTACCACCCATCTTCACCCG-3’和反向引物R：5’-CAACACACATCAATGCTTCCC-3’。
2.用于检测与猪产仔数性状相关的CNV标记的引物对，其特征在于，所述引物对为：正向引物F：5’-ACTACCACCCATCTTCACCCG-3’和反向引物R：5’-CAACACACATCAATGCTTCCC-3’。
3.用于实时荧光定量PCR检测权利要求1所述CNV标记的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒含有权利要求2所述的引物对。
4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括2×SYBR Green qPCRMix、去离子水、对照样本中的一种或几种。
5.根据权利要求4所述的试剂盒，其特征在于，所述对照样本为已知无拷贝数变异的样品。
6.权利要求1所述CNV标记在鉴定产仔数和产活仔数高的猪品种中的应用。
7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，包括以下步骤：
(1)提取待测猪的基因组DNA；
(2)以待测猪的基因组DNA为模板，利用权利要求2所述的引物F和R，进行实时荧光定量PCR检测所述与猪产仔数相关的CNV标记；
(3)根据所述与猪产仔数相关的CNV标记的检测结果，如果拷贝数为2，则待测猪表现为高产仔数和产活仔数；如果拷贝数为1，则待测个体表现为低产仔数和产活仔数。
8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，步骤(2)中进行实时荧光定量PCR所使用的扩增体系以20μl计为：50ng/μl模板DNA1μl，10pmol/μl引物F和R各1μl，2×SYBR GreenqPCR Mix 10μl，去离子水7μl。
9.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，步骤(2)中进行实时荧光定量PCR所采用的反应条件为：1)预变性：95℃5分钟；2)扩增反应：95℃10秒，60℃10秒，72℃10秒，45个循环；72℃10分钟；3)绘制熔解曲线：95℃5秒，65℃1分钟，97℃10秒。
10.权利要求1所述CNV标记在与猪产仔数性状相关的分子标记辅助育种中的应用。
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