[发明专利]基于流式细胞术测定浅水湖泊中异养细菌大小的方法在审
申请号: | 201510218507.9 | 申请日: | 2015-04-30 |
公开(公告)号: | CN104777091A | 公开(公告)日: | 2015-07-15 |
发明(设计)人: | 龚伊;高光;汤祥明;邵克强 | 申请(专利权)人: | 中国科学院南京地理与湖泊研究所 |
主分类号: | G01N15/14 | 分类号: | G01N15/14 |
代理公司: | 江苏致邦律师事务所 32230 | 代理人: | 徐蓓 |
地址: | 210008 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 细胞 测定 浅水 湖泊 中异养 细菌 大小 方法 | ||
1.一种基于流式细胞术测定浅水湖泊中异养细菌大小的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)样品固定:在待测样品中加入终体积浓度为0.5-1.5%,优选1%的固定剂,避光2-4小时;
(2)样品前处理:吸取至少500μl样品,用无菌水1:8-1:12,优选1:10稀释后进行超声波处理;
(3)样品染色:吸取1ml样品,在样品中加入特异性核酸染料SYBR Green Ⅰ,避光静置;
(4)样品的流式细胞分析:将样品管放置于流式细胞仪的样品台上,通过流式细胞仪对样品进行测试,采集前向散射光FSC、侧向散射光SSC、FL1通道的核酸染料SYBR GreenⅠ绿色荧光信号、FL3通道的自养浮游生物的叶绿素a红色荧光信号数据;其中以核酸染料SYBR GreenⅠ绿色荧光信号设置域值,利用绿色荧光信号将浅水湖泊中的浮游生物与非生物颗粒、细胞碎屑区分开来,同时根据FL3通道采集的自养浮游生物的叶绿素a的红色荧光信号,将细菌与浮游藻类区分开来,最后通过流式细胞仪测试异养细菌的FSC值代表细菌大小;
(5)细菌大小标准曲线的绘制:选取不同粒径规格标准绿色微球,利用流式细胞仪分别进行测试,采集前向散射光FSC、侧向散射光SSC、FL1通道的绿色荧光信号,通过多次测定它们的FSC值,建立细胞粒径与FSC 的关系;
(6)数据分析:通过流式细胞仪分析软件分析采集到的数据,利用前向散射光与侧向散射光的不同,排除微型浮游生物对细菌检测的影响;依据核酸染料SYBR GreenⅠ绿色荧光信号的强弱,将浮游生物与非生物颗粒、细胞碎屑区分开来;根据自养浮游生物的叶绿素a红色荧光信号的强弱,将细菌与浮游藻类区分开来,从而获得目标对象样品中的异养细菌,通过流式细胞仪得到异养细菌前向散射光FSC值,再根据细菌大小的标准曲线计算出样品中异养细菌的大小。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的固定剂为甲醛,多聚甲醛或戊二醛中的一种,优选甲醛。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(2)中所述的超声波处理条件Es=P*t/V=1400-1600 KJ/L,其中P为超声功率,t为超声时间,V为样品体积。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述超声功率P为10-100W,超声时间t为2-30min,样品体积V为1-100ml。
5.根据权利要求3或4所述的方法,其特征在于,超声波处理条件Es=P*t/V=1500KJ/L,其中超声功率P为25W,超声时间t为5min,样品体积V为5ml。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(3)中向样品中加入特异性核酸染料SYBR GreenⅠ对其进行染色;黑暗静置15-30min。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述的特异性核酸染料SYBR GreenⅠ先用TE进行1:100稀释作为母液,漩涡振荡30s,再取母液进行1:100稀释,至特异性核酸染料SYBR GreenⅠ终浓度为10-4,向1ml样品中加入10uL母液使特异性核酸染料SYBR GreenⅠ终浓度为10-4,黑暗静置20min。
8.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(4)利用流式细胞仪对样品进行分析时,根据纯培养细菌在流式细胞图中的分布位置,调节各个检测器的电压值,调整仪器的设置,将样品置于流式细胞仪样品管中,流速控制在每秒1000个细胞以内,共收集20000个细胞。
9.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(5)包括:吸取0.5μm,0.8μm,1μm,3μm,6μm多种粒径规格标准微球各1μl,用无菌水1:100稀释后涡旋振荡,充分混匀后分别通过流式细胞仪进行测试,调节各个检测器的电压,直至在散点图(FSC,SSC)和散点图(FL1,SSC)上清晰可见,流速控制在每秒1000个细胞以内,共收集20000个细胞。
10.根据权利要求1-9任一项所述的方法,其特征在于,步骤(6)所述的流式细胞仪分析软件采用Becton Dickinson公司开发的CellQuest软件,记录下多种标准粒径微球前向散射光(FSC)信号数据, 建立标准微球粒径与FSC值的关系,绘制细菌大小的标准曲线,建立回归分析方程,计算相关系数,再通过样品中异养细菌的前向散射光FSC值,换算成异养细菌的大小。
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