[发明专利]用于克隆高粱可溶性酸性转化酶基因SAI-1的方法在审
申请号: | 201510226802.9 | 申请日: | 2015-05-06 |
公开(公告)号: | CN104805102A | 公开(公告)日: | 2015-07-29 |
发明(设计)人: | 李桂英;钟海丽;王智;刘洋;聂元冬;顿宝庆 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
主分类号: | C12N15/56 | 分类号: | C12N15/56;C12N15/11 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 吴泳历 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 克隆 高粱 可溶性 酸性 转化 基因 sai 方法 | ||
1.用于克隆高粱可溶性酸性转化酶基因SAI-1的引物,其核苷酸序列为:
SAIA-F/SAIA-R:CCTCCCATCCTTGATTCTCTT/TTGGGATCGTTCATCCAGTTC;
SAIP-F/SAIP-R:GTGGAGCAATGCGATGCTGC/CAGCATCAGATGTCCGTGACC。
2.用于克隆高粱可溶性酸性转化酶基因SAI-1前半段序列的引物,其核苷酸序列为:
SAIA-F/SAIA-R:CCTCCCATCCTTGATTCTCTT/TTGGGATCGTTCATCCAGTTC。
3.用于克隆高粱可溶性酸性转化酶基因SAI-1后半段序列的引物,其核苷酸序列为:
SAIP-F/SAIP-R:GTGGAGCAATGCGATGCTGC/CAGCATCAGATGTCCGTGACC。
4.用于克隆高粱可溶性酸性转化酶基因SAI-1的方法,包括如下步骤:
(1)以待测高粱品种为材料,提取样品基因组DNA;
(2)采用权利要求2所述的引物SAIA-F/SAIA-R,以样品基因组DNA为模板进行PCR反应A,获得扩增产物;若扩增产物中出现大小为635bp片段,则回收、克隆、测序该635bp片段,即SAI-1基因的前段;
(3)采用权利要求3所述的引物SAIP-F/SAIP-R,以样品基因组DNA为模板进行PCR反应B,获得扩增产物;若扩增产物中出现大小为3232~3412bp之间的单一片段,则回收、克隆、测序所述单一片段,为SAI-1基因的后段;
(4)将获得的所述SAI-1基因的前段和所述SAI-1基因的后段进行序列拼接,获得待测高粱品种的可溶性酸性转化酶基因全长。
5.根据权利要求4所述的方法,所述PCR反应A的体系为:反应的总体积50μl,其中2×PCR Buffer for KOD FX 25μl,2mmol/L dNTPs 10μl,ddH2O 10μl,10μmol/L引物SAIA-F/SAIA-R各1.5μl,KOD FX 1μl,样品基因组DNA 1μl。
6.根据权利要求4或5所述的方法,所述PCR反应A的程序为:94℃预变性2min;98℃10s,61℃30s,68℃30s,30个循环;68℃延伸10min。
7.根据权利要求4所述的方法,所述PCR反应B的体系为:反应的总体积50μl,其中2×PCR Buffer for KOD FX 25μl,2mmol/L dNTPs 10μl,ddH2O 10μl,10μmol/L引物SAIP-F/SAIP-R各1.5μl,KOD FX 1μl,样品基因组DNA 1μl。
8.根据权利要求6或7所述的方法,所述PCR反应B的程序为:94℃预变性2min;98℃10s,60℃30s,68℃3m30s,30个循环;68℃延伸10min。
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